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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G131120
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 33885693-33888680 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2919 bp · TkA07G131120|TK1151|cDNA

CTTGAAAATACTCCACTCAATTAGCATAGTAGATCGGCAGTGGACGGCGGTGGGTGGGTGGGTGGTGGTGTTTGGATTAAACTAACATTGATGATAAATCGAAGCGGTTGAAAACTCTTTTTCCGACCATGGGGTTTGCTCTCTTGGGTTCAATTGTGGTTCTAACTCTGTTCTTTTGGTCAAACCTTGGTCAACAACAAGAACAGCACACACCCATTCCCAATACAGATGAGTTCTTCATCTTTGATTTCTTTCAAAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2565 bp · TkA07G131120|TK1151|CDS

ATGGGGTTTGCTCTCTTGGGTTCAATTGTGGTTCTAACTCTGTTCTTTTGGTCAAACCTTGGTCAACAACAAGAACAGCACACACCCATTCCCAATACAGATGAGTTCTTCATCTTTGATTTCTTTCAAAAAATGGGTGCAATGAATTCGTCTTCTTTTTCTCATGTTTACAATTTTTCATCCCCCTTTTGTTCATCGCAAATTGTTTTCTGTGATGCCAATCAAGAACATGTCGTAGGTCTAAATGCTCGTAATTTGGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

854 aa · TkA07G131120|TK1151|PROTEIN

MGFALLGSIVVLTLFFWSNLGQQQEQHTPIPNTDEFFIFDFFQKMGAMNSSSFSHVYNFSSPFCSSQIVFCDANQEHVVGLNARNLGLSGSIPDNTIGKLTKLQSLDLSNNQIVNLPDDFWSLGSLKTLNLSNNKISMNLPSNIGNFGSLEILDLSVNNFFGSFPESISSLISLQVLNLNRNGFESTVPLGIVSCKSLISLDFSSNGFNGSLPDGFGSSFPKLKSLNLAGNAMRGSVVEIFRESLEVVDLSSNHIEGHIS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G131120
TK1151 IDTkA07G131120
OH-1004 IDLXL04_028213
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G131120
位置Chr07:33885693-33888680 (-)
描述Similar to At2g24230: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g24230
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g24230 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g24230。 暂无已核实直接文献
At5g58150 可能是非活性富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At5g58150。 暂无已核实直接文献
At5g45800 体外可磷酸化髓磷脂碱性蛋白。
A receptor-like kinase from Arabidopsis thaliana is a calmodulin-binding protein.2004 · DOI: 10.1042/bj20031045

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os09g0293500 可能参与根部的油菜素类固醇 感知。
The role of OsBRI1 and its homologous genes, OsBRL1 and OsBRL3, in rice.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.072330
Os08g0342300 可能参与根部的油菜素类固醇 感知。
The role of OsBRI1 and its homologous genes, OsBRL1 and OsBRL3, in rice.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.072330
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028213 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0010234 anther wall tapetum cell fate specification 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0019199 transmembrane receptor protein kinase activity 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G24230
ath:AT5G07280
ath:AT5G58150
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.854
排名 1 · TkA07G131120 · TK1151
内质网0.090
排名 2 · TkA07G131120 · TK1151
细胞质0.072
排名 3 · TkA07G131120 · TK1151
细胞核0.059
排名 4 · TkA07G131120 · TK1151
溶酶体／液泡0.028
排名 5 · TkA07G131120 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12799LRR_481-117 aa
PF00560LRR_181-94 aa
PF23211LRR_LRWD188-162 aa
PF13855LRR_891-136 aa
PF14580LRR_994-182 aa
PF27087LRR_TMOD-LMOD94-139 aa
PF23598LRR_1495-155 aa
PF25013LRR_Zer-197-167 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G131120PF12799LRR_4811173.9e-30103.9
TkA07G131120PF00560LRR_181942.8e-2892.6
TkA07G131120PF23211LRR_LRWD1881626.5e-0626.7
TkA07G131120PF13855LRR_8911362e-2692.2
TkA07G131120PF14580LRR_9941828e-0523.0
TkA07G131120PF27087LRR_TMOD-LMOD941391.98.8
TkA07G131120PF23598LRR_14951551.9e-1867.1
TkA07G131120PF25013LRR_Zer-1971676.4e-0730.3
TkA07G131120PF23952LRR_EndoS971341.6e-0525.8
TkA07G131120PF25019LRR_R13L1-DRL21981330.0514.2
TkA07G131120PF13516LRR_61001131e-1454.0
TkA07G131120PF24048LRR_NXF1-51001672.4e-0524.7
TkA07G131120PF29594LRR_SKP21001860.002517.8
TkA07G131120PF12799LRR_41011373.9e-30103.9
TkA07G131120PF24758LRR_At5g563701011566.6e-0626.7
TkA07G131120PF00560LRR_11021232.8e-2892.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGK9拟南芥sp|C0LGK9|Y2242_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g2423063.800%Swiss-Prot高置信
Q9LVN2拟南芥sp|Q9LVN2|Y5815_ARATH Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g5815052.900%Swiss-Prot高置信
Q9FK63拟南芥sp|Q9FK63|CARLK_ARATH Calmodulin-binding receptor kinase CaMRLK38.600%Swiss-Prot低置信
Q69JN6水稻sp|Q69JN6|BRL1_ORYSJ Brassinosteroid LRR receptor kinase BRL138.500%Swiss-Prot低置信
Q6ZCZ2水稻sp|Q6ZCZ2|BRL3_ORYSJ Brassinosteroid LRR receptor kinase BRL334.200%Swiss-Prot中等置信

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