基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA06G051570
当前版本: TK1151
染色体: Chr06
坐标: 14004451-14010441
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA5842 bp · TkA06G051570|TK1151|cDNA
ATTAAAAGCGCGGAAGAAAAGGTCTAAGCACGCGGCCACATGGCCCCATCATCTCCAGCTTTTGTATTCATTTCTCCCCAAATGTAAAACCTTACCTTACAAGTTACAACCCTCACTACTCCCATAGTCAAATTGTGTTCTCCGATTCACGATGACCCACCGGCAGCGTCCTCCGCCGTCGCCGGAACCCGACCTATCTGACGTATCCCCCTATAACATCATCCCAATCCACAATTTGCTAGCAGATCACCCATCCCTCC...
CDS
下载 CDS FASTA5259 bp · TkA06G051570|TK1151|CDS
ATGACCCACCGGCAGCGTCCTCCGCCGTCGCCGGAACCCGACCTATCTGACGTATCCCCCTATAACATCATCCCAATCCACAATTTGCTAGCAGATCACCCATCCCTCCGCTTCCCAGAAGTCCGTGCCGCCACCGCTGCATTACGAGCTGTTGGTGACCTCCGCAGACCACCCTTCATCCCATGGCAACCTCACTACGACCTCCTCGACTGGCTCGGCGCCTTCTTCGGTTTCCAATCCGACAACGTTTCGAACCAGCG...
1752 aa · TkA06G051570|TK1151|PROTEIN
MTHRQRPPPSPEPDLSDVSPYNIIPIHNLLADHPSLRFPEVRAATAALRAVGDLRRPPFIPWQPHYDLLDWLGAFFGFQSDNVSNQREHLVLHLANAQMRLQPPPDNIDTLDPSVLRRFRRKLLSNYTHWCSFLGRKSNIWISDSRRQYSASDYRRELLYVSLYLLIWGESANLRFIPECICYIFHHMAMELNRILEDYIDENTGRPVLPSISGENAFLNRVVKPIYDTVKAEVANSRNGTAPHSNWRNYDDINEYFWSR...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA06G051570 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA06G051570 |
| OH-1004 ID | LXL04_025558 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / Strict |
| 蛋白一致性 (%) | 99.800 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 98.288 / OH-1004 94.201覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA06G051570 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr06:14004451-14010441 (-) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to CALS12: Callose synthase 12 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0002758 innate immune response-activating signaling pathway 生物过程 GO:0006075 (1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process 生物过程 GO:0006952 defense response 生物过程 GO:0007623 circadian rhythm 生物过程 GO:0008360 regulation of cell shape 生物过程 GO:0009555 pollen development 生物过程 GO:0009556 microsporogenesis 生物过程 GO:0009620 response to fungus 生物过程 GO:0009846 pollen germination 生物过程 GO:0009860 pollen tube growth 生物过程 GO:0009863 salicylic acid mediated signaling pathway 生物过程 GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G13680 ath:AT2G31960 ath:AT4G03550 ath:AT4G04970 ath:AT5G13000 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.651
内质网0.195
细胞质0.111
高尔基体0.101
溶酶体／液泡0.086
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF14288FKS1_dom1157-269 aaPF30929DUF8762357-406 aaPF02364Glucan_synthase377-440 aaPF25968CALS1684-862 aaPF02364Glucan_synthase870-1648 aaPF30929DUF87621596-1645 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA06G051570 | PF14288 | FKS1_dom1 | 157 | 269 | 4.6e-45 | 153.2 |
| TkA06G051570 | PF30929 | DUF8762 | 357 | 406 | 0.0086 | 16.4 |
| TkA06G051570 | PF02364 | Glucan_synthase | 377 | 440 | 5.6e-257 | 855.8 |
| TkA06G051570 | PF25968 | CALS1 | 684 | 862 | 6.4e-32 | 111.5 |
| TkA06G051570 | PF02364 | Glucan_synthase | 870 | 1648 | 5.6e-257 | 855.8 |
| TkA06G051570 | PF30929 | DUF8762 | 1596 | 1645 | 0.0086 | 16.4 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9ZT82 | 拟南芥 | sp|Q9ZT82|CALSC_ARATH Callose synthase 12 | 73.200% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9S9U0 | 拟南芥 | sp|Q9S9U0|CALSB_ARATH Callose synthase 11 | 67.800% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q3B724 | 拟南芥 | sp|Q3B724|CALS5_ARATH Callose synthase 5 | 47.500% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9LXT9 | 拟南芥 | sp|Q9LXT9|CALS3_ARATH Callose synthase 3 | 46.300% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9AUE0 | 拟南芥 | sp|Q9AUE0|CALS1_ARATH Callose synthase 1 | 45.800% | Swiss-Prot | 中等置信 |