TkA07G095330 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G095330

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 24864416-24867155 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2305 bp · TkA07G095330|TK1151|cDNA

ATCACTTGATCTCACATCTTTTTCACGGCACTAACGTATGGCAAGGCGGAGAAGGGGCGGCGGAGGAGACTCGAGGAAACCAACAACTTCCGAGCATCAGTCTCCGCCTCAGGCTGGCAAGAAACCCCAACAGAATAGAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGCGAAAGAGAAGGAGAAAGAGAAAAAAACCGAGGATTACAATGACGCTGATCACCATGGTAGTAATCTTAAGAAATTCAAAAGGGACAAGAAGAATT...

CDS

下载 CDS FASTA

2097 bp · TkA07G095330|TK1151|CDS

ATGGCAAGGCGGAGAAGGGGCGGCGGAGGAGACTCGAGGAAACCAACAACTTCCGAGCATCAGTCTCCGCCTCAGGCTGGCAAGAAACCCCAACAGAATAGAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGCGAAAGAGAAGGAGAAAGAGAAAAAAACCGAGGATTACAATGACGCTGATCACCATGGTAGTAATCTTAAGAAATTCAAAAGGGACAAGAAGAATTGGTCATGTATAGACAGTTGTTGTTGGTTCATCGGATC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

698 aa · TkA07G095330|TK1151|PROTEIN

MARRRRGGGGDSRKPTTSEHQSPPQAGKKPQQNREKEKEKEKAKEKEKEKKTEDYNDADHHGSNLKKFKRDKKNWSCIDSCCWFIGSVCSIWWFLLFLYNAMPASFPQYVTTAITGIVPDPPGIKLQKEGLKAKHPVVFVPGIVTGGLELWEGHPCMDGLFRKRLWGGTFGELYKRPLCWVEHMSLDNETGLDPPGIRIRPVSGLVAADYFAAGYFVWAVLIANLASIGYEEKNMYMAAYDWRLSFQNTEVRDQTLSRMK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G095330`
TK1151 ID	TkA07G095330
OH-1004 ID	LXL04_027807
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	97.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 99.284 / OH-1004 95.423 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G095330

位置 Chr07:24864416-24867155 (+)

描述 Similar to PDAT1: Phospholipid:diacylglycerol acyltransferase 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g13640`	通过酰基辅酶A独立途径形成三酰基甘油。	Cloning and functional characterization of a phospholipid:diacylglycerol acyltransferase from Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.044354 DGAT1 and PDAT1 acyltransferases have overlapping functions in Arabidopsis triacylglycerol biosynthesis and are essential for normal pollen and seed development.2009 · DOI: 10.1105/tpc.109.071795 DGAT1, DGAT2 and PDAT expression in seeds and other tissues of epoxy and hydroxy fatty acid accumulating plants.2010 · DOI: 10.1007/s11745-010-3385-4
`At3g44830`	推定的磷脂:二酰甘油酰基转移酶 2。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027807 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006071 glycerol metabolic process 生物过程

GO:0006629 lipid metabolic process 生物过程

GO:0006672 ceramide metabolic process 生物过程

GO:0010150 leaf senescence 生物过程

GO:0016127 sterol catabolic process 生物过程

GO:0019432 triglyceride biosynthetic process 生物过程

GO:0019915 lipid storage 生物过程

GO:0046339 diacylglycerol metabolic process 生物过程

GO:0055091 phospholipid homeostasis 生物过程

GO:0140042 lipid droplet formation 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G04010

ath:AT3G44830

ath:AT5G13640

sce:YNR008W

spo:2541187

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.446

排名 1 · TkA07G095330 · TK1151

内质网0.209

排名 2 · TkA07G095330 · TK1151

溶酶体／液泡0.180

排名 3 · TkA07G095330 · TK1151

细胞质0.088

排名 4 · TkA07G095330 · TK1151

细胞膜0.067

排名 5 · TkA07G095330 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02377Dishevelled4-65 aa

PF03154Atrophin-128-54 aa

PF13054DUF391529-54 aa

PF02450LCAT110-133 aa

PF02450LCAT161-658 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G095330	`PF02377`	Dishevelled	4	65	0.81	10.7
TkA07G095330	`PF03154`	Atrophin-1	28	54	10.0	4.8
TkA07G095330	`PF13054`	DUF3915	29	54	5.5	7.7
TkA07G095330	`PF02450`	LCAT	110	133	1.1e-66	226.5
TkA07G095330	`PF02450`	LCAT	161	658	1.1e-66	226.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FNA9`	拟南芥	sp\|Q9FNA9\|PDAT1_ARATH Phospholipid:diacylglycerol acyltransferase 1	75.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q9FYC7`	拟南芥	sp\|Q9FYC7\|PDAT2_ARATH Putative phospholipid:diacylglycerol acyltransferase 2	58.500%	Swiss-Prot	高置信

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