RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G076200
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 20457956-20462224 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2349 bp · TkA06G076200|TK1151|cDNA

GACAAATCAACGGTGTTTTACCAACATCACGTCAATTGTTCCTCCGATCAATAACAACATCAACTCCCCTTTCCCCTGCAAACTTTGACGCTGCGTCAATTGTTCGTGACTTGCTGACCGTTGCAAATCTACACCAATCGCAGATCAAAAAATCGTTCATTTCGACGGAATCGTATCAAATTAGGTCTATTACCATTGCAATGTGTTACGCATGTGTGTAAATTGGATAAAATATGGATTCGATGTCGATCCGTATGCCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1809 bp · TkA06G076200|TK1151|CDS

ATGGATTCGATGTCGATCCGTATGCCCTACAAAAACCTCAGCCATGATATGGACGCTGAGGTTGAAATGATGAAATTCGAAGAAGAAGCTAACCGACGCGTGAATTCCGATACTTCTGATGTATTTCCAAATAGGATTGCTTCAAATTCTTCTTCTCCGTCGCAAGGATTGCCGCCGACGAATTGTAGCTTCATCACGTTGATTTTGAGCTGCACTGTTGCCGCCGGTGTTCAATTTGGATGGGCATTGCAACTCTCGCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

602 aa · TkA06G076200|TK1151|PROTEIN

MDSMSIRMPYKNLSHDMDAEVEMMKFEEEANRRVNSDTSDVFPNRIASNSSSPSQGLPPTNCSFITLILSCTVAAGVQFGWALQLSLLTPYIQTLGIGHAFSSFIWLCGPITGLVVQPCVGIWSDKCSSKYGRRRPFILIGSLMISLAVIIIGFSADIGYLFGDTKEHCSTFKGTRTRAAFVFILGFWMLDLANNTVQGPARALLADLAGPDQRNSANAIFCSWMAIGNILGFSSGASGNWHRWFPFLTNRACCEACGNL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G076200
TK1151 IDTkA06G076200
OH-1004 IDLXL04_025190
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G076200
位置Chr06:20457956-20462224 (-)
描述Similar to SUC3: Sucrose transport protein SUC3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g02860 负责将蔗糖运输到细胞中，并伴随着质子的摄取。
AtSUC3, a gene encoding a new Arabidopsis sucrose transporter, is expressed in cells adjacent to the vascular tissue and in a carpel cell layer.2000 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2000.00934.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B8AF63 负责将蔗糖运输到细胞中，并伴随着质子的摄取（对称运输系统）。 暂无已核实直接文献
Os02g0827200 负责将蔗糖运输到细胞中，并伴随着质子的摄取（对称运输系统）。 暂无已核实直接文献
UniProt: Q9LKH3 负责将蔗糖运输到细胞中，并伴随着质子的摄取（对称运输系统）。 暂无已核实直接文献
Os03g0170900 负责将蔗糖运输到细胞中，并伴随着质子的摄取。
Transport activity of rice sucrose transporters OsSUT1 and OsSUT5.2010 · DOI: 10.1093/pcp/pcp172
Disruption of a gene for rice sucrose transporter, OsSUT1, impairs pollen function but pollen maturation is unaffected.2010 · DOI: 10.1093/jxb/erq175
cDNA cloning and tissue specific expression of a gene for sucrose transporter from rice (Oryza sativa L.).1997 · DOI: 10.1093/oxfordjournals.pcp.a029134
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025190 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005985 sucrose metabolic process 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009846 pollen germination 生物过程
GO:0015768 maltose transport 生物过程
GO:0015770 sucrose transport 生物过程
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0090406 pollen tube 细胞组分
GO:0005364 maltose:proton symporter activity 分子功能
GO:0008506 sucrose:proton symporter activity 分子功能
GO:0008515 sucrose transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G02860
dosa:Os02g0827200
dosa:Os03g0170900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.413
排名 1 · TkA06G076200 · TK1151
细胞膜0.298
排名 2 · TkA06G076200 · TK1151
细胞质0.201
排名 3 · TkA06G076200 · TK1151
高尔基体0.134
排名 4 · TkA06G076200 · TK1151
内质网0.121
排名 5 · TkA06G076200 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07690MFS_173-544 aa
PF13347MFS_280-220 aa
PF03209PUCC116-232 aa
PF13347MFS_2361-395 aa
PF13347MFS_2439-524 aa
PF03209PUCC458-529 aa
PF07690MFS_1500-591 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G076200PF07690MFS_1735444.1e-1866.1
TkA06G076200PF13347MFS_2802204.2e-0729.6
TkA06G076200PF03209PUCC1162326e-0626.3
TkA06G076200PF13347MFS_23613954.2e-0729.6
TkA06G076200PF13347MFS_24395244.2e-0729.6
TkA06G076200PF03209PUCC4585296e-0626.3
TkA06G076200PF07690MFS_15005914.1e-1866.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O80605拟南芥sp|O80605|SUC3_ARATH Sucrose transport protein SUC368.000%Swiss-Prot高置信
B8AF63水稻sp|B8AF63|SUT4_ORYSI Sucrose transport protein SUT463.100%Swiss-Prot高置信
Q6YK44水稻sp|Q6YK44|SUT4_ORYSJ Sucrose transport protein SUT463.100%Swiss-Prot高置信
Q9LKH3水稻sp|Q9LKH3|SUT1_ORYSI Sucrose transport protein SUT156.500%Swiss-Prot高置信
Q10R54水稻sp|Q10R54|SUT1_ORYSJ Sucrose transport protein SUT156.500%Swiss-Prot高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看