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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G112180
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 29427532-29431879 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2561 bp · TkA06G112180|TK1151|cDNA

CTAGAAGCCAATGGCAATGGCAATTTCCGAGCAACAACCATCTTCCTCGGTCCTCTACTACTAATAAACTATTCAAAGCTCTCAAGATCTTGTAAACCCAGCCTACATTTCCATTTCTGATTTCTCTCTCCCCTAAATTATCTCAGACCTCATACACACCTTCATCGCCGCCACAGTTCCGTCACTCACTGCATGAGATGGGGGTAGCCCCGGTGAGCCTCAGAACCGCCGTGATCTTCCTTTCCTTCTTCTCCGCCGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1956 bp · TkA06G112180|TK1151|CDS

ATGACAGCACAAGCCAACGCCGAGTTAAAATTCGAAAACTATGCCTTGGTAAGCCGAGATGCCCTGCAGATTACTCCCACCCCCGACAGCAACCCGATGGTATTCGGCATCCAGAACCAGTCCGGCAGGGTAATGTTCCGTGAACGGTTCAAGCTATGGGACGGCGACGCCAACAGTAACGCCACCGTCGCCTCCTTCACCACCTCCTTCCTCGTCAACATGTTCCCAAACAACGGTACCCCAGGAGAAGGTTTAAGCTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

651 aa · TkA06G112180|TK1151|PROTEIN

MTAQANAELKFENYALVSRDALQITPTPDSNPMVFGIQNQSGRVMFRERFKLWDGDANSNATVASFTTSFLVNMFPNNGTPGEGLSFLIAPNLDIPLNSYGQYLGLTNATTDNQTSNGIVAVELDTVRQSFDIDNNHIGLNIHSVRSVVSESLTPLNITLAPDPPAFHNIWVEYNGTEKIIRIYIADQAEMNGPTPSKPATPIIQRNLDLRTTVNQHSYFGFAASTGTLVELNCIRRWNITINYFPEPEGPWLKIALGVG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G112180
TK1151 IDTkA06G112180
OH-1004 IDLXL04_024753
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G112180
位置Chr06:29427532-29431879 (-)
描述Similar to LECRKS5: Probable L-type lectin-domain containing receptor kinase S.5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g06740 可能的L型凝集素结构域受体激酶 S.5。 暂无已核实直接文献
At5g55830 参与对病原卵菌马铃薯晚疫病菌和辣椒晚疫病菌的抗性反应。 暂无已核实直接文献
At3g53380 含 L 型凝集素结构域的受体激酶 VIII.1。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0640500 含凝集素结构域的受体激酶，参与盐胁迫反应。
The Receptor-Like Kinase SIT1 Mediates Salt Sensitivity by Activating MAPK3/6 and Regulating Ethylene Homeostasis in Rice.2014 · DOI: 10.1105/tpc.114.125187
Mutual Regulation of Receptor-Like Kinase SIT1 and B'κ-PP2A Shapes the Early Response of Rice to Salt Stress.2019 · DOI: 10.1105/tpc.18.00706
Os04g0531400 含凝集素结构域的受体激酶，参与盐胁迫反应。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024753 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:1901001 negative regulation of response to salt stress 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G37710
ath:AT3G53810
ath:AT5G06740
ath:AT5G55830
dosa:Os02g0640500
osa:4330111
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.848
排名 1 · TkA06G112180 · TK1151
细胞质0.097
排名 2 · TkA06G112180 · TK1151
内质网0.066
排名 3 · TkA06G112180 · TK1151
细胞核0.054
排名 4 · TkA06G112180 · TK1151
溶酶体／液泡0.028
排名 5 · TkA06G112180 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00139Lectin_legB5-245 aa
PF18483Lectin_L-type_dom63-234 aa
PF00069Pkinase318-564 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr320-586 aa
PF03109ABC1322-347 aa
PF12330Haspin_kinase412-475 aa
PF17667Pkinase_fungal426-493 aa
PF03109ABC1429-472 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G112180PF00139Lectin_legB52457.4e-56190.2
TkA06G112180PF18483Lectin_L-type_dom632343.7e-0730.9
TkA06G112180PF00069Pkinase3185645.4e-47161.1
TkA06G112180PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3205861.5e-47162.8
TkA06G112180PF03109ABC13223470.0005819.8
TkA06G112180PF12330Haspin_kinase4124750.1611.7
TkA06G112180PF17667Pkinase_fungal4264930.007315.8
TkA06G112180PF03109ABC14294720.0005819.8
TkA06G112180PF14531Kinase-like4354910.1911.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FG33拟南芥sp|Q9FG33|LRKS5_ARATH Probable L-type lectin-domain containing receptor kinase S.539.200%Swiss-Prot中等置信
Q9FHG4拟南芥sp|Q9FHG4|LRKS7_ARATH Probable L-type lectin-domain containing receptor kinase S.737.100%Swiss-Prot中等置信
Q9LFH9拟南芥sp|Q9LFH9|LRK81_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase VIII.136.100%Swiss-Prot中等置信
Q6H7D2水稻sp|Q6H7D2|SIT1_ORYSJ L-type lectin-domain containing receptor kinase SIT136.100%Swiss-Prot中等置信
Q7XUN6水稻sp|Q7XUN6|SIT2_ORYSJ L-type lectin-domain containing receptor kinase SIT234.700%Swiss-Prot中等置信

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