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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G475470
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 117795218-117797879 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1809 bp · TkA06G475470|TK1151|cDNA

GGTTTATGTTTATCCCCAAAATTGGATTTACCCTATCGGATCATCTCTGAACTCCTAATTCTTATAAACTGTTCCAAATCTCTTCGCCAAACACACGCACATATGCAATCGGAAGACATTCAACAGATATCATATGAAGAACAACAGCAATAACAATATGGTGGCGGATAAGACACGGGCCCTGCCGGTTGACCCGAATCTCCCACGGTGGGTCTGCCAGAATTGCCGTCACAGTCTCTCCATCACCGGCGTTGATGCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1587 bp · TkA06G475470|TK1151|CDS

ATGAAGAACAACAGCAATAACAATATGGTGGCGGATAAGACACGGGCCCTGCCGGTTGACCCGAATCTCCCACGGTGGGTCTGCCAGAATTGCCGTCACAGTCTCTCCATCACCGGCGTTGATGCTTACCCTGATAAATTCTTCAATGACTCCTCCAGTTACCGATCCGGGATGCAGGGCTCTTCGATGCATGGGGCAAGCAGTGTGTTAGGCACACGAATGGATCAATCGTTTGTTGTATTACCAAAACAAAGGAACCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

528 aa · TkA06G475470|TK1151|PROTEIN

MKNNSNNNMVADKTRALPVDPNLPRWVCQNCRHSLSITGVDAYPDKFFNDSSSYRSGMQGSSMHGASSVLGTRMDQSFVVLPKQRNQSSGVPPRPRNGSMNPDSTHSGKAMEESFVVLPPPAASVYKSDPTLDGGGTHFQSHEGGSNSAPTQSNNSGFHSTITVLKRAFEIATTQTQVEQPLCLECMRVLSDKLDKEVEDVNSDIKSYEACLQRLEGEPRNVLSEADFLREKLKIEDEERKLEAAIQETEKQCAEVTGEL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G475470
TK1151 IDTkA06G475470
OH-1004 IDLXL04_022575
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G475470
位置Chr06:117795218-117797879 (-)
描述Similar to ATG6: Beclin-1-like protein
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g61710 正常植物发育所需。
An Arabidopsis homolog of yeast ATG6/VPS30 is essential for pollen germination.2007 · DOI: 10.1104/pp.106.093864
Arabidopsis AtBECLIN 1/AtAtg6/AtVps30 is essential for pollen germination and plant development.2007 · DOI: 10.1038/cr.2007.7
Arabidopsis ATG6 is required to limit the pathogen-associated cell death response.2008 · DOI: 10.4161/auto.5056
Autophagy protein 6 (ATG6) is required for pollen germination in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.4161/auto.5629

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022575 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000045 autophagosome assembly 生物过程
GO:0000423 mitophagy 生物过程
GO:0006623 protein targeting to vacuole 生物过程
GO:0006914 autophagy 生物过程
GO:0006995 cellular response to nitrogen starvation 生物过程
GO:0009846 pollen germination 生物过程
GO:0010508 positive regulation of autophagy 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0032465 regulation of cytokinesis 生物过程
GO:0045022 early endosome to late endosome transport 生物过程
GO:0045324 late endosome to vacuole transport 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G61710
ddi:DDB_G0288021
dre:393846
xla:444178
xtr:619357
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.620
排名 1 · TkA06G475470 · TK1151
高尔基体0.237
排名 2 · TkA06G475470 · TK1151
溶酶体／液泡0.188
排名 3 · TkA06G475470 · TK1151
细胞核0.174
排名 4 · TkA06G475470 · TK1151
细胞膜0.143
排名 5 · TkA06G475470 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07776zf-AD20-36 aa
PF07776zf-AD159-191 aa
PF04859DUF641178-241 aa
PF17675APG6_N181-309 aa
PF27255PM1805187-206 aa
PF25764KIF21A_4th191-292 aa
PF30882CCDC146_CC_N192-307 aa
PF24319DUF7491192-266 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G475470PF07776zf-AD20360.1113.5
TkA06G475470PF07776zf-AD1591910.1113.5
TkA06G475470PF04859DUF6411782410.09913.7
TkA06G475470PF17675APG6_N1813092.1e-2796.8
TkA06G475470PF27255PM18051872060.00517.8
TkA06G475470PF25764KIF21A_4th1912921.19.6
TkA06G475470PF30882CCDC146_CC_N1923070.08612.9
TkA06G475470PF24319DUF74911922660.9210.5
TkA06G475470PF15188CCDC-1671922202.69.1
TkA06G475470PF07303Occludin_ELL1932220.3712.3
TkA06G475470PF08286Spc241932201.210.1
TkA06G475470PF27255PM18052272900.00517.8
TkA06G475470PF08286Spc242302741.210.1
TkA06G475470PF11225DUF30242372770.03914.9
TkA06G475470PF04859DUF6412402690.09913.7
TkA06G475470PF07303Occludin_ELL2402950.3712.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M367拟南芥sp|Q9M367|BECN1_ARATH Beclin-1-like protein73.800%Swiss-Prot高置信

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