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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G089370
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 23273512-23299399 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

6242 bp · TkA07G089370|TK1151|cDNA

CTCCTTATGAACATTCTTGAAACCTTGGGAGCCTAAACTACAAATATTTATATTTTAGTCGTCAATCATTTGTGTTGTTGCCCGCGTTACTTCTTGATTAAGAAAGCATTCCATGTGCGAAATCTCTTTTGTTGATTAGCAAATGCGATGATATATAAAAGCTACTTTTGCGTAAAACTTTGAGCTTCGTATCTGGTAATATCTAAACTAATCTTTTTAAAGGTGTGGAGAAAACAATGGCCTACAATCGAAAAAGATCT...

CDS

下载 CDS FASTA

5787 bp · TkA07G089370|TK1151|CDS

ATGGCCTACAATCGAAAAAGATCTAATGACGAATTGCCACCTACTAAACAACCACGTACTCAAACAACCGGTGGTAGTTCCGGTATTGAGCCTATGATGGACAGTGAGGTGGTGCCTTCATCTCTTGTAAAAATTGCACCTATTCTTCGTGTTGCTAATGAAGTCGAACCCACAAATCCAAGAGTTGCCTACCTTTGTCGGTTCCATGCCTTTGAGAAAGCTCACAATTTAGATCCACGGTCAAGTGGACGTGGTGTTCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1928 aa · TkA07G089370|TK1151|PROTEIN

MAYNRKRSNDELPPTKQPRTQTTGGSSGIEPMMDSEVVPSSLVKIAPILRVANEVEPTNPRVAYLCRFHAFEKAHNLDPRSSGRGVRQFKTALLQRLQREDETTLAGRTKRDAREIQSFYQHYFMKYIQALKAEKADRTRLTKAYQTAVVLFEVLKAVSFIESVEVADEILEAHTKIAEKTEMYVPYNILPLDPDSSKQPIMRYPEIQASVTALRNTRGLPWPKAHKKKVDEDLLDWLQAVFGFQKDNVSNQREHLILLL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G089370
TK1151 IDTkA07G089370
OH-1004 IDLXL04_033709
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)78.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 58.635
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G089370
位置Chr07:23273512-23299399 (+)
描述Similar to CALS3: Callose synthase 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g05570 参与胞质分裂过程中形成细胞板的胼胝质合成。
An Arabidopsis Callose Synthase, GSL5, Is Required for Wound and Papillary Callose Formation.2003 · DOI: 10.1105/tpc.016097
At2g31960 参与胞质分裂过程中形成细胞板的胼胝质合成。 暂无已核实直接文献
At5g13000 参与胞质分裂过程中形成细胞板的胼胝质合成。 暂无已核实直接文献
At2g13680 形成分隔四孢子和包围花粉母细胞的胼胝质壁所必需的。
Callose synthase (CalS5) is required for exine formation during microgametogenesis and for pollen viability in Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02379.x
Callose (beta-1,3 glucan) is essential for Arabidopsis pollen wall patterning, but not tube growth.2005 · DOI: 10.1186/1471-2229-5-22
At5g36870 参与胞质分裂过程中形成细胞板的胼胝质合成。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033709 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006075 (1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process 生物过程
GO:0008360 regulation of cell shape 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
GO:0000148 1,3-beta-D-glucan synthase complex 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009504 cell plate 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0003843 1,3-beta-D-glucan synthase activity 分子功能
GO:0046527 glucosyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G05570
ath:AT2G31960
ath:AT5G13000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.695
排名 1 · TkA07G089370 · TK1151
内质网0.175
排名 2 · TkA07G089370 · TK1151
细胞质0.101
排名 3 · TkA07G089370 · TK1151
高尔基体0.083
排名 4 · TkA07G089370 · TK1151
溶酶体／液泡0.073
排名 5 · TkA07G089370 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04652Vta144-172 aa
PF14288FKS1_dom1319-430 aa
PF17727CtsR_C804-826 aa
PF25968CALS1841-1022 aa
PF17727CtsR_C895-910 aa
PF02364Glucan_synthase1030-1119 aa
PF02364Glucan_synthase1125-1734 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G089370PF04652Vta1441727.4e-1452.7
TkA07G089370PF14288FKS1_dom13194307e-42143.0
TkA07G089370PF17727CtsR_C8048260.1213.3
TkA07G089370PF25968CALS184110222.5e-51174.7
TkA07G089370PF17727CtsR_C8959100.1213.3
TkA07G089370PF02364Glucan_synthase103011194.4e-235783.4
TkA07G089370PF02364Glucan_synthase112517344.4e-235783.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9AUE0拟南芥sp|Q9AUE0|CALS1_ARATH Callose synthase 171.600%Swiss-Prot高置信
Q9SL03拟南芥sp|Q9SL03|CALS2_ARATH Callose synthase 272.300%Swiss-Prot高置信
Q9LXT9拟南芥sp|Q9LXT9|CALS3_ARATH Callose synthase 372.500%Swiss-Prot高置信
Q3B724拟南芥sp|Q3B724|CALS5_ARATH Callose synthase 558.600%Swiss-Prot高置信
Q9LTG5拟南芥sp|Q9LTG5|CALS4_ARATH Callose synthase 460.200%Swiss-Prot高置信

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