基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA05G458150
当前版本: TK1151
染色体: Chr05
坐标: 114801301-114805134
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2217 bp · TkA05G458150|TK1151|cDNA
GTCCGATAACACTTCAAACACGAACCAATATGGATGGGTACGCTGGCCTATGGCCATGCATAACATTCATAAAATCTTTCTATTAACAGAAATTACCTTCATTTTACACTAACAGTATTATCACAATATGTGCGAAGATGCTGCATATATTTAGGGATCAAAATAAATATTGCTTTCGTTTCTTTGGTTTTCACTTTCGGGTTTCCATTATTCGAGTCTATATGTAAAGAATTCATCCACAAATTACGCAAATTTCACAT...
CDS
下载 CDS FASTA966 bp · TkA05G458150|TK1151|CDS
ATGGGTATAATAAGCGCCATTGCTGGGGCTTTTGGGTTTGGGATTGGAATCACAATTGGACTCGTGATTGGTTATTTTCTCTTCATCTTCATCCAATCATCTGATGTTGAGAAACCTGAAATTAAGCCGATGGTTGAGCAAGACGAACCATCTCTTCAAAGAATGTTCCCTGAAATACCCATTTGGGTTAAAAATCCTGACCATGATCGTGTTGATTGGCTTAACAAGTTTCTTGAACTAATGTGGCCATATTTAGACAA...
321 aa · TkA05G458150|TK1151|PROTEIN
MGIISAIAGAFGFGIGITIGLVIGYFLFIFIQSSDVEKPEIKPMVEQDEPSLQRMFPEIPIWVKNPDHDRVDWLNKFLELMWPYLDKAICKTVLATVEPMIKEQTPQYKIDEVEFDSLTLGNLPPTFQGMKVYTTDEKEIIMEPSFKWAANPNIHVGVKAFGLRPTIQIVDLQVFASPRVTLKPLVPTFPCFCKILVSLMDKPHVDFGVKLIGADLMSIPVLYGFVQELIKDQVANMYLWPKVLEVPVLDPTKAMKRPVG...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA05G458150 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA05G458150 |
| OH-1004 ID | LXL04_022314 |
| 关系 / 置信度 | 序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核 |
| 蛋白一致性 (%) | 99.700 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 94.081 / OH-1004 56.030覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA05G458150 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr05:114801301-114805134 (+) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to SYT2: Synaptotagmin-2 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006612 protein targeting to membrane 生物过程 GO:0006869 lipid transport 生物过程 GO:0006897 endocytosis 生物过程 GO:0007029 endoplasmic reticulum organization 生物过程 GO:0009306 protein secretion 生物过程 GO:0009409 response to cold 生物过程 GO:0009612 response to mechanical stimulus 生物过程 GO:0009615 response to virus 生物过程 GO:0032456 endocytic recycling 生物过程 GO:0046740 transport of virus in host, cell to cell 生物过程 GO:0061817 endoplasmic reticulum-plasma membrane tethering 生物过程 GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G05500 ath:AT1G20080 ath:AT2G20990 ath:AT5G04220 ath:AT5G11100 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.735
内质网0.183
细胞质0.171
高尔基体0.079
细胞核0.052
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF26768YtrI_N14-38 aaPF17047SMP_LBD67-248 aaPF25669SMP_MUG190-like70-138 aaPF25669SMP_MUG190-like174-246 aaPF00168C2260-305 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA05G458150 | PF26768 | YtrI_N | 14 | 38 | 0.028 | 15.0 |
| TkA05G458150 | PF17047 | SMP_LBD | 67 | 248 | 1.3e-19 | 71.1 |
| TkA05G458150 | PF25669 | SMP_MUG190-like | 70 | 138 | 9.6e-16 | 58.7 |
| TkA05G458150 | PF25669 | SMP_MUG190-like | 174 | 246 | 9.6e-16 | 58.7 |
| TkA05G458150 | PF00168 | C2 | 260 | 305 | 1.7e-06 | 28.9 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
B6ETT4 | 拟南芥 | sp|B6ETT4|SYT2_ARATH Synaptotagmin-2 | 69.200% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9SKR2 | 拟南芥 | sp|Q9SKR2|SYT1_ARATH Synaptotagmin-1 | 67.200% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q7XA06 | 拟南芥 | sp|Q7XA06|SYT3_ARATH Synaptotagmin-3 | 52.800% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q8L706 | 拟南芥 | sp|Q8L706|SYT5_ARATH Synaptotagmin-5 | 37.000% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9LEX1 | 拟南芥 | sp|Q9LEX1|CLB_ARATH Calcium-dependent lipid-binding protein | 36.200% | Swiss-Prot | 中等置信 |