RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G094450
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 24644410-24647275 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1513 bp · TkA07G094450|TK1151|cDNA

TTTGAGCAATACCCATTTTGTTTACTGTCCCCATCATTTCATTCTTCAACACAGTCGATCCCACAAAGGTGTTCCGGTAATCTGAAAGAAAGGTGTATTAAGGCCGGAAATCTGCCAGCCATAGATGATCATGTCATCGGACCGGCACGCTGCCTCTAATTCTGCCTCTCCCCAAGACAACAACCTATTTCTTGATATATCAAACGAGGCTCCTTTATCTGGACAACGTAAACGCACAGGCATCATGGGTAGCATTTTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

777 bp · TkA07G094450|TK1151|CDS

ATGGTTTACCAAGTCAAGAAAATCAGATTACAGGGTTACTATATTTTTAGTCAAAAATTGAAGCATATTATTCGTCTACCATTTGCCACTATGTCATATGGTACTTGTGCAATGTTACTGGTGATGGTTTGGGAACCCAATATAAGCATCCTTCCAATTTCCATGTTACTCAGGATTATCATGGTGGCTGAAGTTATCTTTGCTGGCTCTTTCATGAGTGTCTATATCGGTAATGTTCATCAGTACAATTCATTGGAATC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

258 aa · TkA07G094450|TK1151|PROTEIN

MVYQVKKIRLQGYYIFSQKLKHIIRLPFATMSYGTCAMLLVMVWEPNISILPISMLLRIIMVAEVIFAGSFMSVYIGNVHQYNSLESQPDVLKSLYSPLQPSSSLEGLSYYDGGRLSDQQMALLQYQQENLNFLSEEILRLQECLSKYERSSDGVTPQVDLAYLLAARDQELRTLSAEMNQMQSELRLARSLIGERDSEIQRVHTTNNQYVEENERLRGILGEWSSRAAKLERALEGERMSNMEFHKRTTAPKGRSPP

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G094450
TK1151 IDTkA07G094450
OH-1004 IDLXL04_027794
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 76.331
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G094450
位置Chr07:24644410-24647275 (+)
描述Similar to FIP1: Protein FIP1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g06005 蛋白FIP1。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027794 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005765 lysosomal membrane 细胞组分
GO:0005770 late endosome 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G06005
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.256
排名 1 · TkA07G094450 · TK1151
高尔基体0.225
排名 2 · TkA07G094450 · TK1151
细胞质0.205
排名 3 · TkA07G094450 · TK1151
细胞核0.198
排名 4 · TkA07G094450 · TK1151
线粒体0.147
排名 5 · TkA07G094450 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14802TMEM1925-141 aa
PF16515HIP1_clath_bdg115-159 aa
PF15619Lebercilin116-211 aa
PF18052Rx_N118-153 aa
PF27578ODF2_N122-141 aa
PF15905HMMR_N124-236 aa
PF27954CCDC192125-189 aa
PF30907IPGA1_CC127-147 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G094450PF14802TMEM19251412.1e-1040.9
TkA07G094450PF16515HIP1_clath_bdg1151594.78.4
TkA07G094450PF15619Lebercilin1162110.003517.6
TkA07G094450PF18052Rx_N1181531.89.4
TkA07G094450PF27578ODF2_N1221411.99.4
TkA07G094450PF15905HMMR_N1242360.1512.2
TkA07G094450PF27954CCDC1921251890.1412.5
TkA07G094450PF30907IPGA1_CC1271470.7310.9
TkA07G094450PF27241CLIP11372440.6110.8
TkA07G094450PF25762HAUS11552480.0004820.7
TkA07G094450PF09304Cortex-I_coil1621900.5811.1
TkA07G094450PF18052Rx_N1631941.89.4
TkA07G094450PF19220Rod_CreS1652350.01215.5
TkA07G094450PF30907IPGA1_CC1661860.7310.9
TkA07G094450PF27578ODF2_N1682261.99.4
TkA07G094450PF23649FKBP151692500.2111.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8S8K9拟南芥sp|Q8S8K9|FRIP1_ARATH Protein FIP176.000%Swiss-Prot高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看