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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G405320
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 100813605-100828311 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1869 bp · TkA05G405320|TK1151|cDNA

ATCCATTTAACTATTACATTAGACTAGTTCTTGAGTTTTTTTTAATCTTTTTGTTGGCTCAAGTAAAAACGTAAACTTATATGTTTATTTCTCTATCTTTATTTCATGTATCACTTGGTCAACCAAACTAAGCAGGCACGGAGACAGTAAGGAGCCAGGATAAAGAAATAGAGGGAGACAAATACCCTATGGTCAGGTGTGGAGCTTCCCGTTTTGAAGAATCAAAATGTGTGGCACGGTGTTTATTGGCAAGACAACGA...

CDS

下载 CDS FASTA

822 bp · TkA05G405320|TK1151|CDS

ATGGGGAAAGAAAAGCAAGGAGCTTTAGTGGCGGGACACCAGAACCCATTCACACACATAGAAACCAAATACAATGAAATCGAGACCCTCGTCAAGACATGGCTTGCCAAACAGTCTATACCCGTCGAGACTGCCATCGTCACCTTCACCAGCGCCGTCCAAGGTGCTGCGATCGGTGGCTTAATGAGTACTTTCACCAAGGACATCTCCTCCGCTATTCCGCCTCCACCATCCGGCACCTCCCTTAATCCACAGGCTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

274 aa · TkA05G405320|TK1151|PROTEIN

MGKEKQGALVAGHQNPFTHIETKYNEIETLVKTWLAKQSIPVETAIVTFTSAVQGAAIGGLMSTFTKDISSAIPPPPSGTSLNPQANTFSSFQQAQALAGGPLIQARNFAVMTGVNAGLSCVLRRLKGKEDVQTSMVAAFGSGVMFSLVSGMGGPTNQASNVITSGVFFALMQGGIFKVGEKFSKPKVEDILYNETRGMLYNLGLERYEKNFRRGLLTDNTLPLLNDSALQDVKIPPGPRLLILDHIERSRIKLLESLSD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G405320
TK1151 IDTkA05G405320
OH-1004 IDLXL04_021551
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)96.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 91.606 / OH-1004 97.727
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G405320
位置Chr05:100813605-100828311 (-)
描述Similar to HP30-2: Chloroplastic import inner membrane translocase subunit HP30-2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g24650 与 HP30-1 和 HP20 一起，触发无转运序列的多次跨膜蛋白导入和插入叶绿体内膜。
Three proteins mediate import of transit sequence-less precursors into the inner envelope of chloroplasts in Arabidopsis thaliana.2013 · DOI: 10.1073/pnas.1319648110
At3g49560 与 HP30-2 和 HP20 一起，触发无易位序列多跨膜蛋白（如 CEQORH）导入及嵌入叶绿体内膜。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021551 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007005 mitochondrion organization 生物过程
GO:0016031 tRNA import into mitochondrion 生物过程
GO:0045036 protein targeting to chloroplast 生物过程
GO:0045039 protein insertion into mitochondrial inner membrane 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005744 TIM23 mitochondrial import inner membrane translocase complex 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G49560
ath:AT5G24650
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.712
排名 1 · TkA05G405320 · TK1151
质体0.197
排名 2 · TkA05G405320 · TK1151
细胞质0.072
排名 3 · TkA05G405320 · TK1151
细胞核0.048
排名 4 · TkA05G405320 · TK1151
细胞膜0.023
排名 5 · TkA05G405320 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02466Tim1748-171 aa
PF30969DUF876749-74 aa
PF30969DUF8767106-119 aa
PF30969DUF8767128-176 aa
PF00536SAM_1202-249 aa
PF07647SAM_2202-249 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G405320PF02466Tim17481711.8e-1145.0
TkA05G405320PF30969DUF876749745.27.9
TkA05G405320PF30969DUF87671061195.27.9
TkA05G405320PF30969DUF87671281765.27.9
TkA05G405320PF00536SAM_12022494.6e-0524.4
TkA05G405320PF07647SAM_22022490.007117.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FLT9拟南芥sp|Q9FLT9|HP302_ARATH Chloroplastic import inner membrane translocase subunit HP30-253.800%Swiss-Prot高置信
Q9SCK3拟南芥sp|Q9SCK3|HP301_ARATH Chloroplastic import inner membrane translocase subunit HP30-154.300%Swiss-Prot高置信

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