TkA07G109500 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G109500

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 28356366-28361464 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2206 bp · TkA07G109500|TK1151|cDNA

CCACCCAGTCTCGCAATTACTCGTAAACTTAAAATGAGGGATTTGGGCTTTTCCAAAAGATAGGTATAGCCGCCTTTTACAAACAACTCATCCGCGCAGTCTCGCAATTACCGAACACGCTCGACACATCTGCGATTCATCTCCGTCTGCTCGACATCTGCGACTCATCAGACATCTGCCCTCTGTATCCATCTTCAAAGCGCCATTAATGCCTTCGACCTACCTCTGAAGCGAACCCCATCCACCCGCCTCCATCTCCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1434 bp · TkA07G109500|TK1151|CDS

ATGTTGGCATTTGGATCCATGATTGGTAGGAAGTTTTCATCCGCTACTTCTCATCCATTGCGTGTTTGTGTGGTCGGCAGTGGTCCCGCCGGTTTTTACACCGCCGAAAAGATGTTGAAAGCACATGAAGGAGCAGAAGTTGACATCGTTGATAGACTCCCAACACCATTTGGATTGGTCCGTTCTGGTGTAGCTCCCGATCACCCTGAAACCAAGATTGTCATCAACCAATTCTCACGTGTTGCACATGACCAACGATG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

477 aa · TkA07G109500|TK1151|PROTEIN

MLAFGSMIGRKFSSATSHPLRVCVVGSGPAGFYTAEKMLKAHEGAEVDIVDRLPTPFGLVRSGVAPDHPETKIVINQFSRVAHDQRCSFFGNVSLGSSVSLSDLRQFYHVVVLAYGAESDRALGIPGEELKGIHSAREFVWWYNGHPDLSNMTLDLKNTDTAIVLGQGNVALDVARILLRSPAELATTDIATHALDALRESSIRKVYLVGRRGPVQAACTAKELREILAIKDLHINIKEADLVKNPADEEEMKNSRIRKR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G109500`
TK1151 ID	TkA07G109500
OH-1004 ID	LXL04_027959
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	98.500
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 81.818 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G109500

位置 Chr07:28356366-28361464 (-)

描述 Similar to MFDR: NADPH:adrenodoxin oxidoreductase, mitochondrial

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g32360`	在体外与肾上腺素还蛋白样蛋白 MFDX1 结合，形成有效的低电位电子传递链，能够还原细胞色素 C。	Identification and molecular characterization of mitochondrial ferredoxins and ferredoxin reductase from Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1023/a:1025015811141

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027959 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006091 generation of precursor metabolites and energy 生物过程

GO:0006124 ferredoxin metabolic process 生物过程

GO:0006694 steroid biosynthetic process 生物过程

GO:0006744 ubiquinone biosynthetic process 生物过程

GO:0008203 cholesterol metabolic process 生物过程

GO:0009102 biotin biosynthetic process 生物过程

GO:0022900 electron transport chain 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分

GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0004324 ferredoxin-NADP+ reductase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G32360

bta:282604

hsa:2232

rno:79122

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.744

排名 1 · TkA07G109500 · TK1151

细胞质0.237

排名 2 · TkA07G109500 · TK1151

细胞核0.139

排名 3 · TkA07G109500 · TK1151

过氧化物酶体0.038

排名 4 · TkA07G109500 · TK1151

质体0.035

排名 5 · TkA07G109500 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13241NAD_binding_720-52 aa

PF07992Pyr_redox_221-209 aa

PF01494FAD_binding_321-64 aa

PF00070Pyr_redox21-56 aa

PF03486HI0933_like21-53 aa

PF027373HCDH_N22-52 aa

PF05834Lycopene_cycl22-54 aa

PF13450NAD_binding_824-68 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G109500	`PF13241`	NAD_binding_7	20	52	0.05	14.9
TkA07G109500	`PF07992`	Pyr_redox_2	21	209	1.9e-09	38.1
TkA07G109500	`PF01494`	FAD_binding_3	21	64	0.0022	18.0
TkA07G109500	`PF00070`	Pyr_redox	21	56	0.018	16.3
TkA07G109500	`PF03486`	HI0933_like	21	53	0.019	15.2
TkA07G109500	`PF02737`	3HCDH_N	22	52	0.0033	18.1
TkA07G109500	`PF05834`	Lycopene_cycl	22	54	0.13	12.0
TkA07G109500	`PF13450`	NAD_binding_8	24	68	1.1e-05	26.4
TkA07G109500	`PF13454`	NAD_binding_9	24	59	0.019	15.6
TkA07G109500	`PF13241`	NAD_binding_7	155	187	0.05	14.9
TkA07G109500	`PF00070`	Pyr_redox	162	180	0.018	16.3
TkA07G109500	`PF02737`	3HCDH_N	163	268	0.0033	18.1
TkA07G109500	`PF05834`	Lycopene_cycl	244	293	0.13	12.0
TkA07G109500	`PF03486`	HI0933_like	262	308	0.019	15.2
TkA07G109500	`PF07992`	Pyr_redox_2	305	367	1.9e-09	38.1
TkA07G109500	`PF13241`	NAD_binding_7	397	416	0.05	14.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8W3L1`	拟南芥	sp\|Q8W3L1\|MFDR_ARATH NADPH:adrenodoxin oxidoreductase, mitochondrial	69.600%	Swiss-Prot	高置信

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