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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA06G034760
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 9376108-9378249 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1171 bp · TkA06G034760|TK1151|cDNA

AAGCAGATCCTCCTCCTCTCTCCCCCTCTTTATTCAAACAATTTCGCATTTCCTCTTCCGTTTGTCTGCCCCCATTCTCTATATTCCTGTATCCAAATCCAGTTTTCTCTCTCTAGAATCCGTTGCTCTCTCATGGCAATCGCACCAGAAACGCAGGTTCAACAAACGGCTAATGAAGAGGCAGCAGCAGAAAAGAAGAGGTGGACGCTTAATGACTTCGACATCGGGAAGCCACTGGGAAGGGGAAAATTTGGCCATGT...

1011 bp · TkA06G034760|TK1151|CDS

AAGCAGATCCTCCTCCTCTCTCCCCCTCTTTATTCAAACAATTTCGCATTTCCTCTTCCGTTTGTCTGCCCCCATTCTCTATATTCCTGTATCCAAATCCAGTTTTCTCTCTCTAGAATCCGTTGCTCTCTCATGGCAATCGCACCAGAAACGCAGGTTCAACAAACGGCTAATGAAGAGGCAGCAGCAGAAAAGAAGAGGTGGACGCTTAATGACTTCGACATCGGGAAGCCACTGGGAAGGGGAAAATTTGGCCATGT...

336 aa · TkA06G034760|TK1151|PROTEIN

KQILLLSPPLYSNNFAFPLPFVCPHSLYSCIQIQFSLSRIRCSLMAIAPETQVQQTANEEAAAEKKRWTLNDFDIGKPLGRGKFGHVYIAREKRSNHIVALKVLFKSQLKQSQVEHQLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFYDQKRVYLILEYAAKGELYKELQRCKHFSERRAATYVASLARALIYCHGKHVIHRDIKPENLLIGAQGELKIADFGWSVHTFNRRQTMCGTLDYLPPEMVESTEHDSSVDIWSLGILCYE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G034760
TK1151 IDTkA06G034760
OH-1004 IDLXL04_025901
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 86.905 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G034760
位置Chr06:9376108-9378249 (+)
描述Similar to AUR1: Serine/threonine-protein kinase Aurora-1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g32830 在体外特异性磷酸化组蛋白 H3 的“Ser-10”,并在有丝分裂过程中与磷酸化组蛋白 H3 共定位。
At2g25880 在体外特异性磷酸化组蛋白H3的'Ser-10'位点。
At2g45490 在体外磷酸化组蛋白 H3 的“Ser-10” 和“Ser-28”,但不在“Thr-3” 或“Thr-11” 处磷酸化。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_025901 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0000212 meiotic spindle organization 生物过程
GO:0000226 microtubule cytoskeleton organization 生物过程
GO:0000278 mitotic cell cycle 生物过程
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0007051 spindle organization 生物过程
GO:0007052 mitotic spindle organization 生物过程
GO:0007057 spindle assembly involved in female meiosis I 生物过程
GO:0007098 centrosome cycle 生物过程
GO:0007100 mitotic centrosome separation 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009948 anterior/posterior axis specification 生物过程
GO:0010629 negative regulation of gene expression 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G25880
ath:AT2G45490
ath:AT4G32830
bta:504437
mmu:20878
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.553
排名 1 · TkA06G034760 · TK1151
细胞核0.482
排名 2 · TkA06G034760 · TK1151
细胞膜0.102
排名 3 · TkA06G034760 · TK1151
内质网0.060
排名 4 · TkA06G034760 · TK1151
线粒体0.058
排名 5 · TkA06G034760 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03109ABC148-106 aa
PF00069Pkinase74-324 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr75-320 aa
PF14531Kinase-like77-120 aa
PF10707YrbL-PhoP_reg78-210 aa
PF01636APH114-184 aa
PF03109ABC1145-228 aa
PF14531Kinase-like167-267 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G034760PF03109ABC1481068.7e-0625.8
TkA06G034760PF00069Pkinase743241.2e-75255.1
TkA06G034760PF07714PK_Tyr_Ser-Thr753207.8e-43147.4
TkA06G034760PF14531Kinase-like771200.00119.1
TkA06G034760PF10707YrbL-PhoP_reg782100.1512.4
TkA06G034760PF01636APH1141840.1412.6
TkA06G034760PF03109ABC11452288.7e-0625.8
TkA06G034760PF14531Kinase-like1672670.00119.1
TkA06G034760PF01636APH1922100.1412.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M077拟南芥sp|Q9M077|AUR1_ARATH Serine/threonine-protein kinase Aurora-187.000%Swiss-Prot高置信
Q683C9拟南芥sp|Q683C9|AUR2_ARATH Serine/threonine-protein kinase Aurora-288.600%Swiss-Prot高置信
O64629拟南芥sp|O64629|AUR3_ARATH Serine/threonine-protein kinase Aurora-362.400%Swiss-Prot高置信

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