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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G031640
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 8598764-8601413 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1945 bp · TkA06G031640|TK1151|cDNA

GCCCCTCCATAATGTGTGGTCTAAAACGGTGCTCCAACACTACAAGCGAAAGACAAAGACCGATCCTTCTTTCTCTCAAAATGCCTTCCACTTTTCTTCCCCAAATCATTCTCAACTATCGCACACATGGCTCTCCTGCTGCAACACCCATTTCTCTTCCACAACTCTTCGTATCTCACCACATACAAAACGGTCAAAACCCCTACGATCACCCTATCCCAGACCTCAAAATCAACAGCCTTCAGGAAATCCACGAAATG...

CDS

下载 CDS FASTA

1608 bp · TkA06G031640|TK1151|CDS

ATGGCTCTCCTGCTGCAACACCCATTTCTCTTCCACAACTCTTCGTATCTCACCACATACAAAACGGTCAAAACCCCTACGATCACCCTATCCCAGACCTCAAAATCAACAGCCTTCAGGAAATCCACGAAATGGGATGTGAAGTGTACGGCGGTGGTCGCACCAGAGATCGGCAGTGGGAGCAATGAAGATGTACTTGTTAGCGAGGAGAAAGGGAGAGTAGACGTTGTGGATTATGATTGGACCGAGGAATGGTACCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

535 aa · TkA06G031640|TK1151|PROTEIN

MALLLQHPFLFHNSSYLTTYKTVKTPTITLSQTSKSTAFRKSTKWDVKCTAVVAPEIGSGSNEDVLVSEEKGRVDVVDYDWTEEWYPLYLAKNIPEDAPLGLTVFDKQVVLYRDGKGELQCYEDRCPHRLAKLSEGQIVDGRLECLYHGWQFEGDGKCVKIPQLPADAKIPRSACTKTYEVKDSQGVIWIWMSHKTPPNPAKIPWFENFARPGFKDFSTTHELPYDHSILLENLMDPAHVPISHDRTDWSAKREDAQPLR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G031640
TK1151 IDTkA06G031640
OH-1004 IDLXL04_026015
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G031640
位置Chr06:8598764-8601413 (-)
描述Similar to TIC55: Protein TIC 55, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g24820 参与蛋白质前体输入叶绿体。
In vivo studies on the roles of Tic55-related proteins in chloroplast protein import in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1093/mp/ssp079

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0146400 催化叶绿素分解代谢、脱镁叶绿酸 a (pheide a) 的卟啉大环裂解为初级荧光分解代谢物 (pFCC) 的关键反应。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026015 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009812 flavonoid metabolic process 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0010154 fruit development 生物过程
GO:0012501 programmed cell death 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0015996 chlorophyll catabolic process 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0045036 protein targeting to chloroplast 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G24820
ath:AT3G44880
osa:4331611
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.956
排名 1 · TkA06G031640 · TK1151
线粒体0.050
排名 2 · TkA06G031640 · TK1151
细胞核0.022
排名 3 · TkA06G031640 · TK1151
细胞质0.020
排名 4 · TkA06G031640 · TK1151
细胞膜0.013
排名 5 · TkA06G031640 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24712YxiG_27-96 aa
PF00355Rieske84-166 aa
PF19112VanA_C227-401 aa
PF08417PaO289-374 aa
PF24712YxiG_2455-477 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G031640PF24712YxiG_27960.1612.8
TkA06G031640PF00355Rieske841662.4e-2589.0
TkA06G031640PF19112VanA_C2274014.6e-0524.4
TkA06G031640PF08417PaO2893745.6e-2484.8
TkA06G031640PF24712YxiG_24554770.1612.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SK50拟南芥sp|Q9SK50|TIC55_ARATH Protein TIC 55, chloroplastic76.000%Swiss-Prot高置信
Q0DV66水稻sp|Q0DV66|PAO_ORYSJ Pheophorbide a oxygenase, chloroplastic28.400%Swiss-Prot低置信

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