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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G446520
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 111672087-111673843 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1185 bp · TkA05G446520|TK1151|cDNA

TCTAATGTATCCTTGACACAATATGCAGCTCTTAAAGATTCAAAAACTGTTGTTCCAACTGAAGATGAAGAAATTGAGGTCCCAAGATCACCCATAGATCAAGAAATGCCAGAAAGAAAGGAGAATGGATCTAAAAAGAGAGGAATGGTGCTGCCATTTAAACCATTATCACTTGCATTTAATCATGTCAATTACTACGTAGATATGCCTGCAGAAATGAAAGCTCAAGGACAAGAGGACGCTCATCTACAACTTCTACA...

CDS

下载 CDS FASTA

1185 bp · TkA05G446520|TK1151|CDS

TCTAATGTATCCTTGACACAATATGCAGCTCTTAAAGATTCAAAAACTGTTGTTCCAACTGAAGATGAAGAAATTGAGGTCCCAAGATCACCCATAGATCAAGAAATGCCAGAAAGAAAGGAGAATGGATCTAAAAAGAGAGGAATGGTGCTGCCATTTAAACCATTATCACTTGCATTTAATCATGTCAATTACTACGTAGATATGCCTGCAGAAATGAAAGCTCAAGGACAAGAGGACGCTCATCTACAACTTCTACA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

395 aa · TkA05G446520|TK1151|PROTEIN

SNVSLTQYAALKDSKTVVPTEDEEIEVPRSPIDQEMPERKENGSKKRGMVLPFKPLSLAFNHVNYYVDMPAEMKAQGQEDAHLQLLQDVSGAFRPGILTALVGVSGAGKTTLMDVLAGRKTGGYIEGNISISGYPKNQETFARVSGYCEQNDVHSPHVTVYESLTYSAWLRLPSDVTHESRQMFVEEVINLIELNSVRNSLVGLPGVDGLSTEQRKRLTIAVELVANPCIIFMDEPTSGLDARAAAIVMRTVRNTVDTGR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G446520
TK1151 IDTkA05G446520
OH-1004 IDLXL04_022123
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)98.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.494 / OH-1004 27.311
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G446520
位置Chr05:111672087-111673843 (-)
描述Similar to PDR2: Pleiotropic drug resistance protein 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g66950 可能是一种一般防御蛋白。 暂无已核实直接文献
At2g36380 可能是一种一般防御蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0522500 ABC转运蛋白调节镉输入，从而控制Cd积累以防止植物毒性。
Rice ABCG43 is Cd inducible and confers Cd tolerance on yeast.2011 · DOI: 10.1271/bbb.110193
Cadmium accumulation regulated by a rice heavy-metal importer is harmful for host plant and leaf bacteria.2023 · DOI: 10.1016/j.jare.2022.05.010
UniProt: A2WSH0 可能是一种一般防御蛋白。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022123 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000302 response to reactive oxygen species 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009914 hormone transport 生物过程
GO:0015691 cadmium ion transport 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0042908 xenobiotic transport 生物过程
GO:0046686 response to cadmium ion 生物过程
GO:0098657 import into cell 生物过程
GO:2000032 regulation of secondary shoot formation 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G66950
ath:AT2G36380
dosa:Os07g0522500
dosa:Os11g0587600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.459
排名 1 · TkA05G446520 · TK1151
细胞质0.341
排名 2 · TkA05G446520 · TK1151
细胞核0.145
排名 3 · TkA05G446520 · TK1151
溶酶体／液泡0.090
排名 4 · TkA05G446520 · TK1151
内质网0.088
排名 5 · TkA05G446520 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13191AAA_1680-156 aa
PF00005ABC_tran86-238 aa
PF02463SMC_N90-274 aa
PF03193RsgA_GTPase97-119 aa
PF13604AAA_3097-117 aa
PF13304AAA_2198-117 aa
PF13555AAA_2998-115 aa
PF13671AAA_3398-121 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G446520PF13191AAA_16801560.0315.5
TkA05G446520PF00005ABC_tran862389.1e-2278.8
TkA05G446520PF02463SMC_N902740.0007719.7
TkA05G446520PF03193RsgA_GTPase971190.04314.4
TkA05G446520PF13604AAA_30971170.07113.6
TkA05G446520PF13304AAA_21981172.5e-0628.4
TkA05G446520PF13555AAA_29981150.01316.0
TkA05G446520PF13671AAA_33981210.1213.4
TkA05G446520PF13476AAA_23981170.2112.9
TkA05G446520PF03215Rad171001900.04314.5
TkA05G446520PF01926MMR_HSR11001200.4111.5
TkA05G446520PF00004AAA1012350.03215.4
TkA05G446520PF13238AAA_181011540.09713.9
TkA05G446520PF07322Seadorna_Vp101892260.2911.6
TkA05G446520PF01926MMR_HSR11962230.4111.5
TkA05G446520PF13304AAA_212192712.5e-0628.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q7PC84拟南芥sp|Q7PC84|AB39G_ARATH ABC transporter G family member 3979.500%Swiss-Prot高置信
Q7PC87拟南芥sp|Q7PC87|AB34G_ARATH ABC transporter G family member 3479.800%Swiss-Prot高置信
Q8GU86水稻sp|Q8GU86|AB43G_ORYSJ ABC transporter G family member 4369.600%Swiss-Prot高置信
A2WSH0水稻sp|A2WSH0|AB36G_ORYSI ABC transporter G family member 3676.600%Swiss-Prot高置信

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