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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G444760
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 111247174-111250042 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1437 bp · TkA05G444760|TK1151|cDNA

TCGAAGAAGAACGAAGGATAGAGGCGGTTCTCACGGAAGGAGAGGGATGGAAGTTTGCAAGTTGTGGACATCAAACTGCATCGGCGGCCTGAACTCAGCACTAACGCAATGGGATCGCCGGATTCTGGTTATGCTTCGTCAAACGAGGGGGCTCCTGCGGCGAAATCTTCTCCTCACAAGTCACAGGCACTTCCTCCCTCAGATGGTGCAGAGACAACATACCTGAGGTTTCTCGCTTCAAATGCTGAAGCTGGTTCAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

720 bp · TkA05G444760|TK1151|CDS

ATGGGATCGCCGGATTCTGGTTATGCTTCGTCAAACGAGGGGGCTCCTGCGGCGAAATCTTCTCCTCACAAGTCACAGGCACTTCCTCCCTCAGATGGTGCAGAGACAACATACCTGAGGTTTCTCGCTTCAAATGCTGAAGCTGGTTCAATTATCGGAAAAGCTGGAACAACAATTTCTGATTTCCAGTCAAGATCCAATGCAAGGATTCAGTTGTCCCGCAACTTTGAGTATTTTCCAGGAACATCTGACAGAGTTAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

239 aa · TkA05G444760|TK1151|PROTEIN

MGSPDSGYASSNEGAPAAKSSPHKSQALPPSDGAETTYLRFLASNAEAGSIIGKAGTTISDFQSRSNARIQLSRNFEYFPGTSDRVIMVSGTIDEVLEAVELILTKLLNEFYAEDGDEGEPRSKVRLIVPNSSCGGIIGKGGSMIRSFIEDTGANIKISPQDHNYIGLNDRLVTVIGTLQQLVHAVNLILLKLSEDLYYVQSIGPPFPYAVPYNAPNYGPHGGGGSFRTTTAFRTIRKI

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G444760
TK1151 IDTkA05G444760
OH-1004 IDLXL04_022100
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)94.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 70.710
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G444760
位置Chr05:111247174-111250042 (+)
描述Similar to BTR1: Protein BTR1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g04430 番茄花叶病毒增殖的负调节剂，但对黄瓜花叶病毒的增殖没有影响。
Identification of an Arabidopsis thaliana protein that binds to tomato mosaic virus genomic RNA and inhibits its multiplication.2008 · DOI: 10.1016/j.virol.2008.07.033

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022100 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000381 regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome 生物过程
GO:0000398 mRNA splicing, via spliceosome 生物过程
GO:0006396 RNA processing 生物过程
GO:0008380 RNA splicing 生物过程
GO:0033120 positive regulation of RNA splicing 生物过程
GO:0046719 regulation by virus of viral protein levels in host cell 生物过程
GO:0050684 regulation of mRNA processing 生物过程
GO:0051252 regulation of RNA metabolic process 生物过程
GO:0120163 negative regulation of cold-induced thermogenesis 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G04430
dme:Dmel_CG42670
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.654
排名 1 · TkA05G444760 · TK1151
细胞核0.509
排名 2 · TkA05G444760 · TK1151
细胞膜0.060
排名 3 · TkA05G444760 · TK1151
溶酶体／液泡0.039
排名 4 · TkA05G444760 · TK1151
线粒体0.032
排名 5 · TkA05G444760 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13083KH_KhpA-B33-60 aa
PF00013KH_140-104 aa
PF07650KH_242-71 aa
PF13184KH_NusA_1st47-60 aa
PF22675KH-I_KHDC4-BBP49-72 aa
PF22891KH_PNO1_2nd49-94 aa
PF24668KH_Vigilin54-107 aa
PF13083KH_KhpA-B99-147 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G444760PF13083KH_KhpA-B33608.2e-0626.4
TkA05G444760PF00013KH_1401041.1e-31109.1
TkA05G444760PF07650KH_242714.6e-0627.1
TkA05G444760PF13184KH_NusA_1st47600.1313.2
TkA05G444760PF22675KH-I_KHDC4-BBP49720.001519.0
TkA05G444760PF22891KH_PNO1_2nd49940.3411.5
TkA05G444760PF24668KH_Vigilin541070.03214.7
TkA05G444760PF13083KH_KhpA-B991478.2e-0626.4
TkA05G444760PF07650KH_21221564.6e-0627.1
TkA05G444760PF13184KH_NusA_1st1221580.1313.2
TkA05G444760PF00013KH_11251901.1e-31109.1
TkA05G444760PF22675KH-I_KHDC4-BBP1351620.001519.0
TkA05G444760PF22891KH_PNO1_2nd1351830.3411.5
TkA05G444760PF24668KH_Vigilin1441600.03214.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LZ82拟南芥sp|Q9LZ82|BTR1_ARATH Protein BTR155.900%Swiss-Prot高置信

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