基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA07G121000
当前版本: TK1151
染色体: Chr07
坐标: 31395192-31396517
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1173 bp · TkA07G121000|TK1151|cDNA
ATGAAAATTGTTTTTCTTGTCCTGATTGCACTTTTGTCATCATCAGCAACATCAAAAGTTACATACGATGTGACACGTTTTGGAGCAAAAGGAGACGGCAAGACAGACTCCACAAAATCCTTTCTCAGCGCTTGGTCTTCAGCATGTAATTTCACAAAGTCCGCCACCATCAACATCCCATCCGGCACCTTCTTGCTTGCAACCGCCATCACATTTGCCGGCGAAAGATGCAAAAGCAGTGCAATCACAATCCGCATCTA...
CDS
下载 CDS FASTA1173 bp · TkA07G121000|TK1151|CDS
ATGAAAATTGTTTTTCTTGTCCTGATTGCACTTTTGTCATCATCAGCAACATCAAAAGTTACATACGATGTGACACGTTTTGGAGCAAAAGGAGACGGCAAGACAGACTCCACAAAATCCTTTCTCAGCGCTTGGTCTTCAGCATGTAATTTCACAAAGTCCGCCACCATCAACATCCCATCCGGCACCTTCTTGCTTGCAACCGCCATCACATTTGCCGGCGAAAGATGCAAAAGCAGTGCAATCACAATCCGCATCTA...
390 aa · TkA07G121000|TK1151|PROTEIN
MKIVFLVLIALLSSSATSKVTYDVTRFGAKGDGKTDSTKSFLSAWSSACNFTKSATINIPSGTFLLATAITFAGERCKSSAITIRIYGTLVAPSEYNAIANSGDWIRFHRVNHVTISGGTLDAKGVALWSCKTAGKSCPKGATTLGIYNSQNIVISGLKSVNSQMFHILIDACTNVKLQGVSISASGVSPNTDGIHLISSTYVTILSSKIATGDDCISIGPGNTNLWIEKVACGPGHGISIGSLGWEMEEPGVQNITVST...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA07G121000 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA07G121000 |
| OH-1004 ID | LXL04_028094 |
| 关系 / 置信度 | 序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核 |
| 蛋白一致性 (%) | 99.200 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 95.641 / OH-1004 52.983覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA07G121000 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr07:31395192-31396517 (-) | ||||||||||||
| 描述 | Similar to Polygalacturonase | ||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0005975 carbohydrate metabolic process 生物过程 GO:0009555 pollen development 生物过程 GO:0009830 cell wall modification involved in abscission 生物过程 GO:0009835 fruit ripening 生物过程 GO:0009846 pollen germination 生物过程 GO:0009901 anther dehiscence 生物过程 GO:0010047 fruit dehiscence 生物过程 GO:0010227 floral organ abscission 生物过程 GO:0045490 pectin catabolic process 生物过程 GO:0048868 pollen tube development 生物过程 GO:0071555 cell wall organization 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 | ||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G41850 ath:AT2G43860 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞外0.805
细胞质0.070
溶酶体／液泡0.045
内质网0.042
细胞膜0.041
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF12708Pect-lyase_RHGA_epim23-275 aaPF00295Glyco_hydro_2849-377 aaPF05048NosD85-213 aaPF18889Beta_helix_3114-125 aaPF13229Beta_helix131-225 aaPF13229Beta_helix253-383 aaPF21803Nab2-zf4300-315 aaPF05048NosD309-366 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA07G121000 | PF12708 | Pect-lyase_RHGA_epim | 23 | 275 | 4.4e-09 | 37.2 |
| TkA07G121000 | PF00295 | Glyco_hydro_28 | 49 | 377 | 1.4e-83 | 281.4 |
| TkA07G121000 | PF05048 | NosD | 85 | 213 | 0.011 | 16.0 |
| TkA07G121000 | PF18889 | Beta_helix_3 | 114 | 125 | 0.057 | 14.5 |
| TkA07G121000 | PF13229 | Beta_helix | 131 | 225 | 0.017 | 15.4 |
| TkA07G121000 | PF13229 | Beta_helix | 253 | 383 | 0.017 | 15.4 |
| TkA07G121000 | PF21803 | Nab2-zf4 | 300 | 315 | 2.1 | 8.9 |
| TkA07G121000 | PF05048 | NosD | 309 | 366 | 0.011 | 16.0 |
| TkA07G121000 | PF12708 | Pect-lyase_RHGA_epim | 328 | 358 | 4.4e-09 | 37.2 |
| TkA07G121000 | PF21803 | Nab2-zf4 | 341 | 346 | 2.1 | 8.9 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。