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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA06G067740
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 18133113-18134551 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1151 bp · TkA06G067740|TK1151|cDNA

ATCAACCCCGTAGGCTTTCTTTTATTTTTATTTTAGAAATACGACCCCCTCTCCTTTCCGGGAATCTCTCTACCAGTGGTCCATCTTCTTCGATCATTTTTTTATCCATGGTTATATAATCCCCGTTTCCAAGATTTCCCTTTCGCCGCAAATCTCCATCGTCACCATCAATTTCTACTGCTGAATTGAACAATTCTTTCAGTCCTAGGGTTTCTTCACCGGTAAATTTCTTCAATAGGGTTTATATTCGGGAAGCAATG...

663 bp · TkA06G067740|TK1151|CDS

ATGGATGATGGAGAGCTCGATTTCTCCAACCACGAGATGTTTGTCGGTGATATTCCGAGCAATGGTTCCATGAACACTTTCTTCGATGAACTCTTCAACGACACACGCGCGTGTACTCATACGCACACATGCAACCCGCCGGGGCCCGATTCCTCCCACACTCACACATGCTACCATGTCCACACCAAAATCCTCCCCGCTACGAGCGACGATGACAAAACCCCGACGGAAGACACCGCCGAATCCACCGACAAAAAAGG...

220 aa · TkA06G067740|TK1151|PROTEIN

MDDGELDFSNHEMFVGDIPSNGSMNTFFDELFNDTRACTHTHTCNPPGPDSSHTHTCYHVHTKILPATSDDDKTPTEDTAESTDKKGKKRPSGNREAVRKYREKKKARTASLEDEVVRLRTLNQQLMRRVQSQVGLEGEVARLKCLLVDIRGRIDGEIGSFPYQKHHPSNQSFVNPCNMQGGALMHHDLDINGCDFEDLQCLGNQGLIPNQSAKNKRKAR

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G067740
TK1151 IDTkA06G067740
OH-1004 IDLXL04_025317
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.091 / OH-1004 83.525
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G067740
位置Chr06:18133113-18134551 (+)
描述Similar to BZIP19: Basic leucine zipper 19
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_025317 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0010043 response to zinc ion 生物过程
GO:0042538 hyperosmotic salinity response 生物过程
GO:1901001 negative regulation of response to salt stress 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0000978 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding 分子功能
GO:0000981 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G16770
ath:AT3G51960
ath:AT4G35040
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞核0.983
排名 1 · TkA06G067740 · TK1151
细胞质0.076
排名 2 · TkA06G067740 · TK1151
细胞膜0.022
排名 3 · TkA06G067740 · TK1151
内质网0.014
排名 4 · TkA06G067740 · TK1151
质体0.007
排名 5 · TkA06G067740 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07716bZIP_283-131 aa
PF00170bZIP_186-132 aa
PF27978ZNF318_helical93-133 aa
PF14077WDR18_C103-126 aa
PF14077WDR18_C136-144 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G067740PF07716bZIP_2831311.1e-1351.7
TkA06G067740PF00170bZIP_1861322.2e-0731.6
TkA06G067740PF27978ZNF318_helical931330.003418.5
TkA06G067740PF14077WDR18_C1031260.06213.9
TkA06G067740PF14077WDR18_C1361440.06213.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GTS2拟南芥sp|Q8GTS2|BZP23_ARATH Basic leucine zipper 2354.900%Swiss-Prot高置信
Q8VY76拟南芥sp|Q8VY76|BZP19_ARATH Basic leucine zipper 1952.400%Swiss-Prot高置信
Q8GTS1拟南芥sp|Q8GTS1|BZP24_ARATH Basic leucine zipper 2440.100%Swiss-Prot中等置信

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