基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA07G094860
当前版本: TK1151
染色体: Chr07
坐标: 24756445-24758191
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA526 bp · TkA07G094860|TK1151|cDNA
CGGGGCTATGACTGTCAAATCTACAATCTACATTCTTTCTCAATCCTTCTCCCCTCTCACTTTCTCTCTCTAAATTTTCGAAGCAATTCCGTTCACAGATTCAGTCAATCCTCCATATATTTTCTGTGCAATTCCTCTGTTTGGTGACTAGAATGCTCCTAGATTTTCAAGGATTGAACTGGATTTGATGACAAGATTGATGGATGAGGGTAATCTATATGGAGGAATGGGAAATCGTGGGATTAAGTTAGATGGGAAAA...
CDS
下载 CDS FASTA339 bp · TkA07G094860|TK1151|CDS
ATGACAAGATTGATGGATGAGGGTAATCTATATGGAGGAATGGGAAATCGTGGGATTAAGTTAGATGGGAAAATGTTGCATACATTTCAAAAGAGTTTTGTTCATGTTCAAAACATATTGGATCAAAACAGATTATTGATCAACGAGATCAATCAAAATCATGAGTCAAAGATTCCTGATAATCTAGGTAGAAATGTGGGTTTGATTAGAGAACTCAACAACAATATAAGAAAAGTGCTTGATCTTTATTCATATCTTTC...
113 aa · TkA07G094860|TK1151|PROTEIN
MTRLMDEGNLYGGMGNRGIKLDGKMLHTFQKSFVHVQNILDQNRLLINEINQNHESKIPDNLGRNVGLIRELNNNIRKVLDLYSYLSSNVTKSMDVNDSCDGDSRLDTKKRTR
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA07G094860 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA07G094860 |
| OH-1004 ID | LXL04_027803 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / Strict |
| 蛋白一致性 (%) | 98.000 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 88.496 / OH-1004 98.039覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA07G094860 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr07:24756445-24758191 (-) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to EFL3: Protein ELF4-LIKE 3 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000122 negative regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程 GO:0009585 red, far-red light phototransduction 生物过程 GO:0009648 photoperiodism 生物过程 GO:0009649 entrainment of circadian clock 生物过程 GO:0009908 flower development 生物过程 GO:0009909 regulation of flower development 生物过程 GO:0010017 red or far-red light signaling pathway 生物过程 GO:0010114 response to red light 生物过程 GO:0042752 regulation of circadian rhythm 生物过程 GO:0042753 positive regulation of circadian rhythm 生物过程 GO:0048511 rhythmic process 生物过程 GO:0048573 photoperiodism, flowering 生物过程 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G17455 ath:AT1G72630 ath:AT2G06255 ath:AT2G29950 ath:AT2G40080 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.554
细胞质0.443
溶酶体／液泡0.050
线粒体0.043
细胞膜0.039
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF07011Elf421-98 aaPF05289BLYB32-63 aaPF05377FlaC_arch46-52 aaPF05377FlaC_arch69-90 aaPF05289BLYB73-95 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA07G094860 | PF07011 | Elf4 | 21 | 98 | 4.1e-36 | 123.5 |
| TkA07G094860 | PF05289 | BLYB | 32 | 63 | 0.038 | 14.9 |
| TkA07G094860 | PF05377 | FlaC_arch | 46 | 52 | 0.044 | 14.9 |
| TkA07G094860 | PF05377 | FlaC_arch | 69 | 90 | 0.044 | 14.9 |
| TkA07G094860 | PF05289 | BLYB | 73 | 95 | 0.038 | 14.9 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q8S8F5 | 拟南芥 | sp|Q8S8F5|EF4L3_ARATH Protein ELF4-LIKE 3 | 68.400% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q570U6 | 拟南芥 | sp|Q570U6|EF4L4_ARATH Protein ELF4-LIKE 4 | 68.500% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q94BS8 | 拟南芥 | sp|Q94BS8|EF4L2_ARATH Protein ELF4-LIKE 2 | 68.500% | Swiss-Prot | 高置信 |
O80877 | 拟南芥 | sp|O80877|EF4L1_ARATH Protein ELF4-LIKE 1 | 50.000% | Swiss-Prot | 中等置信 |
O04211 | 拟南芥 | sp|O04211|ELF4_ARATH Protein EARLY FLOWERING 4 | 44.300% | Swiss-Prot | 中等置信 |