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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G438570
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 109498125-109500296 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2112 bp · TkA05G438570|TK1151|cDNA

ATGGATAGCATGGCGTTTTACCAGCGAGGACAGGTGGCGACCTCTCCGTCTCTCGGAGAGCTTCTTAAGTTCGTTGGAGACATAAGGAAGGAGGCGAATGAGATGAGTGAAACAAGTAACGAGCCTAGATCGTTGCCGTTTGTTTTGAAGTTTAATAATCTGACTTACAGTGTGAAAGTTCGGAGAAAGATGGGGATGCCTTCTCTGTTTGGTGGAAATGAGCATATGTTTTCGAGGAGTAAGGTTTTGTTGAATGATAT...

CDS

下载 CDS FASTA

2112 bp · TkA05G438570|TK1151|CDS

ATGGATAGCATGGCGTTTTACCAGCGAGGACAGGTGGCGACCTCTCCGTCTCTCGGAGAGCTTCTTAAGTTCGTTGGAGACATAAGGAAGGAGGCGAATGAGATGAGTGAAACAAGTAACGAGCCTAGATCGTTGCCGTTTGTTTTGAAGTTTAATAATCTGACTTACAGTGTGAAAGTTCGGAGAAAGATGGGGATGCCTTCTCTGTTTGGTGGAAATGAGCATATGTTTTCGAGGAGTAAGGTTTTGTTGAATGATAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

703 aa · TkA05G438570|TK1151|PROTEIN

MDSMAFYQRGQVATSPSLGELLKFVGDIRKEANEMSETSNEPRSLPFVLKFNNLTYSVKVRRKMGMPSLFGGNEHMFSRSKVLLNDISGEARDGELVAVLGASGSGKSTLIDALANRIAKGSLKGSVTLNGEQLESRLLKVISAYVMQDDLLFPMLTVEETLMYAAEFRLPRTLSKSKKKLRVQALIDQLGIRNAAKTVIGDEGHRGVSGGERRRVSIGIDIIHDPIILFLDEPTSGLDSTSAYMVVKVLQRIAQSGSIV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G438570
TK1151 IDTkA05G438570
OH-1004 IDLXL04_022004
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 98.770
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G438570
位置Chr05:109498125-109500296 (-)
描述Similar to ABCG1: ABC transporter G family member 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g13580 ABC 转运蛋白 G 家族成员 6。 暂无已核实直接文献
At3g55090 ABC转运蛋白G家族成员16。 暂无已核实直接文献
At2g39350 ABC 转运蛋白 G 家族成员 1。 暂无已核实直接文献
At3g53510 ABC 转运蛋白 G 家族成员 20。 暂无已核实直接文献
At2g37360 ABC转运蛋白G家族成员2。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022004 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0010208 pollen wall assembly 生物过程
GO:0010345 suberin biosynthetic process 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
GO:0042626 ATPase-coupled transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0140359 ABC-type transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G37360
ath:AT2G39350
ath:AT3G53510
ath:AT3G55090
ath:AT5G13580
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.577
排名 1 · TkA05G438570 · TK1151
溶酶体／液泡0.173
排名 2 · TkA05G438570 · TK1151
内质网0.097
排名 3 · TkA05G438570 · TK1151
细胞质0.086
排名 4 · TkA05G438570 · TK1151
高尔基体0.067
排名 5 · TkA05G438570 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF20703nSTAND177-113 aa
PF03308MeaB79-120 aa
PF25201nSTAND683-122 aa
PF00005ABC_tran84-236 aa
PF13191AAA_1685-124 aa
PF25199nSTAND_NTPase589-129 aa
PF13481AAA_2592-122 aa
PF03193RsgA_GTPase93-117 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G438570PF20703nSTAND1771130.001518.9
TkA05G438570PF03308MeaB791200.01515.0
TkA05G438570PF25201nSTAND6831220.1313.0
TkA05G438570PF00005ABC_tran842362.8e-2693.5
TkA05G438570PF13191AAA_16851240.0001822.8
TkA05G438570PF25199nSTAND_NTPase5891290.01815.6
TkA05G438570PF13481AAA_25921220.01215.9
TkA05G438570PF03193RsgA_GTPase931170.008916.6
TkA05G438570PF13555AAA_29941151.5e-0525.4
TkA05G438570PF13401AAA_22952060.006417.5
TkA05G438570PF02463SMC_N951150.03314.3
TkA05G438570PF20720nSTAND3951200.2311.9
TkA05G438570PF13304AAA_21961238.4e-0523.4
TkA05G438570PF05729NACHT961250.00417.7
TkA05G438570PF13476AAA_23961150.07914.3
TkA05G438570PF19993DO-GTPase2961310.1112.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FNB5拟南芥sp|Q9FNB5|AB6G_ARATH ABC transporter G family member 674.300%Swiss-Prot高置信
Q9M2V7拟南芥sp|Q9M2V7|AB16G_ARATH ABC transporter G family member 1672.000%Swiss-Prot高置信
O80946拟南芥sp|O80946|AB1G_ARATH ABC transporter G family member 172.600%Swiss-Prot高置信
Q9LFG8拟南芥sp|Q9LFG8|AB20G_ARATH ABC transporter G family member 2072.300%Swiss-Prot高置信
Q9ZUT0拟南芥sp|Q9ZUT0|AB2G_ARATH ABC transporter G family member 270.900%Swiss-Prot高置信

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