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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G086720
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 22630975-22643107 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

5543 bp · TkA07G086720|TK1151|cDNA

ATTTACTCGATCTATTATATCCTATCAAAAAAATTAATATATAATTAGTGTACTTAATATTTAAAGAAGAAATGACAGGAGGTCGGAGGGTAGGGCGGGGTGGGGTGGGCTGTGCTGCTTTTGCTTTTTGAGTTACCATCACTACCACCACCATTACCCCATTGAAACATTCTCTTTCACATTCTTTTCCAACCTTTTTTTATTTCCACGAACCTTAAAACTCTCTCTCTCTTTCTTCAATTCATATTTGCATACTTTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

3195 bp · TkA07G086720|TK1151|CDS

ATGCAGAAACCTGGGGGAATCATTGCTCTTCTTGATGAAGCATGTATGTTTCCAAAGGCAACACATGAGACATTTGCTCAGAAGATGTACCAAACATATAAATCACACAAACGGTTTGCCAAGCCCAAACTTTCTAGAACAAATTTCACAATCAACCATTATGCGGGAGATGTTACATACCAAGCTGACCACTTCCTAGACAAGAACAAGGATTACGTTGTAGCAGAGTTTCAAGCTTTGTTGAATGACTCAAGGTGCTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1064 aa · TkA07G086720|TK1151|PROTEIN

MQKPGGIIALLDEACMFPKATHETFAQKMYQTYKSHKRFAKPKLSRTNFTINHYAGDVTYQADHFLDKNKDYVVAEFQALLNDSRCSFVANLFPPLEDSSKQSKFSSIGTRFKQQLQSLMETLSTTEPHYIRCVKPNTVLKPGIFENDNVLNQLRCGGVLEAIRISCAGYPTKRSFDEFLERFGMLAPDVLDGSDEKSACVAICDRFGLKGYQIGKSKVFLRAGQMAELDARRAEVLATAARRIQRQIRTYLTRKEFIVL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G086720
TK1151 IDTkA07G086720
OH-1004 IDLXL04_027700
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.906 / OH-1004 68.141
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G086720
位置Chr07:22630975-22643107 (-)
描述Similar to XI-F: Myosin-12
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g31900 肌球蛋白重链，参与细胞周期调控的各种细胞器和蛋白质的运输，以实现它们的分隔。 暂无已核实直接文献
At1g17580 肌球蛋白重链，是细胞周期调节的各种细胞器和蛋白质分离所需的重链。
Enzymatic activity and motility of recombinant Arabidopsis myosin XI, MYA1.2007 · DOI: 10.1093/pcp/pcm054
A comparative study of the involvement of 17 Arabidopsis myosin family members on the motility of Golgi and other organelles.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.136853
Myosin XIK is a major player in cytoplasm dynamics and is regulated by two amino acids in its tail.2012 · DOI: 10.1093/jxb/err265
At5g20490 肌球蛋白重链，参与细胞周期调控的各种细胞器和蛋白质的运输，以实现它们的分隔。 暂无已核实直接文献
At1g08730 肌球蛋白重链，参与细胞周期调控的各种细胞器和蛋白质的运输，以实现它们的分隔。 暂无已核实直接文献
At1g54560 肌球蛋白重链，参与细胞周期调控的各种细胞器和蛋白质的运输，以实现它们的分隔。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027700 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007015 actin filament organization 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0010090 trichome morphogenesis 生物过程
GO:0010091 trichome branching 生物过程
GO:0010154 fruit development 生物过程
GO:0030048 actin filament-based movement 生物过程
GO:0048467 gynoecium development 生物过程
GO:0048767 root hair elongation 生物过程
GO:0048768 root hair cell tip growth 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G08730
ath:AT1G17580
ath:AT1G54560
ath:AT2G31900
ath:AT5G20490
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.543
排名 1 · TkA07G086720 · TK1151
细胞膜0.291
排名 2 · TkA07G086720 · TK1151
细胞核0.172
排名 3 · TkA07G086720 · TK1151
高尔基体0.131
排名 4 · TkA07G086720 · TK1151
溶酶体／液泡0.060
排名 5 · TkA07G086720 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00063Myosin_head3-222 aa
PF23005DUF703291-137 aa
PF14662KASH_CCD229-263 aa
PF13671AAA_33232-351 aa
PF00612IQ240-257 aa
PF00612IQ262-280 aa
PF00612IQ287-306 aa
PF00612IQ311-329 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G086720PF00063Myosin_head32223.1e-63214.8
TkA07G086720PF23005DUF7032911371.99.0
TkA07G086720PF14662KASH_CCD2292630.001918.9
TkA07G086720PF13671AAA_332323510.3212.0
TkA07G086720PF00612IQ2402572.8e-1555.3
TkA07G086720PF00612IQ2622802.8e-1555.3
TkA07G086720PF00612IQ2873062.8e-1555.3
TkA07G086720PF00612IQ3113292.8e-1555.3
TkA07G086720PF00612IQ3353532.8e-1555.3
TkA07G086720PF28422CCDC893414842.18.3
TkA07G086720PF00612IQ3583772.8e-1555.3
TkA07G086720PF10473CENP-F_leu_zip3814410.01815.8
TkA07G086720PF07889DUF16643884460.1912.5
TkA07G086720PF23067MG2803904473.47.9
TkA07G086720PF29090PEA2_C4224511.59.6
TkA07G086720PF10473CENP-F_leu_zip4725840.01815.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4IRU3拟南芥sp|F4IRU3|MYO12_ARATH Myosin-1269.400%Swiss-Prot高置信
Q39160拟南芥sp|Q39160|MYO5_ARATH Myosin-558.000%Swiss-Prot高置信
F4K5J1拟南芥sp|F4K5J1|MYO17_ARATH Myosin-1758.700%Swiss-Prot高置信
F4HXP9拟南芥sp|F4HXP9|MYO9_ARATH Myosin-957.400%Swiss-Prot高置信
F4HWY6拟南芥sp|F4HWY6|MYO11_ARATH Myosin-1156.300%Swiss-Prot高置信

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