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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G418490
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 104213532-104225583 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

6790 bp · TkA05G418490|TK1151|cDNA

ACCGTCTTGGCATAAACATGAAAACATAAACCCTAGAAGGGCTTAACACCCGCGCCATCTCATTCGAAGTCGGTAGGCCTCCTTGTCGCTTACCACCAGCAACCACTTCTACTCTGGGTTTAGGGTTTATCATAACCAGTCGGAACTACAACTCCATTTGGTTCAATACAATCAGTTTAGGATTCCAACAATCTCTATTTATTCATCTTCAAAGGAAAAACAATGGCGACGTCAATCGCCTCACAGCTGCAGGCAATCAG...

CDS

下载 CDS FASTA

6372 bp · TkA05G418490|TK1151|CDS

ATGGCGACGTCAATCGCCTCACAGCTGCAGGCAATCAGGTCAATTGTTAAGGCCGATACAGACCCTGTTAAAAGGCCGTTTACCCGTCCCTCCATCTTGTTTGACGCCAAAAAAGCAGCTGATACCGACCTCGATACTCTCTTTGACCTCGCCGTTTCAGGGTTGGAGGGTCTTGTGAGTCTGGATGAAAGATTTGGGAACTACAGGAATGATTTGTTCTCTCATAAGAGTAGAGAGCTGGATAGAGAGCTGTTGGGCGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

2123 aa · TkA05G418490|TK1151|PROTEIN

MATSIASQLQAIRSIVKADTDPVKRPFTRPSILFDAKKAADTDLDTLFDLAVSGLEGLVSLDERFGNYRNDLFSHKSRELDRELLGVEENNHINASISSYLRLLSGHFESLSALKTLEYLIRRYKIHVYNIEELVLCALPYHDTPLFVRIVQLIDTGNGKWKFLEGVKTSGAPPPRKVIVHQCMRDMGVLEALCNYAIPTKKFQASRPVISFCTAVVIEVLGSLAVIETDVVKRVLPYVISGLQTHSKGNIDHKAGALMI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G418490
TK1151 IDTkA05G418490
OH-1004 IDLXL04_021749
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G418490
位置Chr05:104213532-104225583 (-)
描述Similar to At3g06530: Uncharacterized protein At3g06530
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g06530 参与前 18S 核糖体 RNA 的核仁加工。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021749 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000462 maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0016072 rRNA metabolic process 生物过程
GO:0030490 maturation of SSU-rRNA 生物过程
GO:0042274 ribosomal small subunit biogenesis 生物过程
GO:0043487 regulation of RNA stability 生物过程
GO:0045943 positive regulation of transcription by RNA polymerase I 生物过程
GO:0061351 neural precursor cell proliferation 生物过程
GO:1902570 protein localization to nucleolus 生物过程
GO:2000234 positive regulation of rRNA processing 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0001650 fibrillar center 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G06530
dre:334446
hsa:55127
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.814
排名 1 · TkA05G418490 · TK1151
细胞质0.197
排名 2 · TkA05G418490 · TK1151
高尔基体0.043
排名 3 · TkA05G418490 · TK1151
内质网0.031
排名 4 · TkA05G418490 · TK1151
细胞膜0.031
排名 5 · TkA05G418490 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24714TOR1L1_N212-285 aa
PF24987HEAT_EF3_N227-267 aa
PF12397U3snoRNP10231-356 aa
PF08146BP28CT232-289 aa
PF23243HEAT_HEATR1303-454 aa
PF23271HEAT_GCN1346-460 aa
PF24714TOR1L1_N346-442 aa
PF12397U3snoRNP10371-428 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G418490PF24714TOR1L1_N2122850.000819.5
TkA05G418490PF24987HEAT_EF3_N2272672.1e-0525.3
TkA05G418490PF12397U3snoRNP102313563e-2279.9
TkA05G418490PF08146BP28CT2322891.8e-33116.2
TkA05G418490PF23243HEAT_HEATR13034544.6e-44151.4
TkA05G418490PF23271HEAT_GCN13464604.7e-0524.3
TkA05G418490PF24714TOR1L1_N3464420.000819.5
TkA05G418490PF12397U3snoRNP103714283e-2279.9
TkA05G418490PF02985HEAT4774943.9e-0524.2
TkA05G418490PF23271HEAT_GCN14795344.7e-0524.3
TkA05G418490PF24714TOR1L1_N4825860.000819.5
TkA05G418490PF02985HEAT5155323.9e-0524.2
TkA05G418490PF11841ELMO_ARM5526255.97.5
TkA05G418490PF12397U3snoRNP105676363e-2279.9
TkA05G418490PF24477ARM_At3g065306308251.2e-69234.5
TkA05G418490PF25782TPR_CAND17417620.6111.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C8Z4拟南芥sp|Q9C8Z4|HEAT1_ARATH Uncharacterized protein At3g0653045.100%Swiss-Prot中等置信

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