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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G032000
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 8709002-8714421 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2916 bp · TkA06G032000|TK1151|cDNA

AAACGATTATCGGATTATCGGTCGGTGAAAAAAGATAAAGCTACTAAGCTAGTCGAATTACAAGTAACAGTCGGTCACTAGCTTAATATTTACGATATGTACAAGTAGCAAAACAACATATACGAGTACTTCATGCACAGAAAAGAAGGATGACCGGAATAGCTTCATACAAAGGAGCGAAGGAAGCAGGTCGGTAGCTCCGGCAATAACAAGCAGAAAATGCTCCCGTCCTGCTTGGGGCTTCTTTTCTTTTAGTTTCG...

CDS

下载 CDS FASTA

1629 bp · TkA06G032000|TK1151|CDS

ATGGGGATCCCGATCACGATCAGAAAGAAGCCTGATAAAGGGAAATACAAGGCACTTGGAAAATATGGCAAGGATATGACGGAATGTGCTAGAAGCGGTGACGTGGATCCAGTTATAGGCCGGGATAATGAAATCCAGAGGTGCATCCAGATATTGGCTAAAAGGTTAAAAAACAATCCTGTTATAATTGGTGAGCCTGGCGTGGGGAAAACCGCTATAGCAGAAGGGTTAGCTCAACGAATTGTTCGTGGAGATGTTCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

542 aa · TkA06G032000|TK1151|PROTEIN

MGIPITIRKKPDKGKYKALGKYGKDMTECARSGDVDPVIGRDNEIQRCIQILAKRLKNNPVIIGEPGVGKTAIAEGLAQRIVRGDVPDHLKNAKLISLNMGSLVAGAKHQGDFEQQLISVLKEVTDSNGQIVLFIDEIHAIVGAGAMDAGNIMKPMLGRGELRCIGATTLNEYRKYIEKDSALERRFQQVICNEVSVQDTVFILRGLRERYEVHHGVIISDSAIVSAAVLADRYITQRFLPDKAIDLVDEAAATLKMEMS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G032000
TK1151 IDTkA06G032000
OH-1004 IDLXL04_026010
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)75.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.941 / OH-1004 54.021
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G032000
位置Chr06:8709002-8714421 (-)
描述Similar to CLPB4: Chaperone protein ClpB4, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g25140 似乎不参与热应激反应或耐受的分子伴侣。
The Arabidopsis ClpB/Hsp100 family of proteins: chaperones for stress and chloroplast development.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02940.x
At5g15450 对叶绿体发育和幼苗活力至关重要的分子伴侣。
An Arabidopsis chloroplast-targeted Hsp101 homologue, APG6, has an essential role in chloroplast development as well as heat-stress response.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02873.x
The Arabidopsis ClpB/Hsp100 family of proteins: chaperones for stress and chloroplast development.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02940.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0181900 分子伴侣，可能不参与热应激反应或耐受性。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026010 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009658 chloroplast organization 生物过程
GO:0034605 cellular response to heat 生物过程
GO:0042026 protein refolding 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009532 plastid stroma 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ana:alr5084
ath:AT2G25140
ath:AT5G15450
dosa:Os02g0181900
dosa:Os03g0426900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.591
排名 1 · TkA06G032000 · TK1151
细胞核0.389
排名 2 · TkA06G032000 · TK1151
细胞膜0.084
排名 3 · TkA06G032000 · TK1151
线粒体0.070
排名 4 · TkA06G032000 · TK1151
内质网0.056
排名 5 · TkA06G032000 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13191AAA_1638-84 aa
PF00158Sigma54_activat39-101 aa
PF25201nSTAND639-85 aa
PF01637ATPase_241-145 aa
PF03193RsgA_GTPase41-80 aa
PF23569NBD_SMAX143-142 aa
PF02367TsaE43-81 aa
PF01078Mg_chelatase44-100 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G032000PF13191AAA_1638842e-0938.9
TkA06G032000PF00158Sigma54_activat391012.2e-0731.4
TkA06G032000PF25201nSTAND639850.001319.5
TkA06G032000PF01637ATPase_2411450.0001522.3
TkA06G032000PF03193RsgA_GTPase41800.0006120.4
TkA06G032000PF23569NBD_SMAX1431428.8e-0936.2
TkA06G032000PF02367TsaE43810.0006220.4
TkA06G032000PF01078Mg_chelatase441003.9e-0523.9
TkA06G032000PF20720nSTAND345831.4e-0732.0
TkA06G032000PF13177DNA_pol3_delta253830.01715.9
TkA06G032000PF04851ResIII55810.000222.0
TkA06G032000PF01695IstB_IS21561225.8e-0730.0
TkA06G032000PF01057Parvo_NS156810.04713.4
TkA06G032000PF12775AAA_7571248.8e-0626.1
TkA06G032000PF13555AAA_2957740.03214.7
TkA06G032000PF00270DEAD57750.113.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8VYJ7拟南芥sp|Q8VYJ7|CLPB4_ARATH Chaperone protein ClpB4, mitochondrial73.200%Swiss-Prot高置信
Q9LF37拟南芥sp|Q9LF37|CLPB3_ARATH Chaperone protein ClpB3, chloroplastic67.000%Swiss-Prot高置信
Q0E3C8水稻sp|Q0E3C8|CLPB3_ORYSJ Chaperone protein ClpB3, mitochondrial72.300%Swiss-Prot高置信

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