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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G443990
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 110981641-110995094 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2364 bp · TkA05G443990|TK1151|cDNA

AAAAGGCACAGGACCCATTAATTTTGCGTTATACAAATCACAAGGTAAGAGCCCCAGCCATAGACACATCAAAAAGTCAAAAACATCCTCCACTCTACCTCATCACGTTCTCTGAAAGAGGAGATGGCAAGTTTTTTTCGCGCTCGGCGCGTAGGGGTCACGGCTGCCTCGCTCGCCGTCGCTGTAGGCGGTTCCTATGTTGCACTACGTGATCCTTACGTATCCTCCAGTGACCGGAATGGCAGTGACACAGCGCTAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

3033 bp · TkA05G443990|TK1151|CDS

ATGGCTTCCGGTGTCAGGATGCTGAACAATGGGAACGGTAAGCATGAGAAGCAGCACGCTACGCCACCGCCTTCTTCTAGAACTGTTGGCTGTGGAGCTGCTGCCTCCGTTCGATCTAAAACACCGTCTTCTTCTGCTTCCAGACGTTCGGTTACCCCCAATTCTCGTTCTCACACTCGCCAGAACGACGAAGATGCAGAACCTGGAAGAGTGAGAGTTGCTATTAGACTACGACCAAAAAACACCGAGGAAATTTCAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1010 aa · TkA05G443990|TK1151|PROTEIN

MASGVRMLNNGNGKHEKQHATPPPSSRTVGCGAAASVRSKTPSSSASRRSVTPNSRSHTRQNDEDAEPGRVRVAIRLRPKNTEEISDADFFDCVELQPELMKLKLKKNNWSSDSYRFDEVFTESASQKRVYEAVAKPVVEGVLNGYNGTIMAYGQTGTGKTYTLGKLGKDDASERGIMVRALEDIIASASSASDSVEMSYLQIYMESVQDLLAPEKVNIPIVDDPKNGEVSVPGAAVVKIQNLDHFLHLLQIGEANRHAA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G443990
TK1151 IDTkA05G443990
OH-1004 IDLXL04_022076
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G443990
位置Chr05:110981641-110995094 (+)
描述Similar to KINUC: Kinesin-like protein KIN-UC
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g54870 作为加端微管依赖的马达蛋白。
A mutation in MRH2 kinesin enhances the root hair tip growth defect caused by constitutively activated ROP2 small GTPase in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1371/journal.pone.0001074
At3g10370 可能参与甘油分解代谢及 NADH/NAD⁺ 稳态维持。
SUGAR-DEPENDENT6 encodes a mitochondrial flavin adenine dinucleotide-dependent glycerol-3-p dehydrogenase, which is required for glycerol catabolism and post germinative seedling growth in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.123703
At1g12430 动力蛋白样蛋白 KIN-UA。 暂无已核实直接文献
At1g01950 通过促进微管解聚和限制内质微管的积累来参与根部表皮细胞形态发生和根部螺旋生长的控制。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0152900 动力蛋白样蛋白 KIN-UA。 暂无已核实直接文献
Os06g0137100 类驱动蛋白KIN-UB。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022076 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0030705 cytoskeleton-dependent intracellular transport 生物过程
GO:0031110 regulation of microtubule polymerization or depolymerization 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0048765 root hair cell differentiation 生物过程
GO:0048768 root hair cell tip growth 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005819 spindle 细胞组分
GO:0005871 kinesin complex 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G01950
ath:AT1G12430
ath:AT3G54870
dosa:Os03g0152900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.581
排名 1 · TkA05G443990 · TK1151
细胞核0.320
排名 2 · TkA05G443990 · TK1151
细胞膜0.143
排名 3 · TkA05G443990 · TK1151
高尔基体0.068
排名 4 · TkA05G443990 · TK1151
溶酶体／液泡0.060
排名 5 · TkA05G443990 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16796Microtub_bd69-212 aa
PF00225Kinesin76-413 aa
PF05970PIF1126-175 aa
PF13401AAA_22147-172 aa
PF24768ARM_ARMC5409-524 aa
PF13401AAA_22413-466 aa
PF24627PUMA_CC426-465 aa
PF24627PUMA_CC457-525 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G443990PF16796Microtub_bd692127.8e-1968.8
TkA05G443990PF00225Kinesin764133.6e-96322.7
TkA05G443990PF05970PIF11261750.01915.3
TkA05G443990PF13401AAA_221471720.01116.7
TkA05G443990PF24768ARM_ARMC54095241.3e-1558.3
TkA05G443990PF13401AAA_224134660.01116.7
TkA05G443990PF24627PUMA_CC4264650.00816.9
TkA05G443990PF24627PUMA_CC4575250.00816.9
TkA05G443990PF16796Microtub_bd4645667.8e-1968.8
TkA05G443990PF13401AAA_224795240.01116.7
TkA05G443990PF06696Strep_SA_rep5255400.04114.7
TkA05G443990PF00225Kinesin5365593.6e-96322.7
TkA05G443990PF24768ARM_ARMC55446141.3e-1558.3
TkA05G443990PF24627PUMA_CC5465980.00816.9
TkA05G443990PF06696Strep_SA_rep5806000.04114.7
TkA05G443990PF24627PUMA_CC6346470.00816.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SV36拟南芥sp|Q9SV36|KINUC_ARATH Kinesin-like protein KIN-UC61.200%Swiss-Prot高置信
Q9SS48拟南芥sp|Q9SS48|SDP6_ARATH Glycerol-3-phosphate dehydrogenase SDP6, mitochondrial80.400%Swiss-Prot高置信
Q9FZ06拟南芥sp|Q9FZ06|KINUA_ARATH Kinesin-like protein KIN-UA50.400%Swiss-Prot高置信
Q9LPC6拟南芥sp|Q9LPC6|KINUB_ARATH Kinesin-like protein KIN-UB49.700%Swiss-Prot中等置信
Q0DV28水稻sp|Q0DV28|KINUA_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-UA55.700%Swiss-Prot高置信
Q5VQ09水稻sp|Q5VQ09|KINUB_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-UB49.700%Swiss-Prot中等置信

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