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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G405170
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 100776930-100784635 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3663 bp · TkA05G405170|TK1151|cDNA

GGAAGGTCTCCCCATTCAAAGTCTCTCTCTCTTACCATTTGTTCTGCTTCATTTTGAAGCTGTCTTATTTATTAATATTACTTATCTTCCTCCCTTCTAGAATCTGTATATACCTTCCTCCTCCTTTTTCCCCTTTCTAGGGTTTCGTCCGTACACTGCTTCTTCATTCAACACGATTTCCCTGCAACAACAACCAAAAACCCCACTCGAGGGCTCCATCTAGGGTTTTACAGTTCACAATTTCTCTGCGATGGCGGCGG...

CDS

下载 CDS FASTA

2016 bp · TkA05G405170|TK1151|CDS

ATGAAAAATTATATATCTGATGTTATTGTCAAGCTTTCAAGTAACGAGAGTTCTTTCCGCCAAGAAAGGTTGTACGTTAACAAACTGAACATTATACTGGTTCAGATATTGAAACATGAGTGGCCAGCCAGGTGGCGGAGCTTCATTCCTGACCTAGTTGCAGCAGCTAAAACCAGTGAAACAATTTGCGAAAATTGCATGGCTATACTGAAACTTTTAAGTGAAGAGGTGTTTGATTTCTCAAGAGGTGAAATGACCCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

671 aa · TkA05G405170|TK1151|PROTEIN

MKNYISDVIVKLSSNESSFRQERLYVNKLNIILVQILKHEWPARWRSFIPDLVAAAKTSETICENCMAILKLLSEEVFDFSRGEMTQQKIKELKQSLNSEFQLIHELCLYVLSASQRTELIRATLATLHAFLSWIPLGYIFESPLLETLLKFFPVPSYRNLTLQCLTEVAALNFGDFYNMQYVKMYNIFIVQLQTVLPTTTNIPDAYTNGSTEEQAFIQNLAMFFTSFYKFHIRVLESTQENTAALLMGLEYLLSISYVD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G405170
TK1151 IDTkA05G405170
OH-1004 IDLXL04_021545
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.702 / OH-1004 62.466
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G405170
位置Chr05:100776930-100784635 (+)
描述Similar to XPO1: Protein EXPORTIN 1A
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g17020 富含亮氨酸的核输出信号 的受体。
Nuclear export of proteins in plants: AtXPO1 is the export receptor for leucine-rich nuclear export signals in Arabidopsis thaliana.1999 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.1999.00644.x
Exportin1 genes are essential for development and function of the gametophytes in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.1534/genetics.108.094896
Isolation and characterization of the Arabidopsis heat-intolerant 2 (hit2) mutant reveal the essential role of the nuclear export receptor EXPORTIN1A (XPO1A) in plant heat tolerance.2010 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2010.03225.x
At3g03110 富含亮氨酸的核输出信号 (NES) 的受体。
Exportin1 genes are essential for development and function of the gametophytes in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.1534/genetics.108.094896

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021545 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000054 ribosomal subunit export from nucleus 生物过程
GO:0000055 ribosomal large subunit export from nucleus 生物过程
GO:0000056 ribosomal small subunit export from nucleus 生物过程
GO:0000122 negative regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0006406 mRNA export from nucleus 生物过程
GO:0006611 protein export from nucleus 生物过程
GO:0006913 nucleocytoplasmic transport 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009410 response to xenobiotic stimulus 生物过程
GO:0009553 embryo sac development 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009846 pollen germination 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G03110
ath:AT5G17020
hsa:7514
mmu:103573
rno:85252
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.586
排名 1 · TkA05G405170 · TK1151
细胞质0.562
排名 2 · TkA05G405170 · TK1151
高尔基体0.081
排名 3 · TkA05G405170 · TK1151
溶酶体／液泡0.063
排名 4 · TkA05G405170 · TK1151
细胞膜0.057
排名 5 · TkA05G405170 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08389Xpo123-166 aa
PF24356WHD_PARP1290-122 aa
PF30117MSD5167-224 aa
PF18777CRM1_repeat245-280 aa
PF08389Xpo1246-276 aa
PF18784CRM1_repeat_2317-384 aa
PF01602Adaptin_N345-507 aa
PF18787CRM1_repeat_3397-447 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G405170PF08389Xpo1231663.5e-44151.2
TkA05G405170PF24356WHD_PARP12901220.3611.5
TkA05G405170PF30117MSD51672240.07514.0
TkA05G405170PF18777CRM1_repeat2452809.9e-1864.2
TkA05G405170PF08389Xpo12462763.5e-44151.2
TkA05G405170PF18784CRM1_repeat_23173843.1e-31107.6
TkA05G405170PF01602Adaptin_N3455070.0007918.8
TkA05G405170PF18787CRM1_repeat_33974471.2e-2796.3
TkA05G405170PF11865mTOR_dom4175040.01216.3
TkA05G405170PF24356WHD_PARP124544670.3611.5
TkA05G405170PF08767CRM1_C4614999.2e-1245.5
TkA05G405170PF18787CRM1_repeat_34724861.2e-2796.3
TkA05G405170PF24356WHD_PARP124955180.3611.5
TkA05G405170PF08389Xpo15005373.5e-44151.2
TkA05G405170PF11865mTOR_dom5565720.01216.3
TkA05G405170PF11865mTOR_dom5946310.01216.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SMV6拟南芥sp|Q9SMV6|XPO1A_ARATH Protein EXPORTIN 1A85.500%Swiss-Prot高置信
F4IZR5拟南芥sp|F4IZR5|XPO1B_ARATH Protein EXPORTIN 1B82.000%Swiss-Prot高置信

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