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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G433010
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 108029824-108033622 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1637 bp · TkA05G433010|TK1151|cDNA

GACTCATTGACGTGGCAAGTAAATCCTTAATTTTCATTTAGGACCAATCACATGTGACAACGTACCACCAATTATCCCTGTTACCAACTCATCTCGTCGTTTTACGACAACTCGCCGCACTTCCCATTTTCAATCAACGTCTCTCCTTACACCTCTTCAGTGGACTAGCATGTAGGTTAATAAACTCGAACTTGGATCTGCATAAGGATGCAAATGCATGTGTATATAAAGGTCGACGAACATATCACGATTTAGCTAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1041 bp · TkA05G433010|TK1151|CDS

ATGGCTACACAGGGTACTACTGGAGCCAACAATGTTACTAGCCGACCGCCTCCAAATCCATCTCCACTACGTACTGCGAAGTTTTTCCAGGCCAACATGAGGATATTGGTCACTGGAGGAGCTGGTTTCATTGGCTCTCACCTTGTGGACAGATTGATGCAAAATGAAAAGAACGAGGTGGTGGTTGTAGATAATTACTTCACAGGTTCAAAGGACAATCTAAAACAATGGTTTGGTCACCCAAGATTTGAGCTCATTCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

346 aa · TkA05G433010|TK1151|PROTEIN

MATQGTTGANNVTSRPPPNPSPLRTAKFFQANMRILVTGGAGFIGSHLVDRLMQNEKNEVVVVDNYFTGSKDNLKQWFGHPRFELIRHDVTETLLIEVDQIYHLACPASPIFYKHNPVKTIKTNVIGTLNMLGLAKRVGARILLTSTSEVYGDPLVHPQDESYWGNVNPIGVRSCYDEGKRVAETLMFDYHRQHGIEIRIARIFNTYGPRMNIDDGRVVSNFIAQAIRNEPLTVQAPGTQTRSFCYVSDMVDGLIRLMEG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G433010
TK1151 IDTkA05G433010
OH-1004 IDLXL04_017764
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)86.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.711 / OH-1004 92.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G433010
位置Chr05:108029824-108033622 (+)
描述Similar to UXS5: UDP-glucuronic acid decarboxylase 5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g28760 催化 UDP-葡萄糖醛酸向 UDP-木糖的 NAD 依赖性脱羧。 暂无已核实直接文献
At5g59290 催化 UDP-葡萄糖醛酸向 UDP-木糖的 NAD 依赖性脱羧。
Reconstruction of de novo pathway for synthesis of UDP-glucuronic acid and UDP-xylose from intrinsic UDP-glucose in Saccharomyces cerevisiae.2006 · DOI: 10.1111/j.1742-4658.2006.05281.x
At3g46440 催化 UDP-葡萄糖醛酸向 UDP-木糖的 NAD 依赖性脱羧。 暂无已核实直接文献
At2g47650 催化 UDP-葡萄糖醛酸向 UDP-木糖的 NAD 依赖性脱羧。 暂无已核实直接文献
At3g53520 催化 UDP-葡萄糖醛酸向 UDP-木糖的 NAD 依赖性脱羧。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017764 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0019305 dTDP-rhamnose biosynthetic process 生物过程
GO:0033320 UDP-D-xylose biosynthetic process 生物过程
GO:0042732 D-xylose metabolic process 生物过程
GO:0045492 xylan biosynthetic process 生物过程
GO:0000138 Golgi trans cisterna 细胞组分
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G28760
ath:AT2G47650
ath:AT3G46440
ath:AT3G62830
ath:AT5G59290
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.650
排名 1 · TkA05G433010 · TK1151
细胞核0.304
排名 2 · TkA05G433010 · TK1151
线粒体0.110
排名 3 · TkA05G433010 · TK1151
过氧化物酶体0.082
排名 4 · TkA05G433010 · TK1151
质体0.066
排名 5 · TkA05G433010 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04321RmlD_sub_bind33-298 aa
PF01370Epimerase35-269 aa
PF02719Polysacc_synt_235-142 aa
PF08659KR35-63 aa
PF00106adh_short35-91 aa
PF16363GDP_Man_Dehyd36-332 aa
PF010733Beta_HSD36-188 aa
PF07993NAD_binding_437-61 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G433010PF04321RmlD_sub_bind332987.2e-0935.8
TkA05G433010PF01370Epimerase352693.6e-47161.5
TkA05G433010PF02719Polysacc_synt_2351421.1e-1351.7
TkA05G433010PF08659KR35630.1712.5
TkA05G433010PF00106adh_short35910.1911.9
TkA05G433010PF16363GDP_Man_Dehyd363322.6e-50172.5
TkA05G433010PF010733Beta_HSD361889.5e-1348.5
TkA05G433010PF07993NAD_binding_437619.2e-1245.4
TkA05G433010PF03435Sacchrp_dh_NADP40890.1213.4
TkA05G433010PF07993NAD_binding_4892089.2e-1245.4
TkA05G433010PF00106adh_short1191320.1911.9
TkA05G433010PF08659KR1271480.1712.5
TkA05G433010PF02719Polysacc_synt_21752911.1e-1351.7
TkA05G433010PF00106adh_short2833180.1911.9
TkA05G433010PF03435Sacchrp_dh_NADP2893130.1213.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZV36拟南芥sp|Q9ZV36|UXS6_ARATH UDP-glucuronic acid decarboxylase 686.100%Swiss-Prot高置信
Q9FIE8拟南芥sp|Q9FIE8|UXS3_ARATH UDP-glucuronic acid decarboxylase 386.100%Swiss-Prot高置信
Q9SN95拟南芥sp|Q9SN95|UXS5_ARATH UDP-glucuronic acid decarboxylase 587.900%Swiss-Prot高置信
Q8S8T4拟南芥sp|Q8S8T4|UXS4_ARATH UDP-glucuronic acid decarboxylase 472.700%Swiss-Prot高置信
Q8VZC0拟南芥sp|Q8VZC0|UXS1_ARATH UDP-glucuronic acid decarboxylase 172.400%Swiss-Prot高置信

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