基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA07G001770
当前版本: TK1151
染色体: Chr07
坐标: 441738-448121
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA4735 bp · TkA07G001770|TK1151|cDNA
GTAATATATCTTCTTCATTTTAAGATTTTAGGGTTGGAACTTGGAAGTTGCGGCGCCTCTTTCTTCTCTGTTCTTCTTCAACCATTTATTTTTATTTTGCTTCTTCTTCACACAGCTTCTATCTTCTTCAATACAAAGAAGAAATAGCCGTTGGAGAGCTCGAGATAGCCGTTGAACGGGAAGAAAGGGGAAAAGAGGAAGCCAACGCCGCGTTCTCGGGCGTTGGCGTTTCAACGCGGAGGAACGCAGGAAGGACCCGG...
CDS
下载 CDS FASTA3267 bp · TkA07G001770|TK1151|CDS
ATGGCAGACGGCAATGACAGTGGTAGAAGCTTCAAGAGGAGGGACCAGCTTCTGGAAATGGAACACGAAGTCCGAAAATGGTGGGATGATGGCCATGTTTTCAATGCTGAAGCCAGTGATCAACCTCCCAAAGAAGGCGACAAGTTTTTTGGGAGCTTCCCATTTCCATATATGAACGGATATCTCCATCTAGGGCATGCATTTTCCCTCTCCAAACTTGAATTCGCTGCTGCATATCACAGATTAAGGGGCGTTAACGT...
1088 aa · TkA07G001770|TK1151|PROTEIN
MADGNDSGRSFKRRDQLLEMEHEVRKWWDDGHVFNAEASDQPPKEGDKFFGSFPFPYMNGYLHLGHAFSLSKLEFAAAYHRLRGVNVLLPFGFHCTGMPIKASADKLRREIERFGNPPSFPSEAEEPEVKIEGSQQSQQPDKFKGKKSKAASKTGKETYQWEIMRGYGLSDTEIATFQDPVQWLRFFPPLAVEDLKAFGLGADWRRSFITTDINPYFDSFVRWQMRKLKSMGKIVKDLRYTIYSPLDGQPCADHDRASGE...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA07G001770 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA07G001770 |
| OH-1004 ID | LXL04_003357 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系 |
| 蛋白一致性 (%) | 77.400 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 9.743 / OH-1004 22.440覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA07G001770 |
|---|---|
| 位置 | Chr07:441738-448121 (-) |
| 描述 | Similar to At1g09620: Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006412 translation 生物过程 GO:0006418 tRNA aminoacylation for protein translation 生物过程 GO:0006425 glutaminyl-tRNA aminoacylation 生物过程 GO:0006429 leucyl-tRNA aminoacylation 生物过程 GO:0008361 regulation of cell size 生物过程 GO:0009791 post-embryonic development 生物过程 GO:0032008 positive regulation of TOR signaling 生物过程 GO:0034198 cellular response to amino acid starvation 生物过程 GO:0048608 reproductive structure development 生物过程 GO:0071230 cellular response to amino acid stimulus 生物过程 GO:0071233 cellular response to L-leucine 生物过程 GO:1904263 positive regulation of TORC1 signaling 生物过程 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G09620 cel:CELE_R74.1 hsa:51520 mmu:107045 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.655
细胞核0.200
线粒体0.120
过氧化物酶体0.113
质体0.053
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00133tRNA-synt_125-106 aaPF09334tRNA-synt_1g54-111 aaPF00133tRNA-synt_1193-754 aaPF09334tRNA-synt_1g661-760 aaPF01406tRNA-synt_1e669-744 aaPF01921tRNA-synt_1f670-744 aaPF08264Anticodon_1727-775 aaPF08264Anticodon_1795-914 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA07G001770 | PF00133 | tRNA-synt_1 | 25 | 106 | 3.5e-26 | 92.6 |
| TkA07G001770 | PF09334 | tRNA-synt_1g | 54 | 111 | 8.5e-15 | 55.1 |
| TkA07G001770 | PF00133 | tRNA-synt_1 | 193 | 754 | 3.5e-26 | 92.6 |
| TkA07G001770 | PF09334 | tRNA-synt_1g | 661 | 760 | 8.5e-15 | 55.1 |
| TkA07G001770 | PF01406 | tRNA-synt_1e | 669 | 744 | 4.4e-08 | 33.6 |
| TkA07G001770 | PF01921 | tRNA-synt_1f | 670 | 744 | 0.14 | 11.8 |
| TkA07G001770 | PF08264 | Anticodon_1 | 727 | 775 | 7.3e-16 | 59.1 |
| TkA07G001770 | PF08264 | Anticodon_1 | 795 | 914 | 7.3e-16 | 59.1 |
| TkA07G001770 | PF24810 | RBD_LARS1 | 945 | 1022 | 9.8e-08 | 32.7 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
F4I116 | 拟南芥 | sp|F4I116|SYLC_ARATH Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic | 68.500% | Swiss-Prot | 高置信 |