TkA07G083710 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G083710

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 21884867-21885869 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

853 bp · TkA07G083710|TK1151|cDNA

CATCACTTCTACTTCCTTGAATTTGAATACTTTCTTGTGTAAAAAAATCCAAAGATGGTGGTTAAGGTGTACGGAGCCCCGTTCCCTCATCCAAAACGAGTCCTGGTTTGTCTTGCCGAAAAAGAAATCGAGTTCGAGATGATTTTCGTCGATCTATTCAAACAGGAACATCACAATCCTAAATTCCTGAAATTACAGCCGTTTCGCTACGTTCCTATAATCCAAGATGGCGATTACACCCTCTACGAATCACGAGCAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

648 bp · TkA07G083710|TK1151|CDS

ATGGTGGTTAAGGTGTACGGAGCCCCGTTCCCTCATCCAAAACGAGTCCTGGTTTGTCTTGCCGAAAAAGAAATCGAGTTCGAGATGATTTTCGTCGATCTATTCAAACAGGAACATCACAATCCTAAATTCCTGAAATTACAGCCGTTTCGCTACGTTCCTATAATCCAAGATGGCGATTACACCCTCTACGAATCACGAGCAATCATCCGCTATTATGCGAAGAAGTACAGGTCGCAAGGAACTGATTTACTCGGGAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

215 aa · TkA07G083710|TK1151|PROTEIN

MVVKVYGAPFPHPKRVLVCLAEKEIEFEMIFVDLFKQEHHNPKFLKLQPFRYVPIIQDGDYTLYESRAIIRYYAKKYRSQGTDLLGKTMEEEGLVNQWLEVEATRFHPPVFHLVTQIMFGPEFGIERSEKVVKENEEALGKVLDVYEDRLSKSKYLAGDFFSLADLAHLPFGENLVGPCGKEYMIKERKHVSAWWDDISSRPSWKKVNEACKTLE

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G083710`
TK1151 ID	TkA07G083710
OH-1004 ID	LXL04_027655
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	99.500
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G083710

位置 Chr07:21884867-21885869 (+)

描述 Similar to GSTF9: Glutathione S-transferase F9

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g30860`	在体外，对 1-氯-2,4-二硝基苯和异硫氰酸苄酯具有谷胱甘肽 S-转移酶活性，对氢过氧化异丙苯和亚油酸-13-氢过氧化物具有谷胱甘肽过氧化物酶活性。	Probing the diversity of the Arabidopsis glutathione S-transferase gene family.2002 · DOI: 10.1023/a:1015557300450 Characterization of two Arabidopsis thaliana glutathione S-transferases.2006 · DOI: 10.1007/s00299-006-0146-1
`At2g30870`	在体外，对 1-氯-2,4-二硝基苯和异硫氰酸苄酯具有谷胱甘肽 S-转移酶活性。	Probing the diversity of the Arabidopsis glutathione S-transferase gene family.2002 · DOI: 10.1023/a:1015557300450
`At3g03190`	可能参与将还原型谷胱甘肽结合到大量外源性和内源性疏水性电亲分子上，并在对某些除草剂的解毒中起作用。	暂无已核实直接文献
`At5g17220`	参与液泡中花青素和原花青素的运输和/或积累。	TRANSPARENT TESTA 19 is involved in the accumulation of both anthocyanins and proanthocyanidins in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01943.x The Arabidopsis tt19-4 mutant differentially accumulates proanthocyanidin and anthocyanin through a 3' amino acid substitution in glutathione S-transferase.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-3040.2010.02249.x
`At3g62760`	可能参与将还原型谷胱甘肽结合到大量外源性和内源性疏水性电亲分子上，并在对某些除草剂的解毒中起作用。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027655 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006749 glutathione metabolic process 生物过程

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程

GO:0009407 toxin catabolic process 生物过程

GO:0009414 response to water deprivation 生物过程

GO:0010043 response to zinc ion 生物过程

GO:0046283 anthocyanin-containing compound metabolic process 生物过程

GO:0046686 response to cadmium ion 生物过程

GO:1900384 regulation of flavonol biosynthetic process 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G30860

ath:AT2G30870

ath:AT3G03190

ath:AT3G62760

ath:AT5G17220

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.805

排名 1 · TkA07G083710 · TK1151

细胞核0.208

排名 2 · TkA07G083710 · TK1151

线粒体0.074

排名 3 · TkA07G083710 · TK1151

内质网0.062

排名 4 · TkA07G083710 · TK1151

过氧化物酶体0.056

排名 5 · TkA07G083710 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02798GST_N1-73 aa

PF13417GST_N_36-78 aa

PF13409GST_N_211-75 aa

PF00043GST_C107-202 aa

PF14497GST_C_3130-205 aa

PF13410GST_C_2132-178 aa

PF13409GST_N_2191-212 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G083710	`PF02798`	GST_N	1	73	9.6e-16	58.6
TkA07G083710	`PF13417`	GST_N_3	6	78	2.8e-10	41.1
TkA07G083710	`PF13409`	GST_N_2	11	75	6.4e-13	49.8
TkA07G083710	`PF00043`	GST_C	107	202	2.4e-15	57.2
TkA07G083710	`PF14497`	GST_C_3	130	205	2.9e-06	28.1
TkA07G083710	`PF13410`	GST_C_2	132	178	0.0048	17.7
TkA07G083710	`PF13409`	GST_N_2	191	212	6.4e-13	49.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O80852`	拟南芥	sp\|O80852\|GSTF9_ARATH Glutathione S-transferase F9	64.700%	Swiss-Prot	高置信
`P42761`	拟南芥	sp\|P42761\|GSTFA_ARATH Glutathione S-transferase F10	59.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q96324`	拟南芥	sp\|Q96324\|GSTFB_ARATH Glutathione S-transferase F11	48.100%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FE46`	拟南芥	sp\|Q9FE46\|GSTFC_ARATH Glutathione S-transferase F12	45.200%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LZI9`	拟南芥	sp\|Q9LZI9\|GSTFD_ARATH Glutathione S-transferase F13	44.800%	Swiss-Prot	中等置信

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