TkA05G421100 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA05G421100

当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 104926964-104931438 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1706 bp · TkA05G421100|TK1151|cDNA

AAAAATTCCTTCTTCGTCAGAACAGCTTTTCTTGTACAGCGAATCCCATCGGCGATCTATCCTCAGTTTAACTGCATGATCTTCATGATTTCAACAAGCATTGGTACATCTTCTGTTTCCTGTAAAGCGGGAAACAAGAACAACTTCCCTTTCTGGATTCCCATTTACCTATTTTCAAGATTCTCTGGGAGTGCTCCGTTCTTTGTGATTGTTATCTGACTTTCATCAATTTAGCCATTATCTCAATCTTAAAAAAATGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1341 bp · TkA05G421100|TK1151|CDS

ATGGTTGCTTCCCAATGGACTGCAAGGAAGACCGTGGATCACGTTGACTTTGACTTTGACTTTTCGGATGTATTTGGTCCACCACCGCCACCTCAACAACCTTCTGCACCCAACACAAACGAATTATTAATATACGATGAGCCGGAAGTTCTATGTAGCCGTTCCCATTCATTAGTGGGACCCACAACTTTTATAAACCAGTCCTTGAAGCTTAGCACAATGGCTTTACAAGAGCTTGAAGAATCTCCTTTTGTTGATGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

446 aa · TkA05G421100|TK1151|PROTEIN

MVASQWTARKTVDHVDFDFDFSDVFGPPPPPQQPSAPNTNELLIYDEPEVLCSRSHSLVGPTTFINQSLKLSTMALQELEESPFVDVVDDDDDDDDDDDDDDDDGSLVNIESVGLEDFEILKVVGQGAFAKVYQVRKHGSSEIFAMKVMRKDRIFEKDQAEYMKAERDILTKVDHPFIVQLKYSFQTKYRLFLVLDFVNGGHLFFQLYRQGLFREDLARFYTAEIVSAVSHLHANGIMHRDLKPENILLDAEGHVMLTDF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA05G421100`
TK1151 ID	TkA05G421100
OH-1004 ID	LXL04_021788
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	98.200
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA05G421100

位置 Chr05:104926964-104931438 (-)

描述 Similar to ATPK2: Serine/threonine-protein kinase AtPK2/AtPK19

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g08720`	TOR 信号通路的下游效应器。	暂无已核实直接文献
`At3g08730`	参与渗透应激反应的 TOR 信号通路下游效应器。	Arabidopsis S6 kinase mutants display chromosome instability and altered RBR1-E2F pathway activity.2010 · DOI: 10.1038/emboj.2010.164

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021788 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006417 regulation of translation 生物过程

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程

GO:0008285 negative regulation of cell population proliferation 生物过程

GO:0009408 response to heat 生物过程

GO:0009409 response to cold 生物过程

GO:0009651 response to salt stress 生物过程

GO:0018105 peptidyl-serine phosphorylation 生物过程

GO:0030334 regulation of cell migration 生物过程

GO:0031269 pseudopodium assembly 生物过程

GO:0031929 TOR signaling 生物过程

GO:0032060 bleb assembly 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G08720

ath:AT3G08730

bta:404181

ddi:DDB_G0277449

ddi:DDB_G0290157

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.590

排名 1 · TkA05G421100 · TK1151

细胞核0.467

排名 2 · TkA05G421100 · TK1151

细胞膜0.129

排名 3 · TkA05G421100 · TK1151

内质网0.049

排名 4 · TkA05G421100 · TK1151

线粒体0.042

排名 5 · TkA05G421100 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04615Utp1489-161 aa

PF04889Cwf_Cwc_1589-106 aa

PF13095FTA2116-171 aa

PF00069Pkinase118-374 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr119-357 aa

PF03109ABC1125-152 aa

PF01163RIO1131-168 aa

PF03109ABC1192-273 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA05G421100	`PF04615`	Utp14	89	161	0.17	11.2
TkA05G421100	`PF04889`	Cwf_Cwc_15	89	106	5.2	7.5
TkA05G421100	`PF13095`	FTA2	116	171	0.0046	17.4
TkA05G421100	`PF00069`	Pkinase	118	374	3.1e-75	253.7
TkA05G421100	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	119	357	5.8e-35	121.6
TkA05G421100	`PF03109`	ABC1	125	152	5.7e-07	29.7
TkA05G421100	`PF01163`	RIO1	131	168	0.046	14.1
TkA05G421100	`PF03109`	ABC1	192	273	5.7e-07	29.7
TkA05G421100	`PF01163`	RIO1	193	266	0.046	14.1
TkA05G421100	`PF06293`	Kdo	213	265	0.00018	21.7
TkA05G421100	`PF14531`	Kinase-like	215	357	1e-09	38.8
TkA05G421100	`PF13095`	FTA2	222	248	0.0046	17.4
TkA05G421100	`PF17667`	Pkinase_fungal	225	297	6.6e-08	32.4
TkA05G421100	`PF19974`	TCAD9	225	261	0.13	12.1
TkA05G421100	`PF01636`	APH	227	261	0.012	16.1
TkA05G421100	`PF12330`	Haspin_kinase	238	289	0.023	14.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q39030`	拟南芥	sp\|Q39030\|KPK2_ARATH Serine/threonine-protein kinase AtPK2/AtPK19	66.100%	Swiss-Prot	高置信
`P42818`	拟南芥	sp\|P42818\|KPK1_ARATH Serine/threonine-protein kinase AtPK1/AtPK6	65.300%	Swiss-Prot	高置信

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