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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G045610
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 12153642-12158300 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3914 bp · TkA07G045610|TK1151|cDNA

TTAAAGATAGCTTTTCCATCACCAAGCAAGGCATAAATATCGATAATGATGACATTGATCCCCAGCTTTCCAAAATCTTGCTTTAAATAAAAAAACTTAATATACATTGAATAACAATTACTTCTTTTTTAATAAAAATACTAATTGATGTTTCTCCTCTTTTGCATCATCATCATAAAAGGGGAATGAAATTATTGAATACAAAATCCAAATTGATGTTTCTCCTCTTTTGCATCATCATCATCATCGTAATCAACCCC...

CDS

下载 CDS FASTA

2994 bp · TkA07G045610|TK1151|CDS

ATGTCACGCTCTCTCTGTTGTGTTTTGTTATTCTTGATGCCGTTTGGTCTTTGTTTGAATCAAGAGGGGAGTTATCTGCAACAGATGAAGCTTGGATTTGATGACCCAGATGGGTTTTTCGCCGACTGGAATGATGCCGCCGGTGATACCCCTTGTCATTGGACCGGTGTTACTTGTTCTGAACCGGGAAGTGGGTTTGTTGTCGGTGTTGATTTATCAAATGCTAATGTTGCCGGTCCTTTTCCGTCTGTTCTGTGCCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

997 aa · TkA07G045610|TK1151|PROTEIN

MSRSLCCVLLFLMPFGLCLNQEGSYLQQMKLGFDDPDGFFADWNDAAGDTPCHWTGVTCSEPGSGFVVGVDLSNANVAGPFPSVLCRLTGLKFISLYNNSINGTLSDDLSTCRSLVHLNLAQNLLTGKLPHSLSELPELKYLDLTGNNFSGDIPASFGLFQKLEVISLVDNLIDGKIPAELGNVSTLKQLNLSYNPFSSGQIPPELGNLTNLEVLWLTGCSLIGQIPESLGRLSKLVDLDLAINKLTGPVPSSLTELSNV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G045610
TK1151 IDTkA07G045610
OH-1004 IDLXL04_027291
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G045610
位置Chr07:12153642-12158300 (-)
描述Similar to HSL1: Receptor-like protein kinase HSL1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g28440 类受体蛋白激酶 HSL1。 暂无已核实直接文献
At4g28490 具有双重特异性激酶活性作用于丝氨酸/苏氨酸和酪氨酸底物的受体，控制花器官脱落。 暂无已核实直接文献
At5g65700 富含亮氨酸重复序列的受体样激酶，与CLV1和BAM3共同感知CLAVATA类肽CLE25、CLE26和CLE45，经CIK及PBL34、PBL35和PBL36的磷酸化传递信号，调控原生韧皮部分化和分生组织维持。 暂无已核实直接文献
At3g49670 富含LRR的类受体激酶（LRR-RLK），涉及CLAVATA家族肽（CLEs）的检测，以及通过CIK蛋白的磷酸化调节触发信号以促进原韧皮部分化和分生组织维持，可能还包括PBL34、PBL35和PBL36。 暂无已核实直接文献
At5g65710 参与控制花器官脱落的受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027291 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0009934 regulation of meristem structural organization 生物过程
GO:0010075 regulation of meristem growth 生物过程
GO:0010102 lateral root morphogenesis 生物过程
GO:0010227 floral organ abscission 生物过程
GO:0010468 regulation of gene expression 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G09970
ath:AT1G28440
ath:AT4G28490
ath:AT5G65700
ath:AT5G65710
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.873
排名 1 · TkA07G045610 · TK1151
内质网0.083
排名 2 · TkA07G045610 · TK1151
细胞质0.061
排名 3 · TkA07G045610 · TK1151
细胞核0.033
排名 4 · TkA07G045610 · TK1151
溶酶体／液泡0.030
排名 5 · TkA07G045610 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_219-60 aa
PF29594LRR_SKP267-122 aa
PF00560LRR_170-88 aa
PF25013LRR_Zer-171-151 aa
PF12799LRR_472-104 aa
PF13855LRR_880-125 aa
PF23211LRR_LRWD182-149 aa
PF23598LRR_1485-194 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G045610PF08263LRRNT_219606.4e-1246.3
TkA07G045610PF29594LRR_SKP2671225.7e-0523.2
TkA07G045610PF00560LRR_170882.4e-51161.3
TkA07G045610PF25013LRR_Zer-1711512e-0525.5
TkA07G045610PF12799LRR_4721043e-2691.6
TkA07G045610PF13855LRR_8801254.2e-32110.4
TkA07G045610PF23211LRR_LRWD1821490.0215.3
TkA07G045610PF23598LRR_14851941.8e-2486.9
TkA07G045610PF00560LRR_1911122.4e-51161.3
TkA07G045610PF13855LRR_8911494.2e-32110.4
TkA07G045610PF24758LRR_At5g56370931481.4e-0938.7
TkA07G045610PF25372LRR_FBXL151061480.03513.2
TkA07G045610PF23952LRR_EndoS1061470.710.9
TkA07G045610PF13516LRR_61121234.58.3
TkA07G045610PF00560LRR_11141362.4e-51161.3
TkA07G045610PF12799LRR_41141543e-2691.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SGP2拟南芥sp|Q9SGP2|HSL1_ARATH Receptor-like protein kinase HSL172.100%Swiss-Prot低置信
P47735拟南芥sp|P47735|RLK5_ARATH Receptor-like protein kinase 562.000%Swiss-Prot低置信
O49545拟南芥sp|O49545|BAME1_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase BAM148.300%Swiss-Prot低置信
Q9M2Z1拟南芥sp|Q9M2Z1|BAME2_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase BAM245.700%Swiss-Prot低置信
C0LGX3拟南芥sp|C0LGX3|HSL2_ARATH LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase HSL247.000%Swiss-Prot低置信

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