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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA07G126750
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 32757408-32770641 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1944 bp · TkA07G126750|TK1151|cDNA

CTATAATACAAAAAAGGGATATTTAGTTCGCAAACCAAGATGACATCTGTTTTGGTCACTTGATGATTTCAAGTACTCTCAACCAACAACATAACAAATTGCAATTATTGAATCATTTAAACCCCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACAAGAGTTCTTGGGGTTTTTGCGAAGATGGCAGGGGGGTCTTTGGCACCAGTGGGAGTGGCGAAGGAGAGAGCAGATCAATATCAAGGAAAAGTCACCACTTATG...

1569 bp · TkA07G126750|TK1151|CDS

ATGGCAGGGGGGTCTTTGGCACCAGTGGGAGTGGCGAAGGAGAGAGCAGATCAATATCAAGGAAAAGTCACCACTTATGTCATCGTTGCTTGCATTGTTGCTGCCGTTGGAGGCTCTATTTTTGGCTACGATATAGGAATTTCAGGAGGGGTAGCATCCATGGACGCATTCCTCAAAAAATTCTTCCCATCTGTCTATGAAAAGAAGTCGCATTCCCACGAAAGCAACTACTGCAAGTTCAACGATCAAGGTCTAGCAGC...

522 aa · TkA07G126750|TK1151|PROTEIN

MAGGSLAPVGVAKERADQYQGKVTTYVIVACIVAAVGGSIFGYDIGISGGVASMDAFLKKFFPSVYEKKSHSHESNYCKFNDQGLAAFTSSLYLAGLVATLFASPVTRNYGRRISIICGGISFLVGAALNAAAINFAMLLSGRIMLGIGIGFGNQAIPLYLSEMAPTHLRGGLNMMFQLATTLGIFSANMINFGTSRLDQWGWRLSLGLAAIPALLMTIGGILLPETPNSLIEQGSKEKGRKVLERIRGTQNVDAEFEDM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G126750
TK1151 IDTkA07G126750
OH-1004 IDLXL04_002514
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)59.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.743 / OH-1004 97.864
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G126750
位置Chr07:32757408-32770641 (+)
描述Similar to STP14: Sugar transport protein 14
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g02050 可能通过糖/氢共转运介导己糖的主动摄取。 暂无已核实直接文献
At5g26340 可能通过糖/氢共转运介导己糖的主动摄取。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0218400 介导通过糖:质子共转运的果糖主动摄取(可能)。
Os07g0106200 通过糖:质子协同介导对己糖的主动摄取。
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_002514 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0015749 monosaccharide transmembrane transport 生物过程
GO:0042882 L-arabinose transmembrane transport 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0012505 endomembrane system 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G77210
ath:AT4G02050
ath:AT5G26340
dosa:Os03g0218400
osa:4332079
rcu:8262851
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞膜0.844
排名 1 · TkA07G126750 · TK1151
细胞质0.104
排名 2 · TkA07G126750 · TK1151
内质网0.046
排名 3 · TkA07G126750 · TK1151
溶酶体/液泡0.035
排名 4 · TkA07G126750 · TK1151
线粒体0.034
排名 5 · TkA07G126750 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17272DUF533713-52 aa
PF00083Sugar_tr31-485 aa
PF07690MFS_188-432 aa
PF06609TRI1290-168 aa
PF06609TRI12308-369 aa
PF07690MFS_1392-477 aa
PF17272DUF5337397-403 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G126750PF17272DUF533713520.2412.0
TkA07G126750PF00083Sugar_tr314859.2e-123411.2
TkA07G126750PF07690MFS_1884321.4e-2590.7
TkA07G126750PF06609TRI12901684.5e-0522.8
TkA07G126750PF06609TRI123083694.5e-0522.8
TkA07G126750PF07690MFS_13924771.4e-2590.7
TkA07G126750PF17272DUF53373974030.2412.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O04249拟南芥sp|O04249|STP7_ARATH Sugar transport protein 779.400%Swiss-Prot高置信
Q94AZ2拟南芥sp|Q94AZ2|STP13_ARATH Sugar transport protein 1359.400%Swiss-Prot高置信
Q10PW9水稻sp|Q10PW9|MST4_ORYSJ Sugar transport protein MST457.300%Swiss-Prot高置信
Q7EZD7水稻sp|Q7EZD7|MST3_ORYSJ Sugar transport protein MST358.200%Swiss-Prot高置信

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