TkA06G348790 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G348790

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 86607675-86611049 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1144 bp · TkA06G348790|TK1151|cDNA

AAATATTTGGTTTTTCTTTGAAATTACTCATTCATGTAATCACGAATTGGATATTTGGTTGAATATTCCCAAATATTAAGCACCTTGTAATTGAGAGGCGAGATGTTGAACATGTTTTGACCGGATTTCGGTAGCGGGAAGAAAAATGACTGGTGCCGTGGGCGTTATCCAAACCCTCAATCCCTCCACATTTCCACTACCAAACGCCACAACTCCACCACTAATTTCTAGAAATAAATCAATCAAGCCGCTCTACTCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1047 bp · TkA06G348790|TK1151|CDS

ATGACTGGTGCCGTGGGCGTTATCCAAACCCTCAATCCCTCCACATTTCCACTACCAAACGCCACAACTCCACCACTAATTTCTAGAAATAAATCAATCAAGCCGCTCTACTCAATAACAGCAGAGATTAATGAGATCAGGGTGTGCACTAACCGACCTTGCCGGCGACAAGGGTCAATGGAGACCCTTCAAGTCCTCTCAGGCATCAATCCACCCAATATCGCCGTCAATTCCAGCGGTTGTTTGGGCCGATGCGGCGC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

348 aa · TkA06G348790|TK1151|PROTEIN

MTGAVGVIQTLNPSTFPLPNATTPPLISRNKSIKPLYSITAEINEIRVCTNRPCRRQGSMETLQVLSGINPPNIAVNSSGCLGRCGAGPNLVLLPGATYLKHCATAARAAEIMATVTGNDLESGKTSLETLSTRKKAEIEIEKGDFAMAEILLSEAIDLNPVGGLHYIYKARSVARLGMNKAVDALGDAIEASTLAPKYPEAYTCKGDALMAMEQFEAAGDSYSMALELDPSISRSKSFKIITPPKCPSSYEKRKKRNKV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G348790`
TK1151 ID	TkA06G348790
OH-1004 ID	LXL04_023377
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	87.900
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA06G348790`
位置	Chr06:86607675-86611049 (+)
描述	Similar to HOP3: Hsp70-Hsp90 organizing protein 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_023377` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0006620 post-translational protein targeting to endoplasmic reticulum membrane 生物过程 GO:0006986 response to unfolded protein 生物过程 GO:0009408 response to heat 生物过程 GO:0009611 response to wounding 生物过程 GO:0010286 heat acclimation 生物过程 GO:0034605 cellular response to heat 生物过程 GO:0046686 response to cadmium ion 生物过程 GO:0051131 chaperone-mediated protein complex assembly 生物过程 GO:0051260 protein homooligomerization 生物过程 GO:0051291 protein heterooligomerization 生物过程 GO:0070417 cellular response to cold 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分
KEGG 基因交叉引用	ath:AT1G12270 ath:AT1G62740 ath:AT4G12400 gmx:547932 hsa:54557 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.963

排名 1 · TkA06G348790 · TK1151

线粒体0.041

排名 2 · TkA06G348790 · TK1151

细胞核0.028

排名 3 · TkA06G348790 · TK1151

细胞质0.027

排名 4 · TkA06G348790 · TK1151

细胞膜0.018

排名 5 · TkA06G348790 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF012572Fe-2S_thioredx45-114 aa

PF09976TPR_21126-228 aa

PF25575TPR_BSK1_C129-203 aa

PF13424TPR_12134-180 aa

PF13181TPR_8136-161 aa

PF13432TPR_16136-178 aa

PF13428TPR_14136-161 aa

PF07719TPR_2137-161 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G348790	`PF01257`	2Fe-2S_thioredx	45	114	0.066	13.8
TkA06G348790	`PF09976`	TPR_21	126	228	0.00058	20.4
TkA06G348790	`PF25575`	TPR_BSK1_C	129	203	0.0002	21.9
TkA06G348790	`PF13424`	TPR_12	134	180	0.012	16.5
TkA06G348790	`PF13181`	TPR_8	136	161	2.7e-05	24.7
TkA06G348790	`PF13432`	TPR_16	136	178	0.005	18.0
TkA06G348790	`PF13428`	TPR_14	136	161	0.035	15.5
TkA06G348790	`PF07719`	TPR_2	137	161	4.7e-07	30.1
TkA06G348790	`PF14559`	TPR_19	137	159	0.23	12.5
TkA06G348790	`PF00515`	TPR_1	140	161	3.3e-08	33.7
TkA06G348790	`PF13414`	TPR_11	141	161	0.00028	21.2
TkA06G348790	`PF13431`	TPR_17	153	172	0.078	14.0
TkA06G348790	`PF07719`	TPR_2	181	190	4.7e-07	30.1
TkA06G348790	`PF13432`	TPR_16	181	232	0.005	18.0
TkA06G348790	`PF14559`	TPR_19	181	231	0.23	12.5
TkA06G348790	`PF13414`	TPR_11	191	212	0.00028	21.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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