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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G362060
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 89894036-89895972 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1785 bp · TkA05G362060|TK1151|cDNA

ATGGAAACCCTTAATCTTCTTGCAATAATATTCCTCTGTGTTCTCTGTTTCCAATCGGAAGTTTCCTTTTCCAACATCGACGCCGACAGAGACGCACTCATCAGATTCAGCTCCGCCGTAAATGGCAACACAATCCAGTGGAACATTTCCAACCCATCACCGTGTTCATGGAAAGGAGTCACATGCAGCACCACGATCAACCGCGTCGTTTCCCTCCGCCTCCCCGGCGCCGGACTCTCCGGGCAAATCCCACTAAACAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1785 bp · TkA05G362060|TK1151|CDS

ATGGAAACCCTTAATCTTCTTGCAATAATATTCCTCTGTGTTCTCTGTTTCCAATCGGAAGTTTCCTTTTCCAACATCGACGCCGACAGAGACGCACTCATCAGATTCAGCTCCGCCGTAAATGGCAACACAATCCAGTGGAACATTTCCAACCCATCACCGTGTTCATGGAAAGGAGTCACATGCAGCACCACGATCAACCGCGTCGTTTCCCTCCGCCTCCCCGGCGCCGGACTCTCCGGGCAAATCCCACTAAACAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

594 aa · TkA05G362060|TK1151|PROTEIN

METLNLLAIIFLCVLCFQSEVSFSNIDADRDALIRFSSAVNGNTIQWNISNPSPCSWKGVTCSTTINRVVSLRLPGAGLSGQIPLNTIGNLTRLRTLSLRGNLLSGEVPQDLEFCSELRILNLQNNRLSGEIPVTLFRLSNLTRLDISGNNFAGEISPSFSNLTRLTHLLLENNRFTGQIPEINTPFSQFNVSMNRLNGRIPTRLATFPSNAFTGNELCGTPLSSCPNGDKSNKLSAGAIAGIAIGSVLGSILIIAVVFY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G362060
TK1151 IDTkA05G362060
OH-1004 IDLXL04_021183
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)96.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G362060
位置Chr05:89894036-89895972 (+)
描述Similar to RKL1: Probable inactive receptor kinase At1g48480
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g48480 可能的非活性受体激酶 At1g48480。 暂无已核实直接文献
At3g02880 可能失活的受体激酶 At3g02880。 暂无已核实直接文献
At3g17840 可能不活跃的受体激酶 RLK902。 暂无已核实直接文献
At5g16590 可能参与生长促进真菌的早期识别。
A leucine-rich repeat protein is required for growth promotion and enhanced seed production mediated by the endophytic fungus Piriformospora indica in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03028.x
At2g26730 可能失活的受体激酶 At2g26730。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021183 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009610 response to symbiotic fungus 生物过程
GO:0022898 regulation of transmembrane transporter activity 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G48480
ath:AT2G26730
ath:AT3G02880
ath:AT3G17840
ath:AT5G16590
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.884
排名 1 · TkA05G362060 · TK1151
内质网0.075
排名 2 · TkA05G362060 · TK1151
细胞质0.068
排名 3 · TkA05G362060 · TK1151
细胞核0.050
排名 4 · TkA05G362060 · TK1151
溶酶体／液泡0.020
排名 5 · TkA05G362060 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF29525DEFL_2871-64 aa
PF08263LRRNT_227-63 aa
PF23211LRR_LRWD165-153 aa
PF29594LRR_SKP268-152 aa
PF23598LRR_1472-171 aa
PF12799LRR_485-104 aa
PF13855LRR_886-128 aa
PF25372LRR_FBXL1589-152 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G362060PF29525DEFL_2871640.01116.8
TkA05G362060PF08263LRRNT_227635e-1040.2
TkA05G362060PF23211LRR_LRWD1651530.000122.8
TkA05G362060PF29594LRR_SKP2681520.06113.3
TkA05G362060PF23598LRR_14721711.1e-0731.7
TkA05G362060PF12799LRR_4851041.3e-0938.7
TkA05G362060PF13855LRR_8861282.4e-0937.5
TkA05G362060PF25372LRR_FBXL15891520.04312.9
TkA05G362060PF12799LRR_4921291.3e-0938.7
TkA05G362060PF00560LRR_1931146.6e-1243.8
TkA05G362060PF13516LRR_6941020.4511.4
TkA05G362060PF24141LRR_ComC1152020.02415.1
TkA05G362060PF12799LRR_41171581.3e-0938.7
TkA05G362060PF13855LRR_81171762.4e-0937.5
TkA05G362060PF24758LRR_At5g563701171740.01715.5
TkA05G362060PF00560LRR_11181386.6e-1243.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LP77拟南芥sp|Q9LP77|Y1848_ARATH Probable inactive receptor kinase At1g4848050.200%Swiss-Prot高置信
Q9M8T0拟南芥sp|Q9M8T0|Y3288_ARATH Probable inactive receptor kinase At3g0288050.500%Swiss-Prot高置信
Q9LVI6拟南芥sp|Q9LVI6|RLK90_ARATH Probable inactive receptor kinase RLK90248.500%Swiss-Prot中等置信
Q9FMD7拟南芥sp|Q9FMD7|Y5659_ARATH Probable inactive receptor kinase At5g1659048.500%Swiss-Prot中等置信
O48788拟南芥sp|O48788|Y2267_ARATH Probable inactive receptor kinase At2g2673046.500%Swiss-Prot中等置信

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