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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G252650
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 63041437-63045693 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

721 bp · TkA07G252650|TK1151|cDNA

TTGATGAGGGATCTTCCGTTCTCTGGACATGAGATGCTACAGGAACTTGAGAAAATAGTTCAAAAATTTGAGGAGAAGCTTTTTACTACTGCAACAAGCCAGTCTGCTTATTTGCGGTGTATATCGGTGAATATATTGAATGTGACAAGGAGATCACAAAATCCCGTGCCAGATGTAATGCAGTCAAACTCTGGTTCTGATAGTGTAACCCCCTCAGAAGAAGGTTCTTAGGTGATGCAGCTTTTGTCACGGATCTTGCA...

CDS

下载 CDS FASTA

327 bp · TkA07G252650|TK1151|CDS

ATGCAGCTTTTGTCACGGATCTTGCACAACATCGGTTCAACTGGAATGCAGGAAAATGGCGACTCCTCTATGGTATCTAGTGATTGGAGGGATCAGCTTCAAGCAGATTCACGGCAATGGATTGTGAATAAGATAATGGATACCTTGAAGAGGCATCTTTCATTCTCTCACCGTGAGATGCAACAGGAAATTGAGAAAATGGCCGTGAGCTTTGAAGAGAAGATTTATACTGCTGCAACAAGCCAGTCTGATTATATGCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

108 aa · TkA07G252650|TK1151|PROTEIN

MQLLSRILHNIGSTGMQENGDSSMVSSDWRDQLQADSRQWIVNKIMDTLKRHLSFSHREMQQEIEKMAVSFEEKIYTAATSQSDYMRKIFIKVPTMETSTSQSVADLA

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G252650
TK1151 IDTkA07G252650
OH-1004 IDLXL04_028941
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 29.189
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G252650
位置Chr07:63041437-63045693 (+)
描述Similar to MED15A: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15a
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g15780 介体复合物的组成部分，是参与几乎所有 RNA 聚合酶 II 依赖性基因的转录调节的共激活剂。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028941 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0045723 positive regulation of fatty acid biosynthetic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0016592 mediator complex 细胞组分
GO:0003713 transcription coactivator activity 分子功能
GO:0031490 chromatin DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G15780
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.826
排名 1 · TkA07G252650 · TK1151
细胞质0.287
排名 2 · TkA07G252650 · TK1151
细胞膜0.036
排名 3 · TkA07G252650 · TK1151
内质网0.022
排名 4 · TkA07G252650 · TK1151
线粒体0.020
排名 5 · TkA07G252650 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF09606Med15_N5-23 aa
PF02172KIX26-94 aa
PF16987KIX_227-104 aa
PF09606Med15_N27-96 aa
PF09786CytochromB561_N27-69 aa
PF22944DGKD_4H32-68 aa
PF28865REX3_N37-86 aa
PF30408RcsD_peri37-89 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G252650PF09606Med15_N5230.0002821.3
TkA07G252650PF02172KIX26940.009816.9
TkA07G252650PF16987KIX_2271049.8e-2793.4
TkA07G252650PF09606Med15_N27960.0002821.3
TkA07G252650PF09786CytochromB561_N27690.00915.7
TkA07G252650PF22944DGKD_4H32680.04714.7
TkA07G252650PF28865REX3_N37860.0005920.8
TkA07G252650PF30408RcsD_peri37890.0713.9
TkA07G252650PF24151ArlX42860.02914.6
TkA07G252650PF19130DUF5813511060.01515.9
TkA07G252650PF22944DGKD_4H631070.04714.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4I171拟南芥sp|F4I171|MD15A_ARATH Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15a51.100%Swiss-Prot高置信

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