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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA07G001430
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 364796-366196 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1191 bp · TkA07G001430|TK1151|cDNA

ATGGCAAGAACACCCCATATAGCCATTGTACCGAGTCCAGGCATGGGTCACTTAATCCCTTTAGTCGAATTCTCAAAAAGACTATTAAACAGCCATCAAATCACTGCAACTTTCATCATCCCAAATGATGGACCTTTATCCAAATCGCAAACAGCTTTTCTTGATTCTCTCCCAAATGGATTAAGCTACCTCCTTCTACCTCCGATCAAGTTCGATGATTTACCCCAAGATACCCAAATGGAAACTCGAATTAGCTTGAT...

1191 bp · TkA07G001430|TK1151|CDS

ATGGCAAGAACACCCCATATAGCCATTGTACCGAGTCCAGGCATGGGTCACTTAATCCCTTTAGTCGAATTCTCAAAAAGACTATTAAACAGCCATCAAATCACTGCAACTTTCATCATCCCAAATGATGGACCTTTATCCAAATCGCAAACAGCTTTTCTTGATTCTCTCCCAAATGGATTAAGCTACCTCCTTCTACCTCCGATCAAGTTCGATGATTTACCCCAAGATACCCAAATGGAAACTCGAATTAGCTTGAT...

396 aa · TkA07G001430|TK1151|PROTEIN

MARTPHIAIVPSPGMGHLIPLVEFSKRLLNSHQITATFIIPNDGPLSKSQTAFLDSLPNGLSYLLLPPIKFDDLPQDTQMETRISLMVTRSLPSLRHVFKSLVAEKHMVALFIDLFGTDAFDVAIEFGVSPYVFFPSTAMALSLFLHLPKLDQEVDCEYRELSEPVQIPGCIPVRGQDLLDPVQDRKNDAYKWVLHNAKRYMMAEGIAVNSFKELEGGALRVLLQEEPGKPMVYPVGPLIQAGSGSNLDGSDCLRWLDGQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G001430
TK1151 IDTkA07G001430
OH-1004 IDLXL04_022781
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)50.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 88.889 / OH-1004 75.480
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G001430
位置Chr07:364796-366196 (+)
描述Similar to AS: Hydroquinone glucosyltransferase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_022781 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006805 xenobiotic metabolic process 生物过程
GO:0009636 response to toxic substance 生物过程
GO:0009718 anthocyanin-containing compound biosynthetic process 生物过程
GO:0009809 lignin biosynthetic process 生物过程
GO:0042178 xenobiotic catabolic process 生物过程
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0008194 UDP-glycosyltransferase activity 分子功能
GO:0035251 UDP-glucosyltransferase activity 分子功能
GO:0047213 anthocyanidin 3-O-glucosyltransferase activity 分子功能
GO:0050505 hydroquinone glucosyltransferase activity 分子功能
GO:0080043 quercetin 3-O-glucosyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ag:CAC35167
ath:AT1G01390
ath:AT1G01420
ath:AT4G01070
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.773
排名 1 · TkA07G001430 · TK1151
细胞核0.250
排名 2 · TkA07G001430 · TK1151
内质网0.082
排名 3 · TkA07G001430 · TK1151
质体0.060
排名 4 · TkA07G001430 · TK1151
过氧化物酶体0.053
排名 5 · TkA07G001430 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26168Glyco_transf_N7-39 aa
PF26168Glyco_transf_N197-240 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G001430PF26168Glyco_transf_N7390.002218.6
TkA07G001430PF26168Glyco_transf_N1972400.002218.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M156拟南芥sp|Q9M156|U72B1_ARATH UDP-glycosyltransferase 72B152.200%Swiss-Prot高置信
Q9LNI1拟南芥sp|Q9LNI1|U72B3_ARATH UDP-glycosyltransferase 72B358.100%Swiss-Prot高置信
Q8W4C2拟南芥sp|Q8W4C2|U72B2_ARATH UDP-glycosyltransferase 72B255.900%Swiss-Prot高置信
Q9LVR1拟南芥sp|Q9LVR1|U72E2_ARATH UDP-glycosyltransferase 72E241.400%Swiss-Prot中等置信

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