TkA07G001440 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G001440

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 367695-375332 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1332 bp · TkA07G001440|TK1151|cDNA

CTCTTTAGTCTGGAAATGGAGAGTAAGAACAGTCGCAGGGTTTGTGTCACCGGAGGTGCTGGTTACATTGGCTCAGCCCTGGTTCACTCACTTCTACAAAGTGGCTACACCGTCCATGCTACTCTTAGAAACCTTGGTGATGAATCTAAGGTGGGACTTTTGAGAGGTTTTCCTAATGCAAAAGAGAGGCTTCATTTGTTTAAAGCTGATATCTACAAACCAGAAGAGTTTGAACAAGCAATACAAGGTTGTATCTTTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1041 bp · TkA07G001440|TK1151|CDS

ATGGAGAGTAAGAACAGTCGCAGGGTTTGTGTCACCGGAGGTGCTGGTTACATTGGCTCAGCCCTGGTTCACTCACTTCTACAAAGTGGCTACACCGTCCATGCTACTCTTAGAAACCTTGGTGATGAATCTAAGGTGGGACTTTTGAGAGGTTTTCCTAATGCAAAAGAGAGGCTTCATTTGTTTAAAGCTGATATCTACAAACCAGAAGAGTTTGAACAAGCAATACAAGGTTGTATCTTTGTTTTCCATGTTGCAAC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

346 aa · TkA07G001440|TK1151|PROTEIN

MESKNSRRVCVTGGAGYIGSALVHSLLQSGYTVHATLRNLGDESKVGLLRGFPNAKERLHLFKADIYKPEEFEQAIQGCIFVFHVATPTIHDTIYKDIDTVEATTSAVKKIADACIRSGTVKRLIYTATVCAASPLKDDGSGYKTVMDESCWTSFHNNVPYINDALKEYTESKTKSEQEILKIGEDKARELEVVTLGCGLVGGGGHLPYPTISVLVLISQIINNPTCYQSLRYLEELLGKIPIVHIEDVCRAHIFCAETP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G001440`
TK1151 ID	TkA07G001440
OH-1004 ID	LXL04_026674
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	97.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G001440

位置 Chr07:367695-375332 (-)

描述 Similar to ANR: Anthocyanidin reductase ((2S)-flavan-3-ol-forming)

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g61720`	参与缩合单宁的生物合成。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026674 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009407 toxin catabolic process 生物过程

GO:0009813 flavonoid biosynthetic process 生物过程

GO:0050832 defense response to fungus 生物过程

GO:0008106 alcohol dehydrogenase (NADP+) activity 分子功能

GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能

GO:0016616 oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor 分子功能

GO:0016854 racemase and epimerase activity 分子功能

GO:0033729 anthocyanidin reductase activity 分子功能

GO:0050661 NADP binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

vvi:100232981

zma:732845

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.718

排名 1 · TkA07G001440 · TK1151

细胞核0.269

排名 2 · TkA07G001440 · TK1151

内质网0.078

排名 3 · TkA07G001440 · TK1151

细胞膜0.076

排名 4 · TkA07G001440 · TK1151

线粒体0.060

排名 5 · TkA07G001440 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05368NmrA7-129 aa

PF04321RmlD_sub_bind8-129 aa

PF00106adh_short8-79 aa

PF01370Epimerase9-259 aa

PF02719Polysacc_synt_29-141 aa

PF08659KR10-79 aa

PF010733Beta_HSD11-185 aa

PF16363GDP_Man_Dehyd11-121 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G001440	`PF05368`	NmrA	7	129	5.8e-12	46.5
TkA07G001440	`PF04321`	RmlD_sub_bind	8	129	1.7e-05	24.8
TkA07G001440	`PF00106`	adh_short	8	79	9.4e-05	22.7
TkA07G001440	`PF01370`	Epimerase	9	259	1.5e-21	77.6
TkA07G001440	`PF02719`	Polysacc_synt_2	9	141	0.00042	20.3
TkA07G001440	`PF08659`	KR	10	79	0.012	16.3
TkA07G001440	`PF01073`	3Beta_HSD	11	185	1.8e-12	47.6
TkA07G001440	`PF16363`	GDP_Man_Dehyd	11	121	2.2e-09	38.0
TkA07G001440	`PF07993`	NAD_binding_4	11	187	4e-06	26.9
TkA07G001440	`PF13460`	NAD_binding_10	13	138	9.8e-11	42.6
TkA07G001440	`PF03435`	Sacchrp_dh_NADP	14	95	0.72	10.9
TkA07G001440	`PF31176`	LIN14_BEN	75	122	0.11	13.0
TkA07G001440	`PF00106`	adh_short	97	135	9.4e-05	22.7
TkA07G001440	`PF08659`	KR	99	136	0.012	16.3
TkA07G001440	`PF31176`	LIN14_BEN	161	179	0.11	13.0
TkA07G001440	`PF31176`	LIN14_BEN	243	252	0.11	13.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SEV0`	拟南芥	sp\|Q9SEV0\|BAN_ARATH Anthocyanidin reductase	30.100%	Swiss-Prot	中等置信

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