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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G070390
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 18858673-18862310 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1801 bp · TkA06G070390|TK1151|cDNA

GGAAAATTGGTTGTATTTGTCGTGCTTATTGAATTGTACGGTACGACCTCAGTAGGCATTGGTAGAAAGATAATACGGTGACCCGGACGTTGAAACTTGAAGTTATGCAAGAAGGTTCTTGTATCTCCAACGGAGCTGAAGACCCATAAGAACTTAGAAGATTTAAGTCAAAATTCACGATTCCCGCTTGCGAACAGAGATCGAAACCTTCAGCTCATATGCTATTCTGAAGCTTTTGATCCAGAAAACACAGCCCTACC...

CDS

下载 CDS FASTA

873 bp · TkA06G070390|TK1151|CDS

ATGGCGAGATGGTCTTGCGATTTCAGATACCTTCTTGTCCTTGTTGTACTCGCATTCATATATACCCAGGTGAAGCTGTTTACCACTGAATCTGAGTACGTCGATGCACTTGAAACTGCAGTGGAAGCAGAAAATCGTTGCAGGAATAAAATGCGGTTGCTAATTGATGAAATCAGCATGAATCAGGAAAATATTGTGGTTTTGAAAGAAAAAGTAAAACTCCAAGAAAAGGAATGTGAATATCTGAGGACACTTGTTCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

290 aa · TkA06G070390|TK1151|PROTEIN

MARWSCDFRYLLVLVVLAFIYTQVKLFTTESEYVDALETAVEAENRCRNKMRLLIDEISMNQENIVVLKEKVKLQEKECEYLRTLVQKLEKKGVKSLTREEQVPVAAVVIMACNRADYLERTIKSILKYHSSVASKFPVFVSQDGSNSDVREKAMTYGQLNYMQHLDYKPVHTERPGELIAYYKIARHYKWALDQLFYQHNFNRVIILEDDMEISPDFFDYFEAGAGLLDKDKSIMAISSWNDNGQKQYVHDPYMLYRSD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G070390
TK1151 IDTkA06G070390
OH-1004 IDLXL04_009718
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)80.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.241 / OH-1004 66.825
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G070390
位置Chr06:18858673-18862310 (-)
描述Similar to GNTI: Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g38240 启动复杂的 N-连接碳水化合物形成。
Salt tolerance of Arabidopsis thaliana requires maturation of N-glycosylated proteins in the Golgi apparatus.2008 · DOI: 10.1073/pnas.0800237105
Comparative analyses of Arabidopsis complex glycan1 mutants and genetic interaction with staurosporin and temperature sensitive3a.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.127027

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009718 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006013 mannose metabolic process 生物过程
GO:0006487 protein N-linked glycosylation 生物过程
GO:0006491 N-glycan processing 生物过程
GO:0006972 hyperosmotic response 生物过程
GO:0019082 viral protein processing 生物过程
GO:0033499 galactose catabolic process via UDP-galactose, Leloir pathway 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005797 Golgi medial cisterna 细胞组分
GO:0005802 trans-Golgi network 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G38240
hsa:4245
mmu:17308
ocu:100009521
rno:81519
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.738
排名 1 · TkA06G070390 · TK1151
内质网0.186
排名 2 · TkA06G070390 · TK1151
细胞质0.098
排名 3 · TkA06G070390 · TK1151
细胞外0.062
排名 4 · TkA06G070390 · TK1151
细胞膜0.055
排名 5 · TkA06G070390 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12234Rav1p_C12-111 aa
PF03071GNT-I16-283 aa
PF08336P4Ha_N24-64 aa
PF12302DUF362928-80 aa
PF13641Glyco_tranf_2_331-45 aa
PF27823SCD2_helical_N54-98 aa
PF08336P4Ha_N60-101 aa
PF18504Csm1_N62-102 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G070390PF12234Rav1p_C121110.09311.8
TkA06G070390PF03071GNT-I162831.8e-104350.7
TkA06G070390PF08336P4Ha_N24640.610.6
TkA06G070390PF12302DUF362928800.03614.2
TkA06G070390PF13641Glyco_tranf_2_331450.1312.6
TkA06G070390PF27823SCD2_helical_N54980.06314.2
TkA06G070390PF08336P4Ha_N601010.610.6
TkA06G070390PF18504Csm1_N621020.2512.4
TkA06G070390PF01755Glyco_transf_2563940.08713.4
TkA06G070390PF11598COMP67870.1313.4
TkA06G070390PF20216DUF6576851020.2412.3
TkA06G070390PF13641Glyco_tranf_2_31061560.1312.6
TkA06G070390PF00535Glycos_transf_21081895.8e-0523.8
TkA06G070390PF01755Glyco_transf_251972240.08713.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9XGM8拟南芥sp|Q9XGM8|MGAT1_ARATH Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase66.300%Swiss-Prot高置信

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