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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G395830
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 98384601-98388159 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2849 bp · TkA05G395830|TK1151|cDNA

GTGGCGGTGGTTAATCATCAACAGCTCTGTTTTTCATGCAGGCGTGGGCATAAATGCAGGAGTTTTGCCATTAGTTATCCTTCTCTTTCGATTATACTACTGATCTTTGAATCTTTGTGGGGTTTGAGTGTCTTCGATATATTGAGGGTTTATTTGAATCAAATTGAAGAAAAAGATTTGGGTTTTTTATTTTATTTGATTCGTCTTCAAGTGGGCAGTGAAGAGCAGTACCAAAAGTTGCTCAGATTCTCTGAATTGGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1398 bp · TkA05G395830|TK1151|CDS

ATGGCTGGGGAGAATGAAATCGAGGGGAGAAACAGAAATGGTGAACAAATGCATTACAGTTCCACCAATTTATCCTCCGATTGGCCGTTCAACGGCTCCAATGATCTGACAAACACATCTCCCACCATTTGGGATCATAATCCCACAAATTCACAACATTTAGGAGCTTTCTGCGATGTGAATTTGCAAAACAACGCGACCACTTCATCATCCGCCCTTGGGTTCCGTAAAGGAAATCATATCGCCCCTTCGTCTTGGTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

465 aa · TkA05G395830|TK1151|PROTEIN

MAGENEIEGRNRNGEQMHYSSTNLSSDWPFNGSNDLTNTSPTIWDHNPTNSQHLGAFCDVNLQNNATTSSSALGFRKGNHIAPSSWSPPNSAVKRGGVFLPPPPAATSTMLPHTLSQFPADSGFIERAARLSSFSAGNFEDMMNPFGNVPESSLSPYSNRPVQGQPQDGFVNVIKSTSGEGSKDTPPPVDYETNDGSQPKHDARQGGSGFSGNNLPGEAEYSEGGQDETSNEGFGSKKRRRSDQDTDYNQVKRSSQTPNE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G395830
TK1151 IDTkA05G395830
OH-1004 IDLXL04_021445
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.710 / OH-1004 92.727
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G395830
位置Chr05:98384601-98388159 (-)
描述Similar to BHLH49: Transcription factor bHLH49
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g68920 参与细胞伸长的转录激活剂。 暂无已核实直接文献
At1g26260 参与细胞伸长的转录激活剂。
Multiple bHLH proteins form heterodimers to mediate CRY2-dependent regulation of flowering-time in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1003861
At1g10120 参与细胞伸长的转录激活剂。
Multiple bHLH proteins form heterodimers to mediate CRY2-dependent regulation of flowering-time in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1003861
At3g07340 转录因子 bHLH62。 暂无已核实直接文献
At4g34530 转录因子，可结合 DNA 中的 G 盒 5'-CACGTG-3'，在体外也能在较低程度上结合 E 盒 5'-CANNTG-3'。
Photoexcited CRY2 interacts with CIB1 to regulate transcription and floral initiation in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1126/science.1163927
Multiple bHLH proteins form heterodimers to mediate CRY2-dependent regulation of flowering-time in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1003861

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B8AH97 与BCL1共同作用，通过增加赤霉素（GA）生物合成，至少部分地作为细胞伸长的正调节因子。 暂无已核实直接文献
Os02g0705500 与BCL1共同作用，通过增加赤霉素（GA）生物合成，至少部分地作为细胞伸长的正调节因子。
Modulation of Rice Leaf Angle and Grain Size by Expressing OsBCL1 and OsBCL2 under the Control of OsBUL1 Promoter.2021 · DOI: 10.3390/ijms22157792
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021445 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009637 response to blue light 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0009911 positive regulation of flower development 生物过程
GO:0045824 negative regulation of innate immune response 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
GO:0046983 protein dimerization activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G10120
ath:AT1G26260
ath:AT1G68920
ath:AT3G07340
ath:AT4G34530
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.972
排名 1 · TkA05G395830 · TK1151
细胞质0.096
排名 2 · TkA05G395830 · TK1151
细胞膜0.029
排名 3 · TkA05G395830 · TK1151
内质网0.015
排名 4 · TkA05G395830 · TK1151
质体0.012
排名 5 · TkA05G395830 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02939UcrQ153-180 aa
PF19424UNC80228-313 aa
PF00010HLH314-362 aa
PF23177bHLH_IRO3314-369 aa
PF23173bHLH_SAC51320-364 aa
PF23174bHLH_ILI325-375 aa
PF11351GTA_holin_3TM360-426 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G395830PF02939UcrQ1531800.1912.4
TkA05G395830PF19424UNC802283139.15.4
TkA05G395830PF00010HLH3143628.2e-0729.5
TkA05G395830PF23177bHLH_IRO33143690.0116.9
TkA05G395830PF23173bHLH_SAC513203642.8e-0627.9
TkA05G395830PF23174bHLH_ILI3253750.02715.6
TkA05G395830PF11351GTA_holin_3TM3604260.07114.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9CAA9拟南芥sp|Q9CAA9|BH049_ARATH Transcription factor bHLH4943.900%Swiss-Prot中等置信
Q9C670拟南芥sp|Q9C670|BH076_ARATH Transcription factor bHLH7648.600%Swiss-Prot中等置信
Q6NKN9拟南芥sp|Q6NKN9|BH074_ARATH Transcription factor bHLH7474.800%Swiss-Prot低置信
Q9SRT2拟南芥sp|Q9SRT2|BH062_ARATH Transcription factor bHLH6282.400%Swiss-Prot低置信
Q8GY61拟南芥sp|Q8GY61|BH063_ARATH Transcription factor bHLH6379.800%Swiss-Prot低置信
B8AH97水稻sp|B8AH97|BCL2_ORYSI Basic helix-loop-helix protein 7985.100%Swiss-Prot低置信
Q6Z2G7水稻sp|Q6Z2G7|BCL2_ORYSJ Basic helix-loop-helix protein 7985.100%Swiss-Prot低置信

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