TkA07G255520 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G255520

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 63884654-63889578 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1903 bp · TkA07G255520|TK1151|cDNA

TTCAAATGCACACCAAACATCCCTATATTTATGGGTTAAATCCGGGAGGGCAGACCATTCTTACAGCGTTCATCACCTCAAAAGTAGACCGCAGAAATAGTGCGGTCTCTTTAGCTGTGGACTACTGTCTCTGCGTTCTCTCTAGGGTTTCCATCATTATTCAACTTAACTTGTATCTATCTCTGTAGAATCACATATCACATTCAAATGTATAGCGGTTCCAGTGATGGGGAAAGCCACGATACATCATCGGTGGCGTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1443 bp · TkA07G255520|TK1151|CDS

ATGTATAGCGGTTCCAGTGATGGGGAAAGCCACGATACATCATCGGTGGCGTCTAGGAAGCTTCCGCCGGCTTCTTCGATGCTGTGGGTCCGTAACCTCCGCCGTTACATCGGATCCGGTGCCGGTCTTGGCTCTGAAGCTTTAATGGAGCTTGAAACAAAAAGAATATTGCTTGATATCTTCAAGGAGAAGCAACAAAAGAGTGCTGAAGCTGGCACAATCCCAAGTTTCTATAAGAAGAAACCAGAGGATGGTTCCAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

480 aa · TkA07G255520|TK1151|PROTEIN

MYSGSSDGESHDTSSVASRKLPPASSMLWVRNLRRYIGSGAGLGSEALMELETKRILLDIFKEKQQKSAEAGTIPSFYKKKPEDGSISSRVQRLAKFRFLKKQSDQLLNADDLDAMWVCLRENCVIDDATGAEKMNYEDFCHIASVCTEQIGPKCRRFFSPSNFMKFEKDESGRIAILPFYLYVMRTVSLTQARIDMSELDEDSDGFLLPHEMENYIRGLIPNLAQLRDMPGTFVQMYCRIAAPKFFFFCDPNRRGKACI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G255520`
TK1151 ID	TkA07G255520
OH-1004 ID	LXL04_028970
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G255520

位置 Chr07:63884654-63889578 (-)

描述 Similar to TON2: Probable serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B'' subunit TON2

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g18580`	可能参与皮质细胞骨架动态组织控制的 2A 型蛋白磷酸酶调节亚基。	The Arabidopsis TONNEAU2 gene encodes a putative novel protein phosphatase 2A regulatory subunit essential for the control of the cortical cytoskeleton.2002 · DOI: 10.1105/tpc.010402 TONNEAU2/FASS regulates the geometry of microtubule nucleation and cortical array organization in interphase Arabidopsis cells.2012 · DOI: 10.1105/tpc.111.094367

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028970 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000226 microtubule cytoskeleton organization 生物过程

GO:0000913 preprophase band assembly 生物过程

GO:0002759 regulation of antimicrobial humoral response 生物过程

GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程

GO:0030865 cortical cytoskeleton organization 生物过程

GO:0032147 activation of protein kinase activity 生物过程

GO:0035303 regulation of dephosphorylation 生物过程

GO:0051900 regulation of mitochondrial depolarization 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G18580

bta:533147

hsa:55012

mmu:59032

rno:362739

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.613

排名 1 · TkA07G255520 · TK1151

细胞核0.253

排名 2 · TkA07G255520 · TK1151

细胞膜0.238

排名 3 · TkA07G255520 · TK1151

线粒体0.077

排名 4 · TkA07G255520 · TK1151

高尔基体0.075

排名 5 · TkA07G255520 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13202EF-hand_584-88 aa

PF10591SPARC_Ca_bdg87-125 aa

PF13405EF-hand_697-114 aa

PF17958EF-hand_1397-116 aa

PF13499EF-hand_798-144 aa

PF25578EF-hand_STIM1100-117 aa

PF13833EF-hand_8101-116 aa

PF00219IGFBP118-157 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G255520	`PF13202`	EF-hand_5	84	88	1.8e-05	24.7
TkA07G255520	`PF10591`	SPARC_Ca_bdg	87	125	0.036	15.1
TkA07G255520	`PF13405`	EF-hand_6	97	114	1.3e-09	37.6
TkA07G255520	`PF17958`	EF-hand_13	97	116	0.0094	16.4
TkA07G255520	`PF13499`	EF-hand_7	98	144	3.6e-09	37.5
TkA07G255520	`PF25578`	EF-hand_STIM1	100	117	1.3	9.8
TkA07G255520	`PF13833`	EF-hand_8	101	116	2e-05	24.9
TkA07G255520	`PF00219`	IGFBP	118	157	0.28	12.6
TkA07G255520	`PF00036`	EF-hand_1	134	143	2.3e-09	36.9
TkA07G255520	`PF13405`	EF-hand_6	164	175	1.3e-09	37.6
TkA07G255520	`PF00036`	EF-hand_1	164	175	2.3e-09	36.9
TkA07G255520	`PF13499`	EF-hand_7	166	175	3.6e-09	37.5
TkA07G255520	`PF13833`	EF-hand_8	194	206	2e-05	24.9
TkA07G255520	`PF00036`	EF-hand_1	197	218	2.3e-09	36.9
TkA07G255520	`PF10591`	SPARC_Ca_bdg	197	221	0.036	15.1
TkA07G255520	`PF13499`	EF-hand_7	198	225	3.6e-09	37.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FEE2`	拟南芥	sp\|Q9FEE2\|TON2_ARATH Probable serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B'' subunit TON2	89.800%	Swiss-Prot	高置信

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