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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G212870
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 55144917-55146481 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

553 bp · TkA06G212870|TK1151|cDNA

CTTAACTTGAAGACTAGGATAAGTAAAGTTTACGCGCCCACAGCGCGTGATATCAGACACAAAAAATATACCTCGCGTGTGGAACCTCACCGCAACTACGAGTGGTAATTCAGTCGCCATGTTCACTCCTTTCGGAAAGGCGGCAACATCCTGTAAATAAGCCCAAAATCCAGTGGAAGACACAGAAATTCAGCACGAAGAAATGGATTCGCAAAACGACTTCGATCGGCTTCTCTTCTTTGAGCATGCTCGCCGGAGTG...

CDS

下载 CDS FASTA

618 bp · TkA06G212870|TK1151|CDS

ATGGATTCGCAAAACGACTTCGATCGGCTTCTCTTCTTTGAGCATGCTCGCCGGAGTGCGGAAGTGACTTATGCGAAAAATCCTCTCGATACCGAGAACCTAACCAGATGGGGAGGGGCGTTGCTTGAACTGTCGACCTTCCAGAGTGTTCAGGAATCAAAATCTATGATTAAAGATGCTATATCAAAATTAGACGAAGCATTATCGATTGATCCAAGGAAACATGACGCGTTGTGGTGTATGGGCAATGCACAAACTTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

205 aa · TkA06G212870|TK1151|PROTEIN

MDSQNDFDRLLFFEHARRSAEVTYAKNPLDTENLTRWGGALLELSTFQSVQESKSMIKDAISKLDEALSIDPRKHDALWCMGNAQTSYAFLTPDKSEAKGYFDSAYTYFQQAVEEDPGNELYRKSFEVSTKAPELHAEVHSQSLSQQAMGFGSGGGPSSSSSVRGPKAQKNSDLKYDIFGWVILAVTVVAWVGFAKTNVPSPPSR

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G212870
TK1151 IDTkA06G212870
OH-1004 IDLXL04_023828
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G212870
位置Chr06:55144917-55146481 (+)
描述Similar to TOM20: Mitochondrial import receptor subunit TOM20
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g27080 受体复合物的核心组分，负责识别并转运细胞质合成的线粒体前蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g27390 受体复合物的核心组分，负责识别并转运细胞质合成的线粒体前蛋白。 暂无已核实直接文献
At5g40930 受体复合物的核心组分，负责识别并转运细胞质合成的线粒体前蛋白。 暂无已核实直接文献
At3g27070 受体复合物的核心组分，负责识别并转运细胞质合成的线粒体前蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2WYG9 受体复合物的核心组分，负责识别并转运细胞质合成的线粒体前蛋白。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_023828 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006626 protein targeting to mitochondrion 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0045040 protein insertion into mitochondrial outer membrane 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005741 mitochondrial outer membrane 细胞组分
GO:0005742 mitochondrial outer membrane translocase complex 细胞组分
GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分
GO:0005744 TIM23 mitochondrial import inner membrane translocase complex 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G27390
ath:AT3G27080
ath:AT5G40930
sot:102603648
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.372
排名 1 · TkA06G212870 · TK1151
质体0.222
排名 2 · TkA06G212870 · TK1151
细胞质0.151
排名 3 · TkA06G212870 · TK1151
内质网0.119
排名 4 · TkA06G212870 · TK1151
过氧化物酶体0.108
排名 5 · TkA06G212870 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF06552TOM20_plant7-196 aa
PF21033RMD1-313-81 aa
PF13428TPR_1414-36 aa
PF21033RMD1-354-125 aa
PF00515TPR_156-73 aa
PF07719TPR_258-73 aa
PF13414TPR_1158-85 aa
PF14559TPR_1958-79 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G212870PF06552TOM20_plant71964.4e-90301.2
TkA06G212870PF21033RMD1-313811.9e-0524.7
TkA06G212870PF13428TPR_1414360.01117.0
TkA06G212870PF21033RMD1-3541251.9e-0524.7
TkA06G212870PF00515TPR_156730.03114.8
TkA06G212870PF07719TPR_258730.0001122.8
TkA06G212870PF13414TPR_1158850.001518.9
TkA06G212870PF14559TPR_1958790.003518.3
TkA06G212870PF13428TPR_1458790.01117.0
TkA06G212870PF13176TPR_759720.2512.2
TkA06G212870PF13181TPR_860720.07214.0
TkA06G212870PF13428TPR_14971220.01117.0
TkA06G212870PF13176TPR_7971190.2512.2
TkA06G212870PF07719TPR_2981190.0001122.8
TkA06G212870PF13181TPR_8981180.07214.0
TkA06G212870PF13414TPR_11991190.001518.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P82874拟南芥sp|P82874|TO203_ARATH Mitochondrial import receptor subunit TOM20-357.100%Swiss-Prot高置信
P82873拟南芥sp|P82873|TO202_ARATH Mitochondrial import receptor subunit TOM20-250.200%Swiss-Prot高置信
P82805拟南芥sp|P82805|TO204_ARATH Mitochondrial import receptor subunit TOM20-455.500%Swiss-Prot高置信
P82872拟南芥sp|P82872|TO201_ARATH Mitochondrial import receptor subunit TOM20-160.400%Swiss-Prot高置信
A2WYG9水稻sp|A2WYG9|TOM20_ORYSI Probable mitochondrial import receptor subunit TOM2049.300%Swiss-Prot中等置信

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