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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G075790
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 20329162-20330655 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1302 bp · TkA06G075790|TK1151|cDNA

AGATGCTCAACTATAATACTATATCTCTATATATAGCAACATCATAAGCTTCACTCAAACATATCCGAAACAGTTTCCAAGAAATCTTGATCAATAACCATGGCTTCCACTTCTAAAATGGTCTCAATTTTCATCATCTTCATCGCATTTCTATGCACCAAAGCCATGTCACAATGTGAAGACGAAACAAATAACCCTTGTAACAACAAATCCAAGGCTTTATCCTTAAAGATCATCGGGATCGCTGCCATCCTTGTCAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1047 bp · TkA06G075790|TK1151|CDS

ATGGCTTCCACTTCTAAAATGGTCTCAATTTTCATCATCTTCATCGCATTTCTATGCACCAAAGCCATGTCACAATGTGAAGACGAAACAAATAACCCTTGTAACAACAAATCCAAGGCTTTATCCTTAAAGATCATCGGGATCGCTGCCATCCTTGTCACAAGTATCATCGGCGTATGTCTACCTCTCATCACTCGTTCCATCCCCGCCCTTAGCCCAGAACGTAGCCTTTTTGTGATTGTGAAAGCTTTCGCTTCCGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

348 aa · TkA06G075790|TK1151|PROTEIN

MASTSKMVSIFIIFIAFLCTKAMSQCEDETNNPCNNKSKALSLKIIGIAAILVTSIIGVCLPLITRSIPALSPERSLFVIVKAFASGIILATGFMHVLPDSFDMLSSSCLSDNPWHKFPFTGFVAMLSAIFTLMVDSMATSMYTTKNNAISSEGVAPVTGDHEMAAGGGGGMHFHGHHHGQKAPIGAQLLRYRVVAMVLELGIVVHSIVIGLGVGASNDVCTIKPLVAALCFHQMFEGMGLGGCILQAEYKMVKKAVMVF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G075790
TK1151 IDTkA06G075790
OH-1004 IDLXL04_025198
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G075790
位置Chr06:20329162-20330655 (+)
描述Similar to ZIP10: Probable zinc transporter 10
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g31260 可能介导从根际吸收锌。 暂无已核实直接文献
At4g19690 高亲和力铁转运蛋白，在根际铁通过根表皮层质膜的吸收中发挥关键作用。
IRT1, an Arabidopsis transporter essential for iron uptake from the soil and for plant growth.2002 · DOI: 10.1105/tpc.001388
At5g45105 可能介导从根际吸收锌。 暂无已核实直接文献
At4g19680 高亲和力铁转运蛋白，在缺铁时介导从根际穿过根表皮层质膜的铁吸收。
Arabidopsis IRT2 gene encodes a root-periphery iron transporter.2001 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2001.01018.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0667500 铁转运蛋白参与从根际穿过根表皮层质膜吸收铁。
Rice plants take up iron as an Fe3+-phytosiderophore and as Fe2+.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02624.x
Over-expression of OsIRT1 leads to increased iron and zinc accumulations in rice.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-3040.2009.01935.x
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025198 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006826 iron ion transport 生物过程
GO:0006828 manganese ion transport 生物过程
GO:0006829 zinc ion transport 生物过程
GO:0006879 intracellular iron ion homeostasis 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0015675 nickel cation transport 生物过程
GO:0015691 cadmium ion transport 生物过程
GO:0030001 metal ion transport 生物过程
GO:0071577 zinc ion transmembrane transport 生物过程
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005769 early endosome 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G31260
ath:AT4G19680
ath:AT4G19690
dosa:Os03g0667500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.793
排名 1 · TkA06G075790 · TK1151
内质网0.082
排名 2 · TkA06G075790 · TK1151
细胞质0.071
排名 3 · TkA06G075790 · TK1151
溶酶体／液泡0.068
排名 4 · TkA06G075790 · TK1151
高尔基体0.036
排名 5 · TkA06G075790 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF06664WLS-like_TM7-110 aa
PF06687SUR78-39 aa
PF02535Zip42-345 aa
PF06687SUR777-162 aa
PF06664WLS-like_TM255-298 aa
PF06687SUR7257-336 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G075790PF06664WLS-like_TM71103.17.8
TkA06G075790PF06687SUR78390.04614.1
TkA06G075790PF02535Zip423451.3e-81275.0
TkA06G075790PF06687SUR7771620.04614.1
TkA06G075790PF06664WLS-like_TM2552983.17.8
TkA06G075790PF06687SUR72573360.04614.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8W245拟南芥sp|Q8W245|ZIP10_ARATH Probable zinc transporter 1064.000%Swiss-Prot高置信
Q38856拟南芥sp|Q38856|IRT1_ARATH Fe(2+) transport protein 160.400%Swiss-Prot高置信
Q8S3W4拟南芥sp|Q8S3W4|ZIP8_ARATH Probable zinc transporter 861.200%Swiss-Prot高置信
O81850拟南芥sp|O81850|IRT2_ARATH Fe(2+) transport protein 258.700%Swiss-Prot高置信
Q75HB1水稻sp|Q75HB1|IRT1_ORYSJ Fe(2+) transport protein 158.200%Swiss-Prot高置信

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