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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G075760
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 20303149-20305540 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1841 bp · TkA06G075760|TK1151|cDNA

AAAAAGTTCATCCATAATGGATGCTCTAAACTAGTCGCTAAAAATTGAATCATTAAATACTTATTACCTTAAATTGATCATTTTTATTTGATCTGGGTATATATATTCTTGCTCAGAACTCATTCATGAAAAAGCTAGACCATGTCATTTTCACAAAATTATGTTAGACTAATCGTCTCAATGTTGCTGCTCATACTAGTACATCATGCAGCTACAGATTGGGTGAATCATGGAGGAGGTATAGATAACCGGAGATTTGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1581 bp · TkA06G075760|TK1151|CDS

ATGTCATTTTCACAAAATTATGTTAGACTAATCGTCTCAATGTTGCTGCTCATACTAGTACATCATGCAGCTACAGATTGGGTGAATCATGGAGGAGGTATAGATAACCGGAGATTTGCCACCGACGAGCTTCTGATCAACCCTTCGACGGTGCACAAACTCAAGCTACGATGGAAGTTTTTCACCGGTAAAGACATATCAGCGACGCCAGCCATCGCCGGTGGAGTTGTGTACTTTCCGTCATGGAACGGGTTCTTGTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

526 aa · TkA06G075760|TK1151|PROTEIN

MSFSQNYVRLIVSMLLLILVHHAATDWVNHGGGIDNRRFATDELLINPSTVHKLKLRWKFFTGKDISATPAIAGGVVYFPSWNGFLYAVNAFTGALIWQQNLGQLTGLPGTGTYVNVSVSRATPVVTRNLLIVGIYGPAVVIAVNLASGKLVWSTTIDPRPLALITASGTVYSRGFYVGVSSLEETLPADKCCTFRGSLVKLDTRSGAIQWQTYTVPDNVGQLGGYSGGAIWGSSPAIDVSRGIVYVATGNLYTAPPEVL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G075760
TK1151 IDTkA06G075760
OH-1004 IDLXL04_025199
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G075760
位置Chr06:20303149-20305540 (-)
描述Similar to pvaA: Polyvinylalcohol dehydrogenase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025199 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0022904 respiratory electron transport chain 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0005509 calcium ion binding 分子功能
GO:0009055 electron transfer activity 分子功能
GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能
GO:0016614 oxidoreductase activity, acting on CH-OH group of donors 分子功能
GO:0020037 heme binding 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
GO:0047059 polyvinyl alcohol dehydrogenase (cytochrome) activity 分子功能
GO:0070968 pyrroloquinoline quinone binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ag:BAC15559
ag:BAD95543
ag:CAA57464
gox:GOX1068
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞外0.567
排名 1 · TkA06G075760 · TK1151
溶酶体／液泡0.141
排名 2 · TkA06G075760 · TK1151
细胞质0.121
排名 3 · TkA06G075760 · TK1151
内质网0.074
排名 4 · TkA06G075760 · TK1151
细胞膜0.066
排名 5 · TkA06G075760 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01011PQQ27-373 aa
PF13570Beta-prop_ACSF452-103 aa
PF13360PQQ_257-301 aa
PF07774EMC1_C77-153 aa
PF23727Beta-prop_FAM234A_B85-101 aa
PF03413PepSY87-97 aa
PF25293Beta-prop_EMC1_N90-177 aa
PF13570Beta-prop_ACSF4122-213 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G075760PF01011PQQ273731.9e-2383.7
TkA06G075760PF13570Beta-prop_ACSF4521033.8e-1660.1
TkA06G075760PF13360PQQ_2573013.5e-2383.2
TkA06G075760PF07774EMC1_C771535.4e-0833.4
TkA06G075760PF23727Beta-prop_FAM234A_B851010.02913.6
TkA06G075760PF03413PepSY87970.1912.8
TkA06G075760PF25293Beta-prop_EMC1_N901770.003217.6
TkA06G075760PF13570Beta-prop_ACSF41222133.8e-1660.1
TkA06G075760PF07774EMC1_C1942255.4e-0833.4
TkA06G075760PF23727Beta-prop_FAM234A_B1952140.02913.6
TkA06G075760PF13360PQQ_21973743.5e-2383.2
TkA06G075760PF25293Beta-prop_EMC1_N1992220.003217.6
TkA06G075760PF13570Beta-prop_ACSF42342493.8e-1660.1
TkA06G075760PF07774EMC1_C2883065.4e-0833.4
TkA06G075760PF13570Beta-prop_ACSF42893073.8e-1660.1
TkA06G075760PF25293Beta-prop_EMC1_N2893060.003217.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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