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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G243170
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 60688623-60693391 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1399 bp · TkA07G243170|TK1151|cDNA

GTTGACGAATAAAAAACCTTATCTCAGTTATTCCATCTCAGCCTCTAAATATGAAAATGCAATTTTAGTTATTATTAAAATAAAAATCCAGGAACCCAAAGCACTCGGAAAACATGTTGGCGAAAGAATCGCTTGGTGCGAGCTTCGATCTTCCCCAGGAGGTCCTGGAGGTTTTACCTCCTGATCCATTCCAGCAGCTCGATGTCGCCCGTAAAATCACCTCCCTTGCTCTCTCCACTCGCGTCTCCGCCCTCGAAACA...

CDS

下载 CDS FASTA

1023 bp · TkA07G243170|TK1151|CDS

ATGTTGGCGAAAGAATCGCTTGGTGCGAGCTTCGATCTTCCCCAGGAGGTCCTGGAGGTTTTACCTCCTGATCCATTCCAGCAGCTCGATGTCGCCCGTAAAATCACCTCCCTTGCTCTCTCCACTCGCGTCTCCGCCCTCGAAACAGAGTCCTCCGACCTCCGCCAACAGCTGACCGAGAGAGACGCTTTCATCGCTGACCTTCACTCTCAGCTTGATTCCCTTGACTCTTCTCTGTCCCAAAATCTCCACAAATTGTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

340 aa · TkA07G243170|TK1151|PROTEIN

MLAKESLGASFDLPQEVLEVLPPDPFQQLDVARKITSLALSTRVSALETESSDLRQQLTERDAFIADLHSQLDSLDSSLSQNLHKLSLADQEKENLLRENASLLETVNKLKRDVAKLESFRKTLMMSLQDEEGSATTGPSVVTSNVQNHSSLSSQTFSGEDDETLPPSSASSIKSQASGIANSYHDEPAKEASKPPCISPSLLLASQTSTPRLTPPGSPPTLSASASPTRTPKPVSPRRHSISVTSTRAFDDRSSVFSSA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G243170
TK1151 IDTkA07G243170
OH-1004 IDLXL04_028864
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G243170
位置Chr07:60688623-60693391 (+)
描述Similar to At4g15545: Uncharacterized protein At4g15545
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g15545 未表征蛋白At4g15545。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028864 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0080119 ER body organization 生物过程
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0010168 ER body 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G15545
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.735
排名 1 · TkA07G243170 · TK1151
细胞核0.253
排名 2 · TkA07G243170 · TK1151
高尔基体0.086
排名 3 · TkA07G243170 · TK1151
细胞膜0.069
排名 4 · TkA07G243170 · TK1151
溶酶体／液泡0.065
排名 5 · TkA07G243170 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02601Exonuc_VII_L27-129 aa
PF25802WWC127-78 aa
PF27405Lin0124_C30-63 aa
PF05549Allexi_40kDa32-94 aa
PF01895PhoU35-112 aa
PF08614ATG1636-105 aa
PF25450Rab11-FIP336-93 aa
PF27605ODF2_C38-129 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G243170PF02601Exonuc_VII_L271290.769.9
TkA07G243170PF25802WWC127781.49.6
TkA07G243170PF27405Lin0124_C30632.19.3
TkA07G243170PF05549Allexi_40kDa32947.56.7
TkA07G243170PF01895PhoU351120.6611.1
TkA07G243170PF08614ATG16361050.02815.3
TkA07G243170PF25450Rab11-FIP336930.6211.1
TkA07G243170PF27605ODF2_C381290.006916.3
TkA07G243170PF03961FapA381330.03214.6
TkA07G243170PF07558Shugoshin_N38610.05813.9
TkA07G243170PF25966Myo5a381162.48.9
TkA07G243170PF30378CEP135_TSGA10_CC391180.2610.3
TkA07G243170PF00170bZIP_139710.3311.8
TkA07G243170PF28968PMD1-like391180.6610.1
TkA07G243170PF10828DUF2570391191.410.1
TkA07G243170PF16046FAM76391121.68.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93W28拟南芥sp|Q93W28|Y4554_ARATH Uncharacterized protein At4g1554559.900%Swiss-Prot高置信

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