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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G076040
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 20401029-20403934 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1450 bp · TkA06G076040|TK1151|cDNA

TTTTCGAGAAGGTATGTGTCATATATAGTATCTCCATTCTTTGTGTAATACAATAACAATATTCACACCTCCATTTCTCTCTTCTCTGTCTAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAACATGATGAAGAGACCACAAGGAAATCTTGGAATGTTTACACCTTTCATATAAGCAAAGCTATAGAGTTAGCTTAAACAGCTGATGACTTGCGCTGGAATGGCCTTCTTCTCTACCAATTTCATGTTACAG...

CDS

下载 CDS FASTA

954 bp · TkA06G076040|TK1151|CDS

ATGACTTGCGCTGGAATGGCCTTCTTCTCTACCAATTTCATGTTACAGTCCTCCCAAGAAGACGACCATCATGCCCCTAGTTCTCTCTCCCCGATTCTCCCACCTTGCACCACTACTCAAGATTTCAGTGGTGTGGCATCCTTCTTGGGGAAAAGGTCGATGTCTTTCTCGGGCATGAACAACATAGACGGATGCGATCAAGAAGCGAATATGAACGGAGAAGATGATTTGTCGGACGACGGATCGCAGCTTCTTGCCGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

317 aa · TkA06G076040|TK1151|PROTEIN

MTCAGMAFFSTNFMLQSSQEDDHHAPSSLSPILPPCTTTQDFSGVASFLGKRSMSFSGMNNIDGCDQEANMNGEDDLSDDGSQLLAGEKKRRLNMEQVKTLERNFELGNKLEPERKMQLARALGLQPRQIAIWFQNRRARWKTKQLEKDYDALKRQFEAVKAENDSLQSQNHKLHAEIMALKNREPTELINLNIKETEGSCSNRSENSSEIKLDISRTPATDSPLSSHQHQQHHQHHQQPIPNLFPSSNIERPNANNNNI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G076040
TK1151 IDTkA06G076040
OH-1004 IDLXL04_025193
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G076040
位置Chr06:20401029-20403934 (-)
描述Similar to ATHB-13: Homeobox-leucine zipper protein ATHB-13
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g69780 可能作为蔗糖信号通路作用的转录因子。 暂无已核实直接文献
At1g26960 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
At5g15150 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0170600 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2XD08 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025193 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009739 response to gibberellin 生物过程
GO:0009744 response to sucrose 生物过程
GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程
GO:0010311 lateral root formation 生物过程
GO:0022622 root system development 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0048527 lateral root development 生物过程
GO:0048768 root hair cell tip growth 生物过程
GO:0048826 cotyledon morphogenesis 生物过程
GO:0080022 primary root development 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G26960
ath:AT1G69780
ath:AT5G15150
dosa:Os03g0170600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.981
排名 1 · TkA06G076040 · TK1151
细胞质0.080
排名 2 · TkA06G076040 · TK1151
细胞膜0.020
排名 3 · TkA06G076040 · TK1151
内质网0.013
排名 4 · TkA06G076040 · TK1151
质体0.010
排名 5 · TkA06G076040 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF18035Bap31_Bap29_C75-89 aa
PF10224DUF220588-103 aa
PF00046Homeodomain89-142 aa
PF23177bHLH_IRO389-177 aa
PF12709Fungal_TACC91-116 aa
PF28743IPGAL2_N99-107 aa
PF05920Homeobox_KN113-140 aa
PF20681DUF6818129-175 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G076040PF18035Bap31_Bap29_C75890.09113.5
TkA06G076040PF10224DUF2205881030.1512.9
TkA06G076040PF00046Homeodomain891429e-1658.2
TkA06G076040PF23177bHLH_IRO3891770.1413.2
TkA06G076040PF12709Fungal_TACC911165.28.3
TkA06G076040PF28743IPGAL2_N991070.0116.3
TkA06G076040PF05920Homeobox_KN1131409.8e-0522.8
TkA06G076040PF20681DUF68181291750.1313.4
TkA06G076040PF19776DUF62621331740.1113.4
TkA06G076040PF08172CASP_C1351890.510.4
TkA06G076040PF21037CCDC138_cc1361810.02215.5
TkA06G076040PF29075NOCA1_mid1362020.04414.4
TkA06G076040PF17675APG6_N1412142.59.2
TkA06G076040PF24423OVT11421820.02315.8
TkA06G076040PF05377FlaC_arch1421790.05614.6
TkA06G076040PF10224DUF22051421760.1512.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LC03拟南芥sp|Q8LC03|ATB13_ARATH Homeobox-leucine zipper protein ATHB-1360.200%Swiss-Prot高置信
Q8LFD3拟南芥sp|Q8LFD3|ATB23_ARATH Homeobox-leucine zipper protein ATHB-2351.000%Swiss-Prot高置信
Q00466拟南芥sp|Q00466|HAT7_ARATH Homeobox-leucine zipper protein HAT742.600%Swiss-Prot中等置信
Q8S7W9水稻sp|Q8S7W9|HOX21_ORYSJ Homeobox-leucine zipper protein HOX2150.700%Swiss-Prot高置信
A2XD08水稻sp|A2XD08|HOX21_ORYSI Homeobox-leucine zipper protein HOX2165.600%Swiss-Prot中等置信

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