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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G421020
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 104896797-104900009 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2047 bp · TkA05G421020|TK1151|cDNA

CACATATCTTTTTGTGAATTTGTCCATGTTCTATTTTATCACAATTTAATAAAAAACACACACAAAAAACAAACACAATCACGATGCCATACATTTGCTCCGTTCTCTGACCTCTCAAACTGGTATACCCGACCAGACGCATGTGTTTGATTTTCATAGTCGTCGTCTTCATTCTCCAATCACGAATTTCTCGCATCACACACAGCAACAAAACTCTACGTTATGCTCCATTACTCCATCTCTCTGATCTAATCTATCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1266 bp · TkA05G421020|TK1151|CDS

ATGACTATTACATCTCCCCTTATGAATCTATCCATTCCAACATCACACGAAGGATTTGAAGAATCTGAGTTCCAACCACTTGATCCACTAATGGATTCTGCTCTTTACAACACTCCCTCCACCAATTCAAATCCAGAAATCGATGATCCCGAAATAGACCTACTCTCAGTCTCATGGAACCAAGACTACGGTTGTTTTGCAGCAGGAACAAACCATGGTTTCCGTATATACAACTGCGATCCATTCAAAGAAACATTTAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

421 aa · TkA05G421020|TK1151|PROTEIN

MTITSPLMNLSIPTSHEGFEESEFQPLDPLMDSALYNTPSTNSNPEIDDPEIDLLSVSWNQDYGCFAAGTNHGFRIYNCDPFKETFRRDLKSGGFGIIEMLFRSNILALVGGKGNTQYPPNKVIIWDDHQSRCIGEFSFRSEVRSVKLRRDRIVVVLEHKIYVYNFMDLKLLHQIETLANPRGICSLSHQVNTSVLACLGLRRGQVRIEHFGLNMTKLINAHDSRIACLTITMDGLLLATASTKGTLVRIFNTMDGTRLQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G421020
TK1151 IDTkA05G421020
OH-1004 IDLXL04_037050
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)58.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.249 / OH-1004 27.706
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G421020
位置Chr05:104896797-104900009 (-)
描述Similar to ATG18A: Autophagy-related protein 18a
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g56440 PI(3,5)P2 调节复合物调节磷脂酰肌醇 3,5-二磷酸 (PtdIns(3,5)P2) 的合成和周转。 暂无已核实直接文献
At2g40810 PI(3,5)P2 调节复合物调节磷脂酰肌醇 3,5-二磷酸 (PtdIns(3,5)P2) 的合成和周转。 暂无已核实直接文献
At3g62770 可能作为 PI(3,5)P₂ 调控复合体的组分，参与磷脂酰肌醇 3,5-二磷酸的合成及周转。
Autophagy differentially controls plant basal immunity to biotrophic and necrotrophic pathogens.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04546.x
A critical role of autophagy in plant resistance to necrotrophic fungal pathogens.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04553.x
The autophagy gene, ATG18a, plays a negative role in powdery mildew resistance and mildew-induced cell death in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.4161/psb.6.9.16967
At5g05150 PI(3,5)P2 调节复合物调节磷脂酰肌醇 3,5-二磷酸 (PtdIns(3,5)P2) 的合成和周转。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037050 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000045 autophagosome assembly 生物过程
GO:0000422 autophagy of mitochondrion 生物过程
GO:0000425 pexophagy 生物过程
GO:0006914 autophagy 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009267 cellular response to starvation 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0010150 leaf senescence 生物过程
GO:0010508 positive regulation of autophagy 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G40810
ath:AT3G56440
ath:AT3G62770
ath:AT5G05150
xla:447310
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.599
排名 1 · TkA05G421020 · TK1151
细胞核0.263
排名 2 · TkA05G421020 · TK1151
溶酶体／液泡0.205
排名 3 · TkA05G421020 · TK1151
高尔基体0.120
排名 4 · TkA05G421020 · TK1151
细胞膜0.107
排名 5 · TkA05G421020 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24807WD40_CDC20-Fz52-109 aa
PF24797Beta-prop_WDR35_TULP_N52-74 aa
PF23381Beta-prop_IFT122_1st53-73 aa
PF24817WD40_WDHD1_1st54-87 aa
PF23389Beta-prop_WDR19_1st54-78 aa
PF00400WD4055-78 aa
PF12894ANAPC4_WD4055-73 aa
PF21032PROPPIN56-304 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G421020PF24807WD40_CDC20-Fz521095.9e-1142.9
TkA05G421020PF24797Beta-prop_WDR35_TULP_N52740.08412.7
TkA05G421020PF23381Beta-prop_IFT122_1st53732.7e-1144.1
TkA05G421020PF24817WD40_WDHD1_1st54874.4e-0730.1
TkA05G421020PF23389Beta-prop_WDR19_1st54780.07112.8
TkA05G421020PF00400WD4055785e-0730.7
TkA05G421020PF12894ANAPC4_WD4055730.0005520.8
TkA05G421020PF21032PROPPIN563042.6e-34119.7
TkA05G421020PF25174Beta-prop_THOC3562981.7e-1247.7
TkA05G421020PF23414Beta-prop_EML_256733.5e-0833.9
TkA05G421020PF23335Beta-prop_IFT80_2nd57790.2410.8
TkA05G421020PF25175Beta-prop_WDR5861568.8e-0935.8
TkA05G421020PF25173Beta-prop_WDR3_1st901832.4e-0628.1
TkA05G421020PF21034BCAS3_WD401071878.2e-1245.2
TkA05G421020PF23385Beta-prop_IFT140_2nd1172510.002517.7
TkA05G421020PF23381Beta-prop_IFT122_1st1212092.7e-1144.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q0WPK3拟南芥sp|Q0WPK3|AT18D_ARATH Autophagy-related protein 18d76.600%Swiss-Prot高置信
Q8GYD7拟南芥sp|Q8GYD7|AT18C_ARATH Autophagy-related protein 18c76.100%Swiss-Prot高置信
Q93VB2拟南芥sp|Q93VB2|AT18A_ARATH Autophagy-related protein 18a63.800%Swiss-Prot高置信
Q9FHK8拟南芥sp|Q9FHK8|AT18E_ARATH Autophagy-related protein 18e47.700%Swiss-Prot中等置信

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