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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G449000
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 112249938-112250246 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

309 bp · TkA05G449000|TK1151|cDNA

ATGATCGGAATAATTGGAAACTTTTACCACCATTATCTTCTTGCTAATCTAAGGACGGAAGGAGACAAAGAGTACAAAATCCCCCATGGCGGGTTGTTTGATTGGGTTATATGCCCACACTATCTATTCGAGATTCTTGAGTATATAGGAATATCGTGCATGTCACAAGCGTTGTATGCGTTTGTTTTCACTTTGGGTACAACTTTATACTTGAGAGGGAGGAGTTATGCCACATGGGAATGGTACATATCAAAGTTTGG...

CDS

下载 CDS FASTA

309 bp · TkA05G449000|TK1151|CDS

ATGATCGGAATAATTGGAAACTTTTACCACCATTATCTTCTTGCTAATCTAAGGACGGAAGGAGACAAAGAGTACAAAATCCCCCATGGCGGGTTGTTTGATTGGGTTATATGCCCACACTATCTATTCGAGATTCTTGAGTATATAGGAATATCGTGCATGTCACAAGCGTTGTATGCGTTTGTTTTCACTTTGGGTACAACTTTATACTTGAGAGGGAGGAGTTATGCCACATGGGAATGGTACATATCAAAGTTTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

102 aa · TkA05G449000|TK1151|PROTEIN

MIGIIGNFYHHYLLANLRTEGDKEYKIPHGGLFDWVICPHYLFEILEYIGISCMSQALYAFVFTLGTTLYLRGRSYATWEWYISKFGKMYPKEVRAIIPYVF

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G449000
TK1151 IDTkA05G449000
OH-1004 IDLXL04_022178
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)76.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.020 / OH-1004 37.687
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G449000
位置Chr05:112249938-112250246 (-)
描述Similar to gpsn2: Very-long-chain enoyl-CoA reductase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022178 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006665 sphingolipid metabolic process 生物过程
GO:0006694 steroid biosynthetic process 生物过程
GO:0006702 androgen biosynthetic process 生物过程
GO:0006710 androgen catabolic process 生物过程
GO:0008209 androgen metabolic process 生物过程
GO:0009267 cellular response to starvation 生物过程
GO:0009410 response to xenobiotic stimulus 生物过程
GO:0014850 response to muscle activity 生物过程
GO:0016101 diterpenoid metabolic process 生物过程
GO:0016132 brassinosteroid biosynthetic process 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0030497 fatty acid elongation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
bdi:100827766
ddi:DDB_G0270270
ghi:107948867
mmu:78925
rno:24950
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.892
排名 1 · TkA05G449000 · TK1151
细胞质0.059
排名 2 · TkA05G449000 · TK1151
细胞核0.052
排名 3 · TkA05G449000 · TK1151
细胞膜0.038
排名 4 · TkA05G449000 · TK1151
线粒体0.037
排名 5 · TkA05G449000 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02544Steroid_dh2-102 aa
PF04191PEMT3-69 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G449000PF02544Steroid_dh21022.7e-2796.3
TkA05G449000PF04191PEMT3690.05814.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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