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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G255530
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 63892481-63895875 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2727 bp · TkA07G255530|TK1151|cDNA

GTAATTCACCGTTTTTCCCACACCACAGTTTCAGCTCATTCAATTCCTAGAAGGCCCTCTCTCTCCTCCACTCTGGTCAAACACAATTCTATAGATTCCCAAAATCTCGTTGGGTTCTGCATTGTGATCGATCAATTCACATACAAATGCATCTTTATATTCATCACAGAAGGGTTCTAAATTTAGCAGCCACAAGAAAAAAACCACAGTTTTTGAAGTAAAAATGCAAGGAATCCATCTGGGTATCGGTCTATCTTCGT...

CDS

下载 CDS FASTA

2187 bp · TkA07G255530|TK1151|CDS

ATGGACTTCATGAAAGAGAAGCAAGTCAGGTTTTACCCCGGCGAAAATGGAAAGTCAAACTTCGAACACTCATGGAAAATCCCCGAAAAACAATTACCAGACCACAAGATCTCAGCTCCATTGTTGATCAATGGTGGTAAAAGTCATATGGGTATTAAATTGGGGAAATCGAGAGTTCACCCAGAAGAAATCACCAATTTAAACGGCAAAAGGATTTTGGATCCTGGAAGTGAAGTTATCTTACAATGGAACAGAATGTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

728 aa · TkA07G255530|TK1151|PROTEIN

MDFMKEKQVRFYPGENGKSNFEHSWKIPEKQLPDHKISAPLLINGGKSHMGIKLGKSRVHPEEITNLNGKRILDPGSEVILQWNRMFLFSCLVALFVDPLFFYLPSAQNNGGSSCMLSDLNLGIVVTCLRTIADVFYMLHIFIKFRTAYVSPSSRVLGRGELVMDPEKIARRYLKSDFFIDLVATLPLPQIVIWFIIPAIRTQHADHTTNALGLIVLLQYIPRFYLIFPLSSQIIKATGVFTKTAWAGAAYNLVLYMLAS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G255530
TK1151 IDTkA07G255530
OH-1004 IDLXL04_028971
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G255530
位置Chr07:63892481-63895875 (-)
描述Similar to CNGC14: Probable cyclic nucleotide-gated ion channel 14
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g24610 可能的环核苷酸门控离子通道。 暂无已核实直接文献
At4g30360 可能的环核苷酸门控离子通道。
Phytosulfokine Regulates Growth in Arabidopsis through a Response Module at the Plasma Membrane That Includes CYCLIC NUCLEOTIDE-GATED CHANNEL17, H+-ATPase, and BAK1.2015 · DOI: 10.1105/tpc.15.00306
At5g14870 花粉管定向生长到传播道所需的环状核苷酸门控离子通道。
A cyclic nucleotide-gated channel is essential for polarized tip growth of pollen.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0701781104
Cyclic nucleotide-gated channel 18 is an essential Ca2+ channel in pollen tube tips for pollen tube guidance to ovules in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1073/pnas.1524629113
At3g48010 推定环核苷酸门控离子通道。 暂无已核实直接文献
At2g28260 推定环核苷酸门控离子通道。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028971 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006874 intracellular calcium ion homeostasis 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0051592 response to calcium ion 生物过程
GO:0070588 calcium ion transmembrane transport 生物过程
GO:0071249 cellular response to nitrate 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016324 apical plasma membrane 细胞组分
GO:0030659 cytoplasmic vesicle membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G24610
ath:AT2G28260
ath:AT3G48010
ath:AT4G30360
ath:AT5G14870
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.884
排名 1 · TkA07G255530 · TK1151
细胞质0.085
排名 2 · TkA07G255530 · TK1151
内质网0.059
排名 3 · TkA07G255530 · TK1151
细胞核0.028
排名 4 · TkA07G255530 · TK1151
溶酶体／液泡0.024
排名 5 · TkA07G255530 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00520Ion_trans83-408 aa
PF18215Rtt106_N427-441 aa
PF18215Rtt106_N455-469 aa
PF00027cNMP_binding504-591 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G255530PF00520Ion_trans834084.6e-2175.8
TkA07G255530PF18215Rtt106_N4274410.06213.9
TkA07G255530PF18215Rtt106_N4554690.06213.9
TkA07G255530PF00027cNMP_binding5045911.1e-0629.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SJA4拟南芥sp|Q9SJA4|CNG14_ARATH Probable cyclic nucleotide-gated ion channel 1465.500%Swiss-Prot高置信
Q8L7Z0拟南芥sp|Q8L7Z0|CNG17_ARATH Cyclic nucleotide-gated ion channel 1763.900%Swiss-Prot高置信
Q9LEQ3拟南芥sp|Q9LEQ3|CNG18_ARATH Cyclic nucleotide-gated ion channel 1859.900%Swiss-Prot高置信
Q9SU64拟南芥sp|Q9SU64|CNG16_ARATH Probable cyclic nucleotide-gated ion channel 1659.400%Swiss-Prot高置信
Q9SL29拟南芥sp|Q9SL29|CNG15_ARATH Putative cyclic nucleotide-gated ion channel 1559.000%Swiss-Prot高置信

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