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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G079790
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 20867893-20873422 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

510 bp · TkA07G079790|TK1151|cDNA

ATGCATGACCTAATGAATGACCTGGCCATGTCTGTTGCTGGAGATGTTTTTTCAAGGTTGGACATTGGCAAGAAGAAGGAAGCTTTGCAAAATCACCGTCATGTGTTATTTGTATGTGAAGATCATATGGTTCACGAAAGGTTTGAACCAGTCAAAGGGGCTAAAAATTTGAGAACATTTTTAGCAGTGTCAGTTGGGACGTATCATTGGGATAGATTTTACTTATCAAATAAGGTCCTGAATGACTTGCTTCAGAAGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

510 bp · TkA07G079790|TK1151|CDS

ATGCATGACCTAATGAATGACCTGGCCATGTCTGTTGCTGGAGATGTTTTTTCAAGGTTGGACATTGGCAAGAAGAAGGAAGCTTTGCAAAATCACCGTCATGTGTTATTTGTATGTGAAGATCATATGGTTCACGAAAGGTTTGAACCAGTCAAAGGGGCTAAAAATTTGAGAACATTTTTAGCAGTGTCAGTTGGGACGTATCATTGGGATAGATTTTACTTATCAAATAAGGTCCTGAATGACTTGCTTCAGAAGTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

169 aa · TkA07G079790|TK1151|PROTEIN

MHDLMNDLAMSVAGDVFSRLDIGKKKEALQNHRHVLFVCEDHMVHERFEPVKGAKNLRTFLAVSVGTYHWDRFYLSNKVLNDLLQKLPLLRVLSLSHLGICGVPEVVGYMKHLRYLNLSNTEITRLPENVCNLYNLTKLPKNFSKLQNLQHFDVRGTTWRLENMPLGGW

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G079790
TK1151 IDTkA07G079790
OH-1004 IDLXL04_013347
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)92.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 94.083 / OH-1004 26.059
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G079790
位置Chr07:20867893-20873422 (+)
描述Similar to RPPL1: Putative disease resistance RPP13-like protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g14470 潜在的抗病蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013347 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0051607 defense response to virus 生物过程
GO:0098542 defense response to other organism 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0004016 adenylate cyclase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0043531 ADP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G14460
ath:AT3G14470
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.510
排名 1 · TkA07G079790 · TK1151
细胞核0.213
排名 2 · TkA07G079790 · TK1151
内质网0.150
排名 3 · TkA07G079790 · TK1151
细胞膜0.116
排名 4 · TkA07G079790 · TK1151
细胞外0.112
排名 5 · TkA07G079790 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF25013LRR_Zer-135-97 aa
PF12799LRR_455-59 aa
PF12799LRR_473-97 aa
PF13855LRR_881-97 aa
PF23598LRR_1482-151 aa
PF13516LRR_688-97 aa
PF13855LRR_889-139 aa
PF00560LRR_190-104 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G079790PF25013LRR_Zer-135970.0004421.1
TkA07G079790PF12799LRR_455590.0001422.7
TkA07G079790PF12799LRR_473970.0001422.7
TkA07G079790PF13855LRR_881970.0001921.8
TkA07G079790PF23598LRR_14821512.6e-1143.6
TkA07G079790PF13516LRR_688970.2112.4
TkA07G079790PF13855LRR_8891390.0001921.8
TkA07G079790PF00560LRR_1901040.000321.0
TkA07G079790PF25013LRR_Zer-11081580.0004421.1
TkA07G079790PF12799LRR_41111390.0001422.7
TkA07G079790PF13516LRR_61111240.2112.4
TkA07G079790PF00560LRR_11121330.000321.0
TkA07G079790PF13855LRR_81361560.0001921.8
TkA07G079790PF00560LRR_11361460.000321.0
TkA07G079790PF13516LRR_61461560.2112.4
TkA07G079790PF00560LRR_11481570.000321.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LRR4拟南芥sp|Q9LRR4|R13L1_ARATH Putative disease resistance RPP13-like protein 135.800%Swiss-Prot中等置信

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