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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G004040
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 1052752-1057568 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2176 bp · TkA07G004040|TK1151|cDNA

AGAACAATATTTCTGCAGGGTTTATCCTCTTCCTCTCACTCTAAACTAGAGAGAGAGTCTGTGAAAGTATGGTGTAAATTCTGCAATAAATTATTCGAATTCCAGATTTGTGCAGCTCAGCTGGTCAGAAATGGCCATCGGCGCCGTTATTTCTCACCGGAACTTCACATCCTTCATCAGCTCAGGTAAAATTCATAAACCTGAACAATCCACAACATATCAGAGATCAGATAAATTAAGCTCCATGTATTCAACAAATC...

CDS

下载 CDS FASTA

1716 bp · TkA07G004040|TK1151|CDS

ATGGCCATCGGCGCCGTTATTTCTCACCGGAACTTCACATCCTTCATCAGCTCAGGTAAAATTCATAAACCTGAACAATCCACAACATATCAGAGATCAGATAAATTAAGCTCCATGTATTCAACAAATCTATATAGTCTAAAGAAGATCCACCTCATTTCCGGATACTTAAACACCACATCTTCTCATGGTCTTCATCTTCCAACAATCCCACAAGAAACCAAAAAGTTCCAAATCAGAAACCATACACAAATAGCAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

571 aa · TkA07G004040|TK1151|PROTEIN

MAIGAVISHRNFTSFISSGKIHKPEQSTTYQRSDKLSSMYSTNLYSLKKIHLISGYLNTTSSHGLHLPTIPQETKKFQIRNHTQIAKCRWIKPVVQLKHNSISNRKTLQPRSSINRIRANYKSEDYDDVAGPDIVSSPEGGGASEAVLVGEIKETNQVPKRWVIVLLCFSAFLLCNMDRVNMSIAILPMSKEFGWNSATVGLIQSSFFWGYLLTQIVGGIWADKIGGKQVLGFGVIWWSVATILTPIAAKISLPFLLVMR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G004040
TK1151 IDTkA07G004040
OH-1004 IDLXL04_000615
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)81.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 72.680 / OH-1004 77.425
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G004040
位置Chr07:1052752-1057568 (-)
描述Similar to ANTR1: Sodium-dependent phosphate transport protein 1, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g00370 无机磷酸盐和可能的阴离子转运蛋白。
AtPHT4;4 is a chloroplast-localized ascorbate transporter in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1038/ncomms6928
At2g29650 特异性用于通过类囊体膜的无机磷酸盐转运，依赖钠离子。
Arabidopsis ANTR1 is a thylakoid Na+-dependent phosphate transporter: functional characterization in Escherichia coli.2008 · DOI: 10.1074/jbc.m709371200
At2g38060 无机磷酸盐和可能的阴离子转运蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os09g0570400 可能的阴离子转运蛋白。 暂无已核实直接文献
Os01g0279700 可能的阴离子转运蛋白。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000615 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006811 monoatomic ion transport 生物过程
GO:0006814 sodium ion transport 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0010028 xanthophyll cycle 生物过程
GO:0015882 L-ascorbic acid transmembrane transport 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0009579 thylakoid 细胞组分
GO:0009706 chloroplast inner membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G29650
ath:AT2G38060
ath:AT4G00370
dosa:Os01g0279700
dosa:Os09g0570400
osa:4326905
osa:4347913
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.971
排名 1 · TkA07G004040 · TK1151
线粒体0.030
排名 2 · TkA07G004040 · TK1151
过氧化物酶体0.022
排名 3 · TkA07G004040 · TK1151
细胞质0.021
排名 4 · TkA07G004040 · TK1151
细胞核0.018
排名 5 · TkA07G004040 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07690MFS_1168-530 aa
PF06779MFS_4187-327 aa
PF03092BT1249-472 aa
PF06779MFS_4381-446 aa
PF12420DUF3671387-414 aa
PF03092BT1452-559 aa
PF07690MFS_1515-560 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G004040PF07690MFS_11685305.9e-60203.7
TkA07G004040PF06779MFS_41873270.0001721.8
TkA07G004040PF03092BT12494720.1411.6
TkA07G004040PF06779MFS_43814460.0001721.8
TkA07G004040PF12420DUF36713874140.1312.5
TkA07G004040PF03092BT14525590.1411.6
TkA07G004040PF07690MFS_15155605.9e-60203.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GX78拟南芥sp|Q8GX78|ANTR2_ARATH Ascorbate transporter, chloroplastic83.200%Swiss-Prot高置信
O82390拟南芥sp|O82390|ANTR1_ARATH Sodium-dependent phosphate transport protein 1, chloroplastic80.200%Swiss-Prot高置信
Q7XJR2拟南芥sp|Q7XJR2|ANTR3_ARATH Probable anion transporter 3, chloroplastic40.500%Swiss-Prot中等置信
Q652N5水稻sp|Q652N5|PHT44_ORYSJ Probable anion transporter 4, chloroplastic68.200%Swiss-Prot高置信
Q9SDI4水稻sp|Q9SDI4|PHT41_ORYSJ Probable anion transporter 1, chloroplastic82.000%Swiss-Prot高置信

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