TkA05G463790 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA05G463790

当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 116164820-116167885 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1420 bp · TkA05G463790|TK1151|cDNA

CTTAAGCCGTTAACTGCATCAACATAAACACAACGTCCACCGCTGGAAAGTGGAAACCACCCAAACTTGCTTTGTTGGATCTTCTAGTTCAAAATTGCCATTTCGTGAAATATCAGTGCAGAGAAAATGATTCTGGCGTAAAACCAGCTTGTAAACAATCTACTCAAAGAACACATTGAAAGGAGTATCAGCAGTTGATTCATCCGTAGATCTCAAACGACCTCCAGTATGCAACTATTAGAGGATCCAGTTCAGAGATA...

CDS

下载 CDS FASTA

912 bp · TkA05G463790|TK1151|CDS

ATGTCTCGCACAATGTTTTCAAGGAGTCTATCCCGACTACAACACTTATCCAGACACGGTGGTCTTTCCGGCCATAGTTCAAGCCCTAATTTCAAACGTGCAGTTCTCACAGCTTTCCAGCCCCTTCTTCACAATAGGCCTTATGCCAACACTCCTCAACATGCGGCTTCTACTTCTTCTTTGAACCAAACTGAACTAGCTAAATTTGCAGCCATAGCTGACAGTTGGTGGGATGCTGAAGGGCCTTTTAAGCCATTGCA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

303 aa · TkA05G463790|TK1151|PROTEIN

MSRTMFSRSLSRLQHLSRHGGLSGHSSSPNFKRAVLTAFQPLLHNRPYANTPQHAASTSSLNQTELAKFAAIADSWWDAEGPFKPLHVMNPTRLAFIRSTLCRHFGKDPFSARPFEGLKFIDVGCGGGILSEPLARMGASVTGIDAVDKNIKIARLHADLDPIASSIEYRCTTAENLVEEQKKFDAVIALEVIEHVADPAEFCKSLSALTVSNGATVISTINRSMRAYATAIVAAEYILHWLPKGTHQWSSFLTPEELVL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA05G463790`
TK1151 ID	TkA05G463790
OH-1004 ID	LXL04_022374
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	91.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 22.112 / OH-1004 26.172 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA05G463790

位置 Chr05:116164820-116167885 (-)

描述 Similar to COQ3: Ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase, mitochondrial

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g30920`	泛醌生物合成过程中两个非连续步骤所需的O-甲基转移酶。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022374 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006744 ubiquinone biosynthetic process 生物过程

GO:0032259 methylation 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005740 mitochondrial envelope 细胞组分

GO:0031314 extrinsic component of mitochondrial inner membrane 细胞组分

GO:0010420 polyprenyldihydroxybenzoate methyltransferase activity 分子功能

GO:0046872 metal ion binding 分子功能

GO:0061542 3-demethylubiquinol 3-O-methyltransferase activity 分子功能

GO:0102208 2-polyprenyl-6-hydroxyphenol methylase activity 分子功能

GO:0120537 3-demethylubiquinone 3-O-methyltransferase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G30920

mag:amb1611

rpc:RPC_0515

rpe:RPE_0157

rru:Rru_A0742

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.946

排名 1 · TkA05G463790 · TK1151

细胞质0.059

排名 2 · TkA05G463790 · TK1151

细胞核0.049

排名 3 · TkA05G463790 · TK1151

细胞膜0.015

排名 4 · TkA05G463790 · TK1151

质体0.011

排名 5 · TkA05G463790 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13489Methyltransf_23109-265 aa

PF08003Methyltransf_9114-221 aa

PF01209Ubie_methyltran115-201 aa

PF13847Methyltransf_31116-248 aa

PF02353CMAS116-230 aa

PF05219DREV116-221 aa

PF13679Methyltransf_32117-190 aa

PF06325PrmA119-221 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA05G463790	`PF13489`	Methyltransf_23	109	265	1.7e-19	70.9
TkA05G463790	`PF08003`	Methyltransf_9	114	221	0.037	13.7
TkA05G463790	`PF01209`	Ubie_methyltran	115	201	0.0043	17.2
TkA05G463790	`PF13847`	Methyltransf_31	116	248	4.6e-14	53.2
TkA05G463790	`PF02353`	CMAS	116	230	3.7e-07	30.5
TkA05G463790	`PF05219`	DREV	116	221	0.038	13.8
TkA05G463790	`PF13679`	Methyltransf_32	117	190	0.014	16.0
TkA05G463790	`PF06325`	PrmA	119	221	2.6e-07	31.2
TkA05G463790	`PF05175`	MTS	119	188	0.002	18.5
TkA05G463790	`PF05401`	NodS	120	207	0.0016	19.1
TkA05G463790	`PF09445`	Methyltransf_15	120	183	0.22	11.8
TkA05G463790	`PF08241`	Methyltransf_11	121	217	4.5e-18	66.4
TkA05G463790	`PF13649`	Methyltransf_25	121	211	3.7e-14	53.9
TkA05G463790	`PF08242`	Methyltransf_12	121	214	1.4e-11	45.6
TkA05G463790	`PF29244`	Methyltransf_ANTKMT	122	171	0.29	12.4
TkA05G463790	`PF25779`	Tubulin-bind_CPAP	162	185	0.32	12.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O49354`	拟南芥	sp\|O49354\|COQ3_ARATH Ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase, mitochondrial	74.100%	Swiss-Prot	高置信

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