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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G064620
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 17066460-17069724 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2288 bp · TkA07G064620|TK1151|cDNA

GATACTCGTAGGTTTCCTGGTAGAGTGTGGCAACATGAACTAAATGTGTAACTTAATAACACGCAAAAACAAATTTACATCGATTTATTTTCAAACAAAAGAAAGAAGATACTCATAGTCTCCATTGCATGAAACGATCTCACATATCCCAACAAAGACCACAGCCTTAAACCCAAATTACAACATTTTCAAGATCAACAATACGAATTCAATCTGAAATCCCGCTGCCATTAGCCCTAATTCACTAAAACTTTAGCACA...

CDS

下载 CDS FASTA

1647 bp · TkA07G064620|TK1151|CDS

ATGATGAGGTGGGAGAAATTGGAGATACAAAGAGGAGGGCCGGGGAAGAGATGGGGCCATACGTGCAACGCGGTTCGTGGTGGTCAGCTGCTCTACATCTTCGGTGGTTACGGCGAAGACAACGCCCAGACTAATAAAGTTCACGTCTACGACACCACTGCAAGGACATGGAGTGAACCTGATATGCAAGGCACACTACCTGTTCCCAGAGACAGCCACAGCTGCACCACTGTAGGAGACAAGTTGTTTGTATTTGGTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

548 aa · TkA07G064620|TK1151|PROTEIN

MMRWEKLEIQRGGPGKRWGHTCNAVRGGQLLYIFGGYGEDNAQTNKVHVYDTTARTWSEPDMQGTLPVPRDSHSCTTVGDKLFVFGGTDGNIPLKDLHILDTTTNTWMTPYVRGEGPEPREGHSAALIGKRLFIFGGCGKSFDTPVEEYFDDLYILNTETMVWKRVATTGIPPAKRNSHTCVSWKNKIIVIGGEDTQNYYMSDVQMLDTDTLSWTKLVTNGELLPPRAGHTTIALGKNLFVFGGFTDAEDLYDDLYMFDL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G064620
TK1151 IDTkA07G064620
OH-1004 IDLXL04_008713
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G064620
位置Chr07:17066460-17069724 (-)
描述Similar to Klhdc3: Kelch domain-containing protein 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g05420 以非常高的亲和力结合中链和长链酰基辅酶A酯。
ACBP4 and ACBP5, novel Arabidopsis acyl-CoA-binding proteins with kelch motifs that bind oleoyl-CoA.2004 · DOI: 10.1007/s11103-004-0642-z
Arabidopsis acyl-CoA-binding proteins ACBP4 and ACBP5 are subcellularly localized to the cytosol and ACBP4 depletion affects membrane lipid composition.2008 · DOI: 10.1007/s11103-008-9392-7
At5g27630 以非常高的亲和力结合中链和长链酰基辅酶A酯。
ACBP4 and ACBP5, novel Arabidopsis acyl-CoA-binding proteins with kelch motifs that bind oleoyl-CoA.2004 · DOI: 10.1007/s11103-004-0642-z

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008713 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0043161 proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0051321 meiotic cell cycle 生物过程
GO:0140627 ubiquitin-dependent protein catabolic process via the C-end degron rule pathway 生物过程
GO:0000785 chromatin 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0031462 Cul2-RING ubiquitin ligase complex 细胞组分
GO:0003682 chromatin binding 分子功能
GO:1990756 ubiquitin-like ligase-substrate adaptor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
mmu:71765
rno:363192
xla:447194
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.535
排名 1 · TkA07G064620 · TK1151
细胞质0.443
排名 2 · TkA07G064620 · TK1151
细胞膜0.093
排名 3 · TkA07G064620 · TK1151
内质网0.057
排名 4 · TkA07G064620 · TK1151
溶酶体／液泡0.046
排名 5 · TkA07G064620 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24681Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC72-193 aa
PF24981Beta-prop_ATRN-LZTR13-80 aa
PF13854Kelch_HCF3-246 aa
PF13415Beta-prop_FBX424-107 aa
PF13418Beta-prop_TYW414-89 aa
PF24996NANM21-92 aa
PF01344Kelch_122-59 aa
PF07646Kelch_222-59 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G064620PF24681Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC721938.5e-96320.2
TkA07G064620PF24981Beta-prop_ATRN-LZTR13804e-56191.1
TkA07G064620PF13854Kelch_HCF32462.4e-38133.0
TkA07G064620PF13415Beta-prop_FBX4241071.2e-66225.0
TkA07G064620PF13418Beta-prop_TYW414892.3e-1661.2
TkA07G064620PF24996NANM21921.5e-2383.9
TkA07G064620PF01344Kelch_122593e-46155.2
TkA07G064620PF07646Kelch_222591.2e-31107.7
TkA07G064620PF13964Beta-prop_Calicin28897.1e-1245.7
TkA07G064620PF25852DUF6242_C301071.2e-0732.3
TkA07G064620PF24981Beta-prop_ATRN-LZTR1311084e-56191.1
TkA07G064620PF25210Kelch_FKB9531586.3e-1969.4
TkA07G064620PF25210Kelch_FKB95671676.3e-1969.4
TkA07G064620PF13418Beta-prop_TYW4671652.3e-1661.2
TkA07G064620PF01344Kelch_1691083e-46155.2
TkA07G064620PF07646Kelch_2691071.2e-31107.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9MA55拟南芥sp|Q9MA55|ACBP4_ARATH Acyl-CoA-binding domain-containing protein 424.800%Swiss-Prot低置信
Q8RWD9拟南芥sp|Q8RWD9|ACBP5_ARATH Acyl-CoA-binding domain-containing protein 524.300%Swiss-Prot低置信

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